| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_163 | = 753 | 0 (0.000) | 72 (0.350) | 57/294 | 1.0 | 49.1% | intergenic (‑125/–) | ompX_3/– | Outer membrane protein X/– |
| ? | Xen14_170 | = 168 | 149 (1.010) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
CAATCCGTGGTAAATGTTCTTCAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAAGCTGATTTCATTCGCTACGAACGCCCTGTTCCCGGTGATCGGGTTCAGATGGATACCTGTTAAATTGGCCCCGGCTTATATCAGTACACATCTG > Xen14_170/20‑315 | caATCCGTGGTAAATGTTCTTCAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCNGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTACTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACAGTTCAGATGAGGCGCTTAc < 1:3908188/150‑1 (MQ=255)caATCCGTGGTAAATGTTCTTCAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGATGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAc < 1:1788913/150‑1 (MQ=255) aaTCCGTGGTAAATGTTCTTCAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcc < 1:3269523/150‑1 (MQ=255) gTGGTAAATGTTCTTCAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgt < 1:4083299‑M2/150‑8 (MQ=255) ggTAAATGTTCTTCAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtac < 1:4147396‑M2/150‑10 (MQ=255) gTAAATGTTCTTCAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacg < 1:2224277‑M2/150‑11 (MQ=255) tAAATTTTTTTCAAAGTGAAGACGGAAAGCTTCGGTGGTCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCtt < 1:2199033/150‑1 (MQ=21) aTGTTCTTCAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATANGATAGTGTCCATTAAAAATGATGTACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGc < 1:3930967/150‑1 (MQ=255) cttcAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtg < 1:3277927‑M2/150‑20 (MQ=255) cttcAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtg > 1:2371759‑M2/1‑131 (MQ=255) cttcAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCCGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGaa > 1:1733044/1‑150 (MQ=255) ttcAAAGTGAGGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAAt > 1:3317452/1‑150 (MQ=255) ttcAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAAt > 1:1433689/1‑150 (MQ=255) tcAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGTTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATc > 1:568055/1‑150 (MQ=255) aaaGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactatacggtgattgtgacca < 1:2272548‑M2/150‑24 (MQ=255) aaGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgaccaa < 1:833028‑M2/150‑25 (MQ=255) aaGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAgg < 1:2602473/150‑1 (MQ=255) aGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGt < 1:930952/150‑1 (MQ=255) tGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCTGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcg > 1:3845282‑M2/1‑123 (MQ=255) aaGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTaaa < 1:1579413/150‑1 (MQ=255) aaGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTaaa < 1:1579415/150‑1 (MQ=255) aaGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTaaa > 1:573218/1‑150 (MQ=255) gACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAAcc < 1:1526015/150‑1 (MQ=255) 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ttCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTaaa > 1:1298667/1‑150 (MQ=255) tCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAAt > 1:1228335/1‑150 (MQ=255) cGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAAtt < 1:2504431/150‑1 (MQ=255) cGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAAtt < 1:2504429/150‑1 (MQ=255) aGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGa < 1:2307496/150‑1 (MQ=255) aGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGa < 1:2307492/150‑1 (MQ=255) ggTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGaa > 1:2064079/1‑150 (MQ=255) gTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAAg > 1:320895/1‑150 (MQ=255) ccGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgaccaaaaaagcggcttccggcatcagtattcgttgaa > 1:3190983‑M2/1‑94 (MQ=255) atatTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAAGCTGAt < 1:3579278/150‑1 (MQ=255) atatTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGAACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAAGCTGAt < 1:601289/150‑1 (MQ=255) tatTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAAGCTGAtt < 1:217196/150‑1 (MQ=255) atTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAAGCTGAttt > 1:1753980/1‑150 (MQ=255) ttCCAGACGATAGTGTCCATGAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTAAGAGGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgggaccaaaaaagcggcttccggcatcagtattcgttgaaatattt > 1:4425268‑M2/1‑88 (MQ=255) tCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgaccaaaaaagcggcttccggcatcagtattcgttgaaatattta < 1:2022385‑M2/150‑64 (MQ=255) 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cagaccagacGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAGGCTGATTTCATTCGCTACGAACGCCCTGTTCCCGGTGATCGGGTTCAGATGGATACCTGTTAAATTgg < 1:248830/150‑1 (MQ=255) agaccagacGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAAGCTGATTTCATTCGCTACGAACGCCCTATTCCCGGTGATCGGGTTCAGATGGATACCTGTTAAATTGGc < 1:1167680/150‑1 (MQ=255) accagacGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgaccaaaaaagcggcttccggcatcagtattcgttgaaatatttataaccccaataaatggcgtcaggaatgacgccttttttattgcagaaaagcgagaggtaat > 1:2750117‑M2/1‑26 (MQ=255) ccagacGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAAGCTGATTTCATTCGCTACGAACGCCCTGTTCCCGGTGATCGGGTTCAGATGGATACCTGTTAAATTGGcccc > 1:7733/1‑150 (MQ=255) cagacGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgaccaaaaaagcggcttccggcatcagtattcgttgaaatatttataaccccaataaatggcgtcaggaatgacgccttttttattgcagaaaagcgagaggtaatta > 1:3113055‑M2/1‑24 (MQ=255) cagacGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgaccaaaaaagcggcttccggcatcagtattcgttgaaatatttataaccccaataaatggcgtcaggaatgacgccttttttattgcagaaaagcgagaggtaatta > 1:3012587‑M2/1‑24 (MQ=255) gTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAAGCTGATTTCATTCGCTACGAACGCCCTGTTCCCGGTGATCGGGTTCAGATGGATACCTGTTaaa < 1:648926/135‑1 (MQ=255) gTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAAGCTGATTTCATTCGCTACGAACGCCCTGTTCCCGGTGATCGGGTTCAGATGGATACCTGTTAAATTGGCCCCGGCTtat > 1:645981/1‑150 (MQ=255) cAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgaccaaaaaagcggcttccggcatcattattcgttgaaatatttataaccccaataaatggcgtcaggaatgacgccttttttattgcagaaaagcgagaggtaattatgcgtaaag > 1:1380454‑M2/1‑15 (MQ=255) gATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAAGCTGATTTCATTCGCTACGAACGCCCTGTTCCCGGTGATCGGGTTCAGATGGATACCTGTTAAATTGGCCCCGGCTTATATCAg < 1:1508376/150‑1 (MQ=255) 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gcTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAAGCTGATTTCATTCGCTACGAACGCCCTGTTCCCGTTGATCGGGTTCAGATGGATACCTGCTAAATTGGCCCCGGCTTATATCAGTACACATc < 1:4379728/150‑1 (MQ=255) ttAcgactgtacggtgattgtgaccaaaaaagcggcttccggcatcagtattcgttgaaatatttataaccccaataaatggcgtcaggaatgacgccttttttattgcagaaaagcgagaggtaattatgcgtaaagtttgtgcagcca < 1:1950959‑M2/150‑148 (MQ=255) | CAATCCGTGGTAAATGTTCTTCAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAAGCTGATTTCATTCGCTACGAACGCCCTGTTCCCGGTGATCGGGTTCAGATGGATACCTGTTAAATTGGCCCCGGCTTATATCAGTACACATCTG > Xen14_170/20‑315 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |