| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_141 | 1 = | 0 (0.000) | 44 (0.050) +GCTCTCC |
30/282 | 1.1 | 100% | intergenic (–/‑23) | –/Xen14_04755 | –/hypothetical protein |
| ? | Xen14_39 | = 48485 | 0 (0.000) | intergenic (‑47/–) | Xen14_03386/– | hypothetical protein/– | |||||
CATATCGAGTTGGTGATTTATCAGTTTTTCGTTAAGCACTGCACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_39/48337‑48485 | cATATCGAGTTGGTGATTTATCAGTTTTTCGTTAAGCACTGCACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAg > 1:3717786‑M2/1‑149 (MQ=255) atatCGAGTTGGTGATTTATCAGTTTTTCGTTAAGCACTGCACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAgg > 1:786935‑M2/1‑148 (MQ=255) tatCGAGTTGGTGATTTATCAGTTTTTCGTTAAGCACTGCACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAgga > 1:586138‑M2/1‑147 (MQ=255) tatCGAGTTGGTGATTTATCAGTTTTTCGTTAAGCACTGCACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAgga < 1:1978216‑M2/150‑4 (MQ=255) tatCGAATTGGTGATTTATCAGTTTTTCGTTAAGCACTGCACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAgga > 1:586137‑M2/1‑147 (MQ=255) aattggTGATTTATCAGTTTTTCGTTAAGCACTGCACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACATCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagct > 1:3073491‑M2/3‑142 (MQ=255) aGTTGGTGATTTATCAGTTTTTCGTTAAGCACTGCACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACATCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagct > 1:3073490‑M2/1‑142 (MQ=255) gTTGGTGATTTATCAGTTTTTCGTTAAGCACTGCACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagctt < 1:2514031‑M2/150‑10 (MQ=255) tGGTGATTTATCAGTTTTTCGTTAAGCACTGCACCGCTATTTTCGGGAAGAGAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGAATCAggagagcagat > 1:2215397‑M2/1‑139 (MQ=255) gTGATTTATCAGTTTTTCGTTAAGCACTGCACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCATGAAATCAGATCCAGGGGGTAGTCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatgg < 1:4038594‑M2/150‑14 (MQ=255) tGATTTATCAGTTTTTCGTTAAGCACTGCACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggt > 1:2826870‑M2/1‑136 (MQ=255) tttATCAGTTTTTCGTTAAGCACTGCACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCATACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcac < 1:1763701‑M2/150‑18 (MQ=255) aTCAGTTTTTCGTTAAGCACTGCACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcacttt < 1:2872262‑M2/150‑21 (MQ=255) aGTTTTTCGTTAAGCACTGCACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGTTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcacttttga > 1:2337801‑M2/1‑127 (MQ=255) aGTTTTTCGTTAAGCACTGCACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcacttttga > 1:2337806‑M2/1‑127 (MQ=255) aGTTTTTCGTTAAGCACTGCACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcacttttga > 1:2337804‑M2/1‑127 (MQ=255) gTTTTTCGTTAAGCACTGCACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAGCGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggggagcttatggtcacttttgag > 1:4023148‑M2/1‑126 (MQ=255) gTTTTTCGTTAAGCACTGCACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcacttttgag < 1:4182528‑M2/150‑25 (MQ=255) tttttCGTTAAGCACTGCACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCCGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcacttttgaga < 1:4240610‑M2/150‑26 (MQ=255) ttttCGTTAAGCACTGCACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcacttttgggac < 1:1866601‑M2/150‑27 (MQ=255) ttttCGTTAAGCACTGCACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcacttttgagac > 1:1702841‑M2/1‑124 (MQ=255) ttttCGTTAAGCACTGCACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcacttttgagac > 1:2768759‑M2/1‑124 (MQ=255) ttttCGTTAAGCACTGCACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagag > 1:3154922‑M2/1‑124 (MQ=255) gCACTGCACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcacttttgagacagttatggaa < 1:1295598‑M2/150‑37 (MQ=255) aCTGCACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAAGAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatgttcacttttgagacagttatggaaat > 1:2556554‑M2/1‑112 (MQ=255) cTGCACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcacttttgagacagttatggaaatt < 1:1252178‑M2/150‑40 (MQ=255) cACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcacttttgagacagttatggaaattaaa < 1:1017483‑M2/150‑43 (MQ=255) cACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcacttttgagacagttatggaaattaaa < 1:1017484‑M2/150‑43 (MQ=255) cACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcacttttgagacagttatggaaattaaa > 1:162989‑M2/1‑108 (MQ=255) aCCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTAAggagagcttatggtcacttttgagacagttatggaaattaaaa > 1:349120‑M2/1‑107 (MQ=255) ccGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTTACGAACGGTGTAATAGTGATCCACACTCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcacttttgagacagttatggaaattagaat > 1:2355827‑M2/1‑106 (MQ=255) ccGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatgggcacttttgagacagttatggaaattaaaat > 1:2355822‑M2/1‑106 (MQ=255) ccGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGGGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcacttttgagacagttatggaaattaaaat > 1:2355823‑M2/1‑106 (MQ=255) gCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcacttttgagacagttatggaaattaaaatcc > 1:2021842‑M2/1‑104 (MQ=255) gCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcacttttgagacagttatggaaattaaaatcc < 1:2200862‑M2/150‑47 (MQ=255) tATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcacttttgagacagttatggaaattaaaatcctg > 1:1867587‑M2/1‑102 (MQ=255) aTTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTACTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcacttttgaggcagtcatggaaattaaaatcctgc > 1:3912493‑M2/1‑101 (MQ=255) aTGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcatttttgagacagttatggaaattaaaatcctgcacaagc > 1:3793414‑M2/1‑95 (MQ=255) aTGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcacttttgagacagttatggaaattaaaatcctgcacaagc < 1:2368572‑M2/150‑56 (MQ=255) 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gataACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcacttttgagacagttatggaaattaaaatcctgcacaagcagggaatga < 1:2802267‑M2/150‑65 (MQ=255) gataACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcacttttgagacagttatggaaattaaaatcctgcacaagcagggaatga < 1:3491044‑M2/150‑65 (MQ=255) gataACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcacttttgagacagttatggaaattaaaatcctgcacaagcagggaatga < 1:2802270‑M2/150‑65 (MQ=255) gataACGACTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcacttttgagacagttatggaaattaaaatcctgcacaagcagggaatga < 1:966145‑M2/150‑65 (MQ=255) catcacatttgtcacgaaCGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcacttttgagacagttatggaaattaaaatcctgcacaagcagggaatga < 1:308121‑M2/142‑65 (MQ=255) atcacgtTTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcacttttgagacagttatggaaattaaaatcctgcacaagcagggaatgag > 1:83319‑M2/4‑85 (MQ=255) cGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAggagagcttatggtcacttttgagacagttatggaaattaaaatcctgcacaagcagggaatgagtagc > 1:2190572‑M2/1‑81 (MQ=255) | CATATCGAGTTGGTGATTTATCAGTTTTTCGTTAAGCACTGCACCGCTATTTTCATGAAGATAGATAACGATTGTCACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_39/48337‑48485 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |