| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | Xen14_17 | 79,802 | T→G | G156G (GGA→GGC) | Xen14_02064 ← | IS4 family transposase ISEc13 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | Xen14_17 | 79,802 | 0 | T | G | 91.6% | 11398.6 / inf | 4253 | G156G (GGA→GGC) | Xen14_02064 | IS4 family transposase ISEc13 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (149/208); new base G (2038/1847); total (2194/2059) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.05e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.72e-01 | |||||||||||
Only 100 of 4259 total aligned reads displayed.
CCCAGTTTCGCCAGTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGTAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCTCCCTGCCGCAGGCCCAGCACCCGCACCGCGATAACCACCATGCGCTCAAGGTTATCCCGGGTCTGCATTCGCAGCGATTCCACACATGTACCACCACTTTTCCACGCTTTGTGGTATTCCTCTATCAGCCAGCGTTGCTCGTAATGGCT > Xen14_17/79653‑79951 | cccAGTTTAGCCAGTTTCAAACAGGCCCATTTCAGGGTCGGTGTTTGCGCCGGAAGCTGCTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGTAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCt > 1:10857/1‑150 (MQ=255) tttCGCCAGGTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTg < 1:3118690/150‑1 (MQ=255) ttCGCCAGTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGc < 1:1314468/150‑1 (MQ=255) ttCGCCAGTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGc > 1:3468363/1‑150 (MQ=255) ttCGCCAGTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTATCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGc > 1:2965753/1‑150 (MQ=255) gCCAGTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACATCAGTTTCCACTCTGTCGGCATCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGc < 1:2115311/150‑1 (MQ=38) gCCAGTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCCCTGATACCGCCCTGCCGc > 1:377539/1‑150 (MQ=255) gCCAGTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGc > 1:3976736/1‑150 (MQ=255) gCCAGTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCATCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGc > 1:1625894/1‑150 (MQ=255) ccAGTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCa < 1:1189464/150‑1 (MQ=255) ccAGTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCa < 1:1393281/150‑1 (MQ=255) aGTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAgg < 1:4356350/150‑1 (MQ=255) gTTTCAGACATGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGc > 1:2492939/1‑150 (MQ=255) gTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGc < 1:52556/150‑1 (MQ=255) gTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGc < 1:1705454/150‑1 (MQ=255) gTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGc < 1:2237438/150‑1 (MQ=255) gTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGc > 1:1164664/1‑150 (MQ=255) gTTTCAAACAGGCCCATTTCAGGGTCGGTGTTTGCGCCGGAAGCTGCTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGTAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCTCCCTGCCGCAGGc > 1:3585747/1‑150 (MQ=255) tttCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGcc < 1:96172/150‑1 (MQ=255) aCAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGCCCAGCAc < 1:1547443/150‑1 (MQ=255) aGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGCCCAGCAccc < 1:71997/150‑1 (MQ=255) gCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGCCCAGCACCCGc > 1:2068098/1‑150 (MQ=255) cccACTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGTGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACATCAGTTTCCCCTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCCCAACCGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCACAGGCCCAGCACCCGCa > 1:2785611/1‑150 (MQ=255) ccATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGCCCAGCACCCGCAc < 1:2637978/150‑1 (MQ=255) tttCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGCCCAGCACCCGCACcgc > 1:2279831/1‑150 (MQ=255) tttCAGTGTCGGCATCTGGGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGTGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTTTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGCCCAGCACCCGCACcgc < 1:4201597/150‑1 (MQ=255) tCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGCCCAGCACCCGCACCGCGa < 1:568935/150‑1 (MQ=255) tCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGCCCAGCACCCGCACCGCGa > 1:1934247/1‑150 (MQ=255) cAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGCCCAGCACCCGCACCGCGAt < 1:1432513/150‑1 (MQ=255) cAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGCCCAGCACCCGCACCGCGAt < 1:3507270/150‑1 (MQ=255) gtCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaac < 1:1772875‑M2/150‑29 (MQ=255) cATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgcctt > 1:1590547‑M2/1‑117 (MQ=255) cATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgcctt > 1:3040505‑M2/1‑117 (MQ=255) cATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgcctt > 1:1507902‑M2/1‑117 (MQ=255) cTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgat < 1:483360‑M2/150‑37 (MQ=255) tgtgACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgata > 1:2020252‑M2/1‑113 (MQ=255) gtgACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACGGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTGACAGCTGTCGTTTTGTGTTTCTTTATTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataa < 1:2199346‑M2/150‑39 (MQ=255) aCGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataacca > 1:1045621‑M2/1‑109 (MQ=255) gAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccacca < 1:3249724‑M2/150‑45 (MQ=255) aGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCACTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatg < 1:3943048‑M2/150‑47 (MQ=255) cGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcg > 1:1223061‑M2/1‑102 (MQ=255) ttttCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctc > 1:1740312‑M2/1‑99 (MQ=255) tttCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcg < 1:3430058‑M2/150‑53 (MQ=255) ttccttccAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcga > 1:1000580‑M2/1‑97 (MQ=255) ttccttccAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgacaaccaccatgcgctcga > 1:3216235‑M2/1‑97 (MQ=255) ttccttccAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCATCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcga > 1:2567907‑M2/1‑97 (MQ=255) tccttccAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTTTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgag > 1:4251063‑M2/1‑96 (MQ=255) tccttccAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgag > 1:787278‑M2/1‑96 (MQ=255) tccttccAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTACTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgag > 1:688773‑M2/1‑96 (MQ=255) ccttccAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgagg > 1:4055348‑M2/1‑95 (MQ=255) cttccAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggt < 1:1473782‑M2/150‑57 (MQ=255) cAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatc > 1:857118‑M2/1‑90 (MQ=255) gCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatccc < 1:2526048‑M2/150‑63 (MQ=255) gCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCACTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgatcaacgccttgctaaccaccatg < 1:3844336‑M2/134‑47 (MQ=255) tAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccggg < 1:2899768‑M2/150‑66 (MQ=255) aCCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtc < 1:897944‑M2/150‑68 (MQ=255) cccACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCATCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtct < 1:3396173‑M2/150‑69 (MQ=255) ccACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCATCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctg < 1:197756‑M2/150‑70 (MQ=255) gcagtttCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattc < 1:752420‑M2/148‑75 (MQ=255) cagttTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcg > 1:2439089‑M2/2‑75 (MQ=255) cagttTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTCTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcg > 1:2322397‑M2/2‑75 (MQ=255) agtTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgc < 1:3543172‑M2/150‑77 (MQ=255) tttCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcag > 1:3315513‑M2/1‑72 (MQ=255) tttCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccacgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcag > 1:2400569‑M2/1‑72 (MQ=255) ttCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagc < 1:931645‑M2/150‑80 (MQ=255) ttCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgcctt < 1:2708916‑M2/104‑34 (MQ=255) ccACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCTCCCTGCCGCAGGCCCAGCACCCGCACCGCGATAACCACCATGCGCTCAAGGTTATCCCGGGTCTGCATTCGCAGCGATTCCACACATGt > 1:2593917/1‑150 (MQ=255) gTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcatgcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccaca > 1:2861440‑M2/1‑62 (MQ=255) tCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacac > 1:3742042‑M2/1‑61 (MQ=255) aGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtacca < 1:630113‑M2/150‑98 (MQ=255) aGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtacca < 1:1122405‑M2/150‑98 (MQ=255) tatttctCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccacca < 1:3628419‑M2/148‑101 (MQ=255) ttttCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCTCCCTGCCGCAGGCCCAGCACCCGCACCGCGATAACCACCATGCGCTCAAGGTTATCCCGGGTCTGCATTCGCAGCGATTCCACACATGTACCACCACTTTTCCACGCtt > 1:1348385/1‑150 (MQ=255) tttCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccaaacatgtaccaccacc < 1:3897922‑M2/150‑103 (MQ=255) ttCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacatatgtaccaccactt < 1:819941‑M2/150‑104 (MQ=255) ttCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttat > 1:2745781‑M2/1‑47 (MQ=255) tcctcacAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccactt < 1:1802477‑M2/148‑104 (MQ=255) tctcACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttt > 1:282563‑M2/1‑46 (MQ=255) tcACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttc > 1:366815‑M2/1‑44 (MQ=255) tcACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttc > 1:2158566‑M2/1‑44 (MQ=255) cacaGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttcc > 1:235297‑M2/1‑43 (MQ=255) tGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgcctt < 1:3005874‑M2/150‑114 (MQ=255) tGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccacgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgcct < 1:4015023‑M2/150‑114 (MQ=255) cttttgTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtg > 1:189251‑M2/2‑33 (MQ=255) ttttGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagtgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtgg > 1:1269677‑M2/1‑32 (MQ=255) ttGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccaaacatgtaccaccacttttccacgccttgtggta < 1:3160182‑M2/150‑121 (MQ=255) gtgtTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgctttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggtatt > 1:3079158‑M2/1‑28 (MQ=255) tgtTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggtattc < 1:1848791‑M2/150‑124 (MQ=255) gtTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggtattcc < 1:4153392‑M2/150‑125 (MQ=255) ttcttcACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggtattcctc > 1:447012‑M2/1‑24 (MQ=255) cttcACTGATACCTCCCTGCCGCAGGCCCAGCACCCGCACCGCGATAACCACCATGCGCTCAAGGTTATCCCGGGTCTGCATTCGCAGCGATTCCACACATGTACCACCACTTTTCCACGCTTTGTGGTATTCCTCTATCAGCCAGCGtt > 1:3356045/1‑150 (MQ=255) cttcACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggtgttcctcta < 1:2674305‑M2/150‑129 (MQ=255) cttcACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggta < 1:3283051‑M2/142‑121 (MQ=255) tcACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggtattcctctatc < 1:1665967‑M2/150‑131 (MQ=255) cACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggtattcctctatca < 1:2931344‑M2/150‑132 (MQ=255) cACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacgtttccacgccttgtggtattccgctatca > 1:595198‑M2/1‑19 (MQ=255) aCTGATACCTCCCTGCCGCAGGCCCAGCACCCGCACCGCGATAACCACCATGCGCTCAAGGTTATCCCGGGTCTGCATTCGCAGCGATTCCACACATGTACCACCACTTTTCCACGCTTTGTGGTATTCCTCTATCAGCCAGCGTTGCTc < 1:4105333/150‑1 (MQ=255) aCTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggtattcctctatcag > 1:3816721‑M2/1‑18 (MQ=255) tGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggtattcctctatcagcc > 1:3189403‑M2/1‑16 (MQ=255) gATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataacccccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtnccacaacttttccacgccttgtggtattcctctatcagcca < 1:3700843‑M2/150‑136 (MQ=255) | CCCAGTTTCGCCAGTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGTAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCTCCCTGCCGCAGGCCCAGCACCCGCACCGCGATAACCACCATGCGCTCAAGGTTATCCCGGGTCTGCATTCGCAGCGATTCCACACATGTACCACCACTTTTCCACGCTTTGTGGTATTCCTCTATCAGCCAGCGTTGCTCGTAATGGCT > Xen14_17/79653‑79951 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |