| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_131 | 846 = | 54 (0.630) | 85 (0.670) | 44/296 | 0.7 | 75.9% | coding (93/573 nt) | Xen14_04737 | hypothetical protein |
| ? | Xen14_151 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/‑66) | –/Xen14_04764 | –/hypothetical protein | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTGATTGCTACG > Xen14_151/1‑150 | cgcatctgcctttacggggatttacaacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGcc < 1:1629904‑M2/3‑1 (MQ=255) gcatctgcctttacggggatttacaacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCg > 1:2725746‑M2/147‑150 (MQ=255) catctgcctttacggggatttacaacgatttggccgccgcatcgacctgcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCgg < 1:2922689‑M2/5‑1 (MQ=255) atctgcctttacggggatttacaacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCggg > 1:127855‑M2/145‑150 (MQ=255) atctgcctttacggggatttacaacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCggg < 1:3293180‑M2/6‑1 (MQ=255) ctgcctttacggggatttacaacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCg < 1:3738289‑M2/8‑1 (MQ=255) tgcctttacggggatttacaacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGt < 1:2087754‑M2/9‑1 (MQ=255) cctttacggggatttacaacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGa < 1:133359‑M2/11‑1 (MQ=255) cctttacggggatttacaacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGa < 1:133358‑M2/11‑1 (MQ=255) cctttacggggatttacaacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGa < 1:133356‑M2/11‑1 (MQ=255) cctttacggggatttacaacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGa < 1:133355‑M2/11‑1 (MQ=255) cctttacggggatttacaacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGa < 1:2117011‑M2/11‑1 (MQ=255) acggggatttacaacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAg > 1:1751436‑M2/135‑150 (MQ=255) gatttacaacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGTGaa < 1:2662949‑M2/21‑1 (MQ=255) tttacaacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAAc < 1:2341099‑M2/23‑1 (MQ=255) tacaacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgagggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCg > 1:4114067‑M2/126‑150 (MQ=255) caacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGaa > 1:2188355‑M2/124‑150 (MQ=255) caacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGaa > 1:162988‑M2/124‑150 (MQ=255) caacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGaa > 1:162987‑M2/124‑150 (MQ=255) aacgatttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGAAt > 1:1525615‑M2/123‑150 (MQ=255) atttggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGAATTATc > 1:2623803‑M2/119‑150 (MQ=255) tggccgccgcatcgaccttcgtgtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGAATTATCTGc > 1:1352877‑M2/116‑150 (MQ=255) gtaaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGTCGctgggc > 1:132226‑M2/94‑148 (MQ=255) taaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCaa < 1:2492606‑M2/58‑1 (MQ=255) taaaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCaa < 1:2492605‑M2/58‑1 (MQ=255) aaaaacgggggctgaagccatccaggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCaaa > 1:4169873‑M2/92‑150 (MQ=255) aaaacgggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAAt > 1:3621151‑M2/91‑150 (MQ=255) gggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGc > 1:4174098‑M2/86‑150 (MQ=255) ggggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGcc < 1:1384145‑M2/66‑1 (MQ=255) gggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCg < 1:1069755‑M2/67‑1 (MQ=255) ggctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGt > 1:3221355‑M2/83‑150 (MQ=255) gctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTg > 1:2233941‑M2/82‑150 (MQ=255) ctgaagccatccgggcgttgtccacacagctcccggcgtttcgtcagaaactgaatgacggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGTGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGa > 1:3847673‑M2/81‑150 (MQ=255) 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actgaatgagggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCa < 1:1601568‑M2/119‑1 (MQ=255) actgaatgagggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCa > 1:1709176‑M2/32‑150 (MQ=255) actgaatgagggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCa > 1:1709177‑M2/32‑150 (MQ=255) actgaatgagggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCa < 1:1981266‑M2/119‑1 (MQ=255) actgaatgagggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCa > 1:1454221‑M2/32‑150 (MQ=255) actgaatgagggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCa > 1:1454224‑M2/32‑150 (MQ=255) ctgaatgagggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAg < 1:924903‑M2/120‑1 (MQ=255) ctgaatgagggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAg < 1:4063336‑M2/120‑1 (MQ=255) tgaatgagggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAgg < 1:1822410‑M2/121‑1 (MQ=255) tgaatgagggctggtatcaggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAgg < 1:4057577‑M2/121‑1 (MQ=255) 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ggtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCt > 1:4276315‑M2/11‑150 (MQ=255) gtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTTGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGGCTGGCGGGTGCCAAAAGGGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTg < 1:3149997‑M2/141‑1 (MQ=255) gtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTg < 1:883446‑M2/141‑1 (MQ=255) gtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTg < 1:2935834‑M2/141‑1 (MQ=255) gtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTg < 1:3285866‑M2/141‑1 (MQ=255) gtgcgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTg < 1:2097515‑M2/141‑1 (MQ=255) cgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTGAtt < 1:2707889‑M2/144‑1 (MQ=255) cgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTGAtt < 1:2164578‑M2/144‑1 (MQ=255) cgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTGAtt < 1:2164579‑M2/144‑1 (MQ=255) cgcattGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTGAtt < 1:2290024‑M2/144‑1 (MQ=255) cattGCCGGGCGTGTTGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTGATTGc < 1:3612845‑M2/146‑1 (MQ=255) attGCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTg > 1:1616233‑M2/4‑136 (MQ=255) gCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTGATTGCTACg < 1:3812220/150‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCGGGCGTGATGCAGGCGAAACCGAATTATCTGCCCGTCTTAATGAGCCGCTGGCAAATGGTGCCGTGATCCACATTGTGCCGCGTCTGGCGGGTGCCAAAAGTGGCGGTGTTTTTCAGGCAGTGCTGGGTGCGGCGCTGATTGCTACG > Xen14_151/1‑150 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |