| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ? | Xen14_96 | = 5300 | 75 (0.590) | coding (8/1782 nt) | Xen14_04570 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 283 total aligned reads displayed.
GCTCTCCTTCAATAGCCACCGCCTGCATCAGTGTGTACGGCGTAATGGCAACCGGTCCGCCGTATGGCTGCCAGCCCTCTTTCAGTTTGTGTGTCAGCTTTTCCGCAAGGTCTGACGGCGACGCCGCCCTGACAACATCATAGTGTTTAAATGCCATGAATCCTCCCGGCCGGGATAATATTGTGAGTAAAATGAGGAGCGGGCTGAAGTCCGGAAGTTACAGGACAATGGCAGAAGAGAGACAACAGCCCGCAATACGAAAAAGGCCGCGCTATTGCGCAGAGTGATTACTGTCGGAT > Xen14_96/5151‑5449 | gCTCTCCTTCAATAGCCACCGCCTGCATCAGTGTGTACGGCGTAATGGCAACCGGTCCGCCGTATGGCTGCCAGCCCTCTTTCAGTTTGTGTGTCAGCTTTTCCGCAAGGTCTGACGGCGACGCCGCCCTGACAACATCGTAATGTTTaa > 1:1149511/1‑150 (MQ=255) ctctCCTTCAATAGCCACCGCCTGCATCAGTGTGTACGGCGTAATAGCAACCGGTCCGCCGTATGGCTGCCAGCCCTCTTTCAGTTTGTGTGTCAGCTTTTCCGCAAGGTCTGACGGCGACGCCGCCCTGACAACATCATAGTGTTTaaa > 1:8598/1‑150 (MQ=255) tctcCTTCAATAGCCACCGCCTGCATCAGTGTGTACGGCGTAATGGCAACCGGTCCGCCGTATGGCTGCCAGCCCTCTTTCAGTTTGTGTGTCAGCTTTTCCGCAAGGTCTGACGGCGACGCCGCCCTGACAACATCGTAATGTTTAAtc < 1:2068099‑M2/150‑3 (MQ=255) ctcCTTCAATAGCCACCGCCTGCATCAGTGTGTACGGCGTAATGGCAACCGGTCCGCCGTATGGCTGCCAGCCCTCTTTCAGTTTGTGTGTCAGCTTTTCCGCAAGGTCTGACGGCGACGCCGCCCTGACAACATCGTAATGTTTAAtcg < 1:699344‑M2/150‑4 (MQ=255) tcCTTCAATAGCCACCGCCTGCATCAGTGTGTACGGCGTAATGGCAACCGGTCCGCCGTATGGCTGCCAGCCCTCTTTCAGTTTGTGTGTCAGCTTTTCCGCAAGGTCTGACGGCGACGCCGCCCTGACAACATCATAGTGTTTAAATGc < 1:413282/150‑1 (MQ=255) ttCAATAGCCACCGCCTGCATCAGTGTGTACGGCGTAATGGCAACCGGTCCGCCGTATGGCTGCCAGCCCTCTTTCAGTTTGTGTGTCAGCTTTTCCGCAAGGTCTGACGGCGACGCCGCCCTGACAACATCGTAATGTTTAAtcgacat < 1:2822816‑M2/150‑8 (MQ=255) gCCACCGCCTGCATCAGTGTGTACGGCGTAATGGCAACCGGTCCGCCGTATGGCTGCCAGCCCTCTTTCAGTTTGTGTGTCAGCTTTTCCGCAAGGTCTGACGGCGACGCCGCCCTGACAACATCGTAATGTTTAAtcgacatcgaattt < 1:2995764‑M2/150‑15 (MQ=255) gCCACCGCCTGCATCAGTGTGTACGGCGTAATGGCAACCGGTCCGCCGTATGGCTGCCAGCCCTCTTTCAGTTTGTGTGTCAGCTTTTCCGCAAGGTCTGACGGCGACGCCGCCCTGACAACATCGTAATGTTTAAtcgacatcgaattt > 1:2012468‑M2/1‑136 (MQ=255) ccTGCATCAGTGTGTACGGCGTAATGGCAACCGGTCCGCCGTATGGCTGCCAGCCCTCTTTCAGTTTGTGTGTCAGCTTTTCCGCAAGGTCTGACGGCGACGCCGCCCTGACAACATCATAGTGTTTAAATGCCATGAATCCTCccggcc > 1:817715/1‑150 (MQ=255) cTGCATCAGTGTGTACGGCGTAATGGCAACCGGTCCGCCGTATGGCTGCCAGCCCTCTTTCAGTTTGTGTGTCAGCTTTTCCGCAAGGTCTGACGGCGACGCCGCCCTGACAACATCGTAATGTTTAAtcgacatcgaatttctcccgtg > 1:4064007‑M2/1‑128 (MQ=255) tgtACGGCGTAATGGCAACCGGTCCGCCGTATGGCTGCCAGCCCTCTTTCAGTTTGTGTGTCAGCTTTTCCGCAAGGTCTGACGGCGACGCCGCCCTGACAACATCGTAATGTTTAAtcgacatcgaatttctcccgtgtagaggaacag > 1:3712074‑M2/1‑117 (MQ=255) tgtACGGCGTAATGGCAACCGGTCCGCCGTATGGCTGCCAGCCCTCTTTCAGTTTGTGTGTCAGCTTTTCCGCAAGGTCTGACGGCGACGCCGCCCTGACAACATCATAGTGTTTAAATGCCATGAATCCTCCCGGCCGGGATAATATtg > 1:2301607/1‑150 (MQ=255) gtACGGCGTAATGGCAACCGGTCCGCCGTATGGCTGCCAGCCCTCTTTCAGTTTGTGTGTCAGCTTTTCCGCAAGGTCTGACGGCGACGCCGCCCTGACAACATCGTAATGTTTAAtcgacatcgaatttctcccgtgtagaggaacaga < 1:380825‑M2/150‑35 (MQ=255) 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tATGGCTGCCAGCCCTCTTTCAGTTTGTGTGTCAGCTTTTCCGCAAGGTCTGACGGCGACGCCGCCCTGACAACATCGTAATGTTTAAtcgacatcgaatttctcccgtgtagaggaacagagttaaaaagccggaagcggaatcaaatc > 1:4098102‑M2/1‑88 (MQ=255) aacggctgCCAGCCCTCTTTCAGTTTATGTGTCAGCTTTTCCGCAAGATCTGACGGCGACGCCGCCCTGACAACATCATAGTGTTTAAATGCCATGgttctttccaccatctgaaaaataattctttaaaatacctgacatgtaatacag > 1:648119‑M2/4‑96 (MQ=255) acggctGCCAGCCCTCTTTCAGTTTATGTGTCAGCTTTTCCGCAAGATCTGACGGCGACGCCGCCCTGACAACATCATAGTGTTTAAATGCCATGgttctttccaccatctgaaaaataattctttaaaatacctgacacgtaatacaga < 1:1674403‑M2/148‑56 (MQ=255) ggCTGCCAGCCCTCTTTCAGTTTGTGTGTCAGCTTTTCCGCAAGGTCTGACGGCGACGCCGCCCTGACAACATCATAGTGTTTAAATGCCATGAATCCTCCCGGCCGGGATAATATTGTGAGTAAAATGAGGAGCGGGCTGAAGTCCGGa > 1:3955812/1‑150 (MQ=255) ggCTGCCAGCCCTCTTTCAGTTTGTGTGTCAGCTTTTCCGCAAGGTCTGACGGCGACGCCGCCCTGACAACATCATAGTGTTTAAATGCCATGAATCCTCCCGGCCGGGATAATATTGTGAGTAAAATGAGGAGCGGGCTGAAGTCCGGa > 1:1546730/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |