| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_145 | 1 = | 0 (0.000) | 36 (0.130) | 27/210 | 0.7 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | Xen14_32 | = 55348 | 0 (0.000) | intergenic (+261/–) | Xen14_03070/– | hypothetical protein/– | |||||
ACCGCAGTTCGTAGAGCGATTGTCGGGTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGCGCTTCATAGCCTTTCTCCTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCGGATAAGTAAGGGGAGATTGCACTATGCAAATGCAGCATCTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_32/55212‑55391 | aCCGCAGTTCGTAGAGCGATTGTCGGGTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGCGCTTCATAGCCTTTCTCCTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCGGATAAGTAAggg > 1:1253502/1‑150 (MQ=255) cGCAGTTCGTAGAGCGATTGTCGGGTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGCGCTTCATAGCCTTTCTCCTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCGGATAAGTAAGGGga < 1:4004704/150‑1 (MQ=255) aGTTCGTAGAGCGATTGTCGGGTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGGTAATGAGCAGACACACCACCAGAGCGCTTCATAGCCTTTCTCCTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCGGATAAGTAAGGGGAGAt < 1:627707/150‑1 (MQ=255) aGTTCGTAGAGCGATTGTCGGGTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGGAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGCGCTTCATAGCCTTTCTCCTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCGGATAAGTAAGGGGAGAt < 1:3683571/150‑1 (MQ=255) gTTCGTAGAGCGATTGTCGGGTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGCGCTTCATAGCCTTTCTCCTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCGGATAAGTAAGGGGAGAtt > 1:1523692/1‑150 (MQ=255) gTTCGTAGAGCGATTGTCGGGTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGCGCTTCATAGCCTTTCTCCTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCGGATAAGTAAGGGGAGAtt > 1:1523693/1‑150 (MQ=255) ttCGTAGAGCGATTGTCGGGTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGCGCTTCATAGCCTTTCTCCTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCGGATAAGTAAGGGGAGATTg > 1:3804444/1‑150 (MQ=255) tCGTAGAGCGATTGTCGGGTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGCGCTTCATAGCCTTTCTCCTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCGGATAAGTAAGGGGAGATTGc < 1:3928694/150‑1 (MQ=255) agCGATTGTCGGGTCAGGAGTGTGAATGTCAGAATCGTAATGCAGATAATGAGCAGACACACCACCAGAGCGCTTCATAGCCTTTCTCCTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCGGATAAGTAAGGGGAGATTGCACTATg > 1:4042756/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |