| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_11 | = 64 | 67 (0.540) | 44 (0.700) +GTGTCAGATGGGCGTCTAAGTTACCAATTCTTGTCTAATGGCTACATACGGCGGTCGGTTTACGCTTACTCTAATT |
23/144 | 2.1 | 61.3% | intergenic (–/‑186) | –/sacX | –/Negative regulator of SacY activity |
| ? | Xen14_138 | 37 = | 47 (0.360) | coding (1191/1197 nt) | scrY_2 | Sucrose porin | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCACTACTTATTTGGTGGACACCACTTTGTCTAATGCGTCAGATTCTGACCAGACGGTTCAGGCTGTACGCTTACATTGAAACCACTGCTGCCGAAAGCGTCATTGCTGGCAAAATCATCAAGTTTGCTGCTCCAGTCCATCCAGGTGGCAAACAGGCGAAGCTCCGGACGGCTAAAGAAATTATT > Xen14_138/1‑186 | aattcattcgaatagtttttacgaggttcttttcgccagtcctgtaattccatacttagatgtccgtctgtgtcagatgggcgtctaagttaccaattcttgtctaatggctacatacggcggtcggtttacgcttactctaattCGTCa < 1:6391‑M2/5‑1 (MQ=255) attcattcgaatactttttacgaggttcttttcgccagtcctgtaattccatacttagatgtccgtctgtgtcagatgggcgtctaagttaccaattcttgtctaatggctacatacggcggtcggtttacgcttactctaattCGTCAg < 1:3498807‑M2/6‑1 (MQ=255) ttcattcgaatactttttacgaggttcttttcgccagtcctgtaattccatacttagatgtccgtctgtgtcagatgggcgtctaagttaccaattcttgtctaatggctacatacggcggtcggtttacgcttactctaattCGTCAGa < 1:3672142‑M2/7‑1 (MQ=255) ttcattcgaatactttttacgaggttcttttcgccagtcctgtaattccatacttagatgtccgtctgtgtcagatgggcgtctaagttaccaattcttgtctaatggctacatacggcggtcggtttacgcttactctaattCGTCAGa < 1:4088092‑M2/7‑1 (MQ=255) cattcgaatactttttacggggttcttttcgccagtcctgtaattccatacttagatgtccgtctgtgtcagatgggcgtctaagttaccaattcttgtctaatggctacatacggcggtcggtttacgcttactctaattCGTCAGAtt < 1:618285‑M2/9‑1 (MQ=255) cattcgaatactttttacgaggttcttttcgccagtcctgtaattccatacttagatgtccgtctgtgtcagatgggcgtctaagttaccaattcttgtctaatggctacatacggcggtcggtttacgcttactctaattCGTCAGAtt < 1:618284‑M2/9‑1 (MQ=255) cattcgaatactttttacgaggttcttttcgccagtcctgtaattccatacttagatgtccgtctgtgtcagatgggcgtctaagttaccaattcttgtctaatggctacatacggcggtcggtttacgcttactctaattCGTCAGAtt > 1:553062‑M2/142‑150 (MQ=255) cattcgaatactttttacgaggttcttttcgccagtcctgtaattccatacttagatgtccgtctgtgtcagatgggcgtctaagttaccaattcttgtctaatggctacatacggcggtcggtttacgcttactctaattCGTCAGAtt > 1:553066‑M2/142‑150 (MQ=255) cattcgaatactttttacgaggttcttttcgccagtcctgtaattccatacttagatgtccgtctgtgtcagatgggcgtctaagttaccaattcttgtctaatggctacatacggcggtcggtttacgcttactctaattCGTCAGAtt < 1:3082544‑M2/9‑1 (MQ=255) cattcgaatactttttacgaggttcttttcgccagtcctgtaattccatacttagatgtccgtctgtgtcagatgggcgtctaagttaccaattcttgtctaatggctacatacggcggtcggtttacgcttactctaattCGTCAGAtt > 1:553061‑M2/142‑150 (MQ=255) attcgaatactttttacgaggttcttttcgccagtcctgtaattccatacttagatgtccgtctgtgtcagatgggcgtctaagttaccaattcttgtctaatggctacatacggcggtcggtttacgcttactctaattCGTCAGATTc > 1:3191586‑M2/141‑150 (MQ=255) tcgaatactttttacgaggttcttttcgccagtcctgtaattccatacttagatgtccgtctgtgtcagatgggcgtctaagttaccaattcttgtctaatggctacatacggcggtcggtttacgcttactctaattCGTCAGATTCTg < 1:1995117‑M2/12‑1 (MQ=255) cgaatactttttacgaggttcttttcgccagtcctgtaattccatacttagatgtccgtctgtgtcagatgggcgtctaagttaccaattcttgtctaatggctacatacggcggtcggtttacgcttactctaattCGTCAGATTCTGa < 1:732988‑M2/13‑1 (MQ=255) tactttttacgaggttcttttcgccagtcctgtaattccatacttagatgtccgtctgtgtcagatgggcgtctaagttaccaattcttgtctaatggctacatacggcggtcggtttacgcttactctaattCGTCAGATTCTGACCAg < 1:3439044‑M2/17‑1 (MQ=255) 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cTTTGTCTAATGCGTCAGATTCTTACCAGACGGTTCAGGCTGTACGCTTACATTGAAACCACTACTGCCGAAAGCGTCATTGCTGGCAAAATCATCAAGTTTGCTGCTCCAGTCCATCCAGGTGGCAAACAGGCGAAGCTCCGGACGGc < 1:3204989/149‑1 (MQ=255) tttGTCTAATGCGTCAGATTCTGACCAGACGGTTCAGGCTGTACGCTTACATTGAAACCACTGCTGCCGAAAGCGTCATTGCTGGCAAAATCATCAAGTTTGCTGCTCCAGTCCATCCAGGTGGCAAACAGGCGAAGCTCCGGACGGCTa > 1:61510/1‑150 (MQ=255) tttGTCTAATGCGTCAGATTCTGACCAGACGGTTCAGGCTGTACGCTTACATTGAAACCACTGCTGCCGAAAGCGCCATTGCTGGCAAAATCATCAAGTTTGCTGCTCCAGTCCATCCAGGTGGCAAACAGGCGAAGCTCCGGACGGCTa > 1:1214619/1‑150 (MQ=255) tGTCTAATGCGTCAGATTCTGACCAGACGGTTCAGGCTGTACGCTTACATTGAAACCACTGCTGCCGAAAGCGTCATTGCTGGCAAAATCATCAAGTTtgctg < 1:3964308/103‑1 (MQ=255) tCTAATGCGTCAGATTCTGACCAGACGGTTCAGGCTGTACGCTTACATTGAAACCACTGCTGCCGAAAGCGTCATTGCTGGCAAAATCATCAAGTTTGCTGCTCCAGTCCATCCAGGTGGCAAACAGGCGAAGCTCCGGACGGCTAAAGa < 1:3577845/150‑1 (MQ=255) tAATGCGTCAGATTCTGACCAGACGGTTCAGGCTGTACGCTTACATTGAAACCACTGCTGCCGAAAGCGTCATTGCTGGCAAAATCATCAAGTTTGCTGCTCCAGTCCATCCAGGTGGCAAACAGGCGAAGCTCCGGACGGCTAAAGaaa > 1:1001008/1‑150 (MQ=255) tAATGCGTCAGATTCTGACCAGACGGTTCAGGCTGTACGCTTACATTGAAACCACTGCTGCCGAAAGCGTCATTGCTGGCAAAATCATCAAGTTTGCTGCTCCAGTCCATCCAGGTGGCAAACAGGCGAAGCTCCGGACGGCTAAAGaaa > 1:1001009/1‑150 (MQ=255) aaTGCGTCAGATTCTGACCAGACGGTTCAGGCTGTACGCTTACATTGAAACCACTGCTGCCGAAAGCGTCATTGCTGGCAAAATCATCAAGTTTGCTGCTCCAGTCCATCCAGGTGGCAAACAGGCGAAGCTCCGGACGGCTAAAGAAat > 1:1170102/1‑150 (MQ=255) aaTGCGTCAGATTCTGACCAGACGGTTCAGGCTGTACGCTTACATTGAAACCACTGCTGCCGAAAGCGTCATTGCTGGCAAAATCATCAAGTTTGCTGCTCCAGTCCATCCAGGTGGCAAACAGGCGAAGCTCCGGACGGCTAAAGAAat > 1:418070/1‑150 (MQ=255) aaTGCGTCAGATTCTGACCAGACGGTTCAGGCTGTACGCTTACATTGAAACCACTGCTGCCGAAAGCGTCATTGCTGGCAAAATCATCAAGTTTGCTGCTCCAGTCCATCCAGGTGGCAAACAGGCGAAGCTCCGGACGGCTAAAGAAat > 1:418072/1‑150 (MQ=255) aaTGCGTCAGATTCTGACCAGACGGTTCAGGCTGTACGCTTACATTGAAACCACTGCTGCCGAAAGCGTCATTGCTGGCAAAATCATCAAGTTTGCTGCTCCAGTCCATCCAGGTGGCAAACAGGCGAAGCTCCGGACGGCTAAAGAAat > 1:418073/1‑150 (MQ=255) gCGTCAGATTCTGACCAGACGGTTCAGGCTGTACGCTTACATTGAAACCACTGCTGCCGAAAGCGTCATTGCTGGCAAAATCATCAAGTTTGCTGCTCCAGTCCATCCAGGTGGCAAACAGGCGAAGCTCCGGACGGCTAAAGAAattat > 1:1883651/1‑150 (MQ=255) cGTCAGATTCTGACCAGACGGTTCAGGCTGTACGCTTACATTGAAACCACCGCTGCCGAAAGCGTCATTGCTGGCAAAATCATCAAGTTTGCTGCTCCAGTCCATCCAGGTGGCAAACAGGCGAAGCTCCGGACGGCTAAAGAAattatt < 1:3387452/150‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCACTACTTATTTGGTGGACACCACTTTGTCTAATGCGTCAGATTCTGACCAGACGGTTCAGGCTGTACGCTTACATTGAAACCACTGCTGCCGAAAGCGTCATTGCTGGCAAAATCATCAAGTTTGCTGCTCCAGTCCATCCAGGTGGCAAACAGGCGAAGCTCCGGACGGCTAAAGAAATTATT > Xen14_138/1‑186 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |