| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_138 | = 75 | NA (NA) | 78 (0.900) +GAAAGGGGGGATTTCCGGTCGCAGTGTAAAAGGAAAACGTATCCATACCCGGGCCATTCACA |
54/172 | 0.2 | 100% | coding (1153/1197 nt) | scrY_2 | Sucrose porin |
| ? | Xen14_45 | = 40401 | 0 (0.000) | intergenic (‑73/–) | Xen14_03654/– | hypothetical protein/– | |||||
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
GAACGACACCCCGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_45/40252‑40401 | gAACGACACCCCGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGc < 1:306491/150‑1 (MQ=255)gAACGACACCCCGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGc < 1:306486/150‑1 (MQ=255) acacCCCGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATACGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtga > 1:3601896‑M2/1‑145 (MQ=255) cacCCCGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaa < 1:2637335‑M2/150‑7 (MQ=255) acCCCGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaat < 1:3259960‑M2/150‑8 (MQ=255) acCCCGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaat < 1:2388212‑M2/150‑8 (MQ=255) cccGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatgg < 1:3964378‑M2/150‑10 (MQ=255) ctgcaGCGCCTCCGGTGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCGCGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcc > 1:478326‑M2/3‑139 (MQ=255) gCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccg < 1:3625705‑M2/150‑14 (MQ=255) cAGCGCCTCCTGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgg > 1:4197458‑M2/1‑136 (MQ=255) cAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgg > 1:2744366‑M2/1‑136 (MQ=255) gcgcCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggt < 1:1295878‑M2/150‑17 (MQ=255) gcgcCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggt > 1:1882824‑M2/1‑134 (MQ=255) gcCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtat < 1:867117‑M2/150‑19 (MQ=255) gcCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAACATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtat < 1:539357‑M2/150‑19 (MQ=255) ccTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatg > 1:1970607‑M2/1‑131 (MQ=255) ccTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatg > 1:3529610‑M2/1‑131 (MQ=255) cTCCGGGGCGTCGGGTGATTCNGGTACCTGAATCACGCCTTAAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCCTAATGTCGGTAGCAATGCtgtgaatggcccgggcatgg < 1:3520209‑M2/150‑21 (MQ=255) gggCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacg < 1:3174184‑M2/150‑26 (MQ=255) cGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcctgggtatggatacgttt > 1:3426802‑M2/1‑122 (MQ=255) gTCGGGGGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTACCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgtttt > 1:2856741‑M2/1‑121 (MQ=255) cGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttcc > 1:387765‑M2/1‑119 (MQ=255) gggTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttcct < 1:3537438‑M2/150‑33 (MQ=255) gnTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttcctt < 1:2798328‑M2/150‑34 (MQ=255) gATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttcct > 1:1900706‑M2/1‑114 (MQ=255) gATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGAACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttcctttta > 1:1160278‑M2/1‑114 (MQ=255) aTTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttac < 1:2743968‑M2/150‑38 (MQ=255) aTTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttac < 1:1233211‑M2/150‑38 (MQ=255) aTTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttac < 1:1233217‑M2/150‑38 (MQ=255) aTTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCCCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttac < 1:3334925‑M2/150‑38 (MQ=255) aTTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCCCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttac < 1:3666969‑M2/150‑38 (MQ=255) tGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacattg < 1:1287982‑M2/150‑42 (MQ=255) aCCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgac > 1:3051622‑M2/1‑105 (MQ=255) tGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccgg < 1:1629674‑M2/150‑49 (MQ=255) aTCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaa < 1:500069‑M2/150‑52 (MQ=255) cGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTGATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatccc > 1:1870183‑M2/1‑95 (MQ=255) cTTCAGGGACAGGCCGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccc < 1:3931107‑M2/150‑59 (MQ=255) tCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctt < 1:1529072‑M2/150‑61 (MQ=255) cAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatccccccttt < 1:2014398‑M2/150‑62 (MQ=255) gggACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcg < 1:931500‑M2/150‑64 (MQ=255) gggACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaa < 1:4153855‑M2/137‑51 (MQ=255) gataggcTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAGTGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgta > 1:287‑M2/4‑85 (MQ=255) aCAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggacacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaa < 1:3099935‑M2/150‑67 (MQ=255) ggCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcg > 1:1064990‑M2/1‑81 (MQ=255) ggCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcg > 1:3538729‑M2/1‑81 (MQ=255) ggCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcg < 1:2471726‑M2/150‑70 (MQ=255) gCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgt > 1:2267697‑M2/1‑80 (MQ=255) tGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtac > 1:3387379‑M2/1‑78 (MQ=255) 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gCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtacagcctgaaccgtc < 1:3998400‑M2/150‑86 (MQ=255) ctcCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtacagcctgaaccgtctgg > 1:97370‑M2/1‑62 (MQ=255) ctcCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtacagcctgaaccgtctgg > 1:97368‑M2/1‑62 (MQ=255) ccAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCACGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtacagcctgaaccgtctggtc > 1:410013‑M2/1‑60 (MQ=255) cAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtacagcctgaaccgtctggtca < 1:1110420‑M2/150‑92 (MQ=255) 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gCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtacagcctgaaccgtctggtcagaatctgacgcat > 1:1439548‑M2/1‑46 (MQ=255) gCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtacagcctgaaccgtctggtcagaatctgacgcat > 1:1439551‑M2/1‑46 (MQ=255) ccATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtacagcctgaaccgtctggtcagaatctgacgcatt < 1:1249045‑M2/150‑106 (MQ=255) ccATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtacagcctgaaccgtctggtcagaatctgacgcatt > 1:3108760‑M2/1‑45 (MQ=255) cATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtacagcctgaaccgtctggtcagaatctgacgcatta < 1:70212‑M2/150‑107 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |