| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_145 | 1 = | 0 (0.000) | 61 (0.190) | 41/212 | 2.4 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | Xen14_85 | = 11155 | 0 (0.000) | intergenic (+105/–) | Xen14_04471/– | hypothetical protein/– | |||||
GCGGCATCTGATTATGCATTAAAAATAAATGAAAACTCTGATTAAGACGGGGGTAGCTGATAATAAGACAATCAATGACAGATATTAATGAATAAACATAATCAGGCGCTCAATACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCGGATAAGTAAGGGGAGATTGCACTATGCAAATGCAGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATCTG > Xen14_85/11006‑11197 | gcggcATCTGATTATGCATTAAAAATAAATGAAAACTCTGATTAAGACGGGGGTAGCTGATAATAAGACAATCAATGACAGATATTAATGAATAAACATAATCAGGCGCTCAATACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTcc > 1:886862/1‑150 (MQ=255)gcggcATCTGATTATGCATTAAAAATAAATGAAAACTCTGATTAAGACGGGGGTAGCTGATAATAAGACAATCAATGACAGATATTAATGAATAAACATAATCAGGCGCTCAATACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTcc > 1:1318204/1‑150 (MQ=255)gcggcATCTGATTATGCATTAAAAATAAATGAAAACTCTGATTAAGACGGGGGTAGCCGATAATAAGACAATCAATGACAGATATTAATGAATAAACATAATCAGGCGCTCAACACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTcc < 1:960107/150‑1 (MQ=255) gcATCTGATTATGCATTAAAAATAAATGAAAACTCTGATTAAGACGGGGGTAGCTGATAATAAGACAATCAATGACAGATATTAATGAATAAACATAATCAGGCGCTCAATACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCGGa < 1:3249071/150‑1 (MQ=255) gcATCTGATTATGCATTAAAAATAAATGAAAACTCTGATTAAGACGGGGGTAGCTGATAATAAGACAATCAATGACAGATATTAATGAATAAACATAATCAGGCGCTCAATACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCGGa < 1:3940168/150‑1 (MQ=255) cATCTGATTATGCATTAAAAATAAATGAAAACTCTGATTAAGACGGGGGTAGCTGATAATAAGACAATCAATGACAGATATTAATGAATAAACATAATCAGGCGCTCAATACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCGGAt < 1:4178728/150‑1 (MQ=255) aTCTGATTATGCATTAAAAATAAATGAAAACTCTGATTAAGACGGGGGTAGCTGATAATAAGACAATCAATGACAGATATTAATGAATAAACATAATCAGGCGCTCAATACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCGGAta > 1:1140487/1‑150 (MQ=255) aTCTGATTATGCATTAAAAATAAATGAAAACTCTGATTAAGACGGGGGTAGCTGATAATAAGACAATCAATGACAGATATTAATGAATAAACATAATCAGGCGCTCAATACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCGGAta > 1:1140488/1‑150 (MQ=255) aTTATGCATTAAAAATAAATGAAAACTCTGATTAAGACGGGGGTAGCTGATAATAAGACAATCAATGACAGATATTAATGAATAAACATAATCAGGCGCTCAATACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCGGAtaagtaa > 1:3909248/1‑150 (MQ=255) 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tctGATTAAGACGGGGGTAGCTGGGAATAAGACAATCAATGACAGATATTAGTGAATAAACATAATCAGGCGCTCAATACTGTGGAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCGGATAAGTAAGGGGAGATTGCACTATGCAAATgcag < 1:3851589/150‑1 (MQ=25) ctGATTAAGACGGGGGTAGCTGATAATAAGACAATCAATGACAGATATTAATGAATAAACATAATCAGGCGCTCAATACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCGGATAAGTAAGGGGAGATTGCACTATGCAAATgcagc > 1:1375778/1‑150 (MQ=255) gggTGGCTGATAATAAGACAATCAATGACAGATATGAAGGAATAAACATAATCATGCGCTCAATACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCggataagtaaggggagattgcactatgcaaatgcagcatctgatggttgg > 1:2786349‑M2/1‑100 (MQ=255) ggTAGCTGATAATAAGACAATCAATGACAGATATTAATGAATAAACATAATCAGGCGCTCAATACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCggataagtaaggggagattgcactatgcaaatgcagcatctgatggttggc < 1:1203032‑M2/150‑52 (MQ=255) gTAGCTGATAATAAGACAATCAATGACAGATATTAATGAATAAACATAATCAGGCGCTCAATACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCggataagtaaggggagattgcactatgcaaatgcagcatctgatggttggct < 1:2655100‑M2/150‑53 (MQ=255) gTAGCTGATAATAAGACAATCAATGACAGATATTAATGAATAAACATAATCAGGCGCTCAATACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCggataagtaaggggagattgcactatgcaaatgcagcatctgatggttggct < 1:2655101‑M2/150‑53 (MQ=255) gCTGATAATAAGACAATCAATGACAGATATTAATGAATAAACATAATCAGGCGCTCAATACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCggataagtaaggggagattgcactatgcaaatgcagcatctgatggttggctatc > 1:1739688‑M2/1‑95 (MQ=255) cTGATAATAAGACAATCAATGACAGATATTAATGAATAAACATAATCAGGCGCTCAATACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCggataagtaaggggagattgcactatgcaaatgcagcatctgatggttggctatcc < 1:3051645‑M2/150‑57 (MQ=255) cTGATAATAAGACAATCAATGACAGATATTAATGAATAAACATAATCAGGCGCTCAATACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCggataagtaaggggagattgcactatgcaaatgcagcatctgatggttggctatcc > 1:586527‑M2/1‑94 (MQ=255) cTGATAATAAGACAATCAATGACAGATATTAATGAATAAACATAATCAGGCGCTCAATACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCggataagtaaggggagattgcactatgcaaatgcagcatctgatggttggctatcc > 1:586525‑M2/1‑94 (MQ=255) 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> Xen14_85/11006‑11197 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |