| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_184 | = 473 | 0 (0.000) | 38 (0.090) | 31/234 | 1.0 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | Xen14_60 | 32 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+159) | –/hisI | –/Histidine biosynthesis bifunctional protein HisIE | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTTTACTTCAAATGAATGTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGCAACAACATCACACCTG > Xen14_60/1‑177 | agaaagttgaaagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtantgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATg < 1:3930654‑M2/47‑1 (MQ=255)agaaagttgaaagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATgg > 1:1850327‑M2/103‑150 (MQ=255)agaaagttgaaagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagtttcacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATgg < 1:747662‑M2/48‑1 (MQ=255) gaaagttgaaagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGgc > 1:1641673‑M2/102‑150 (MQ=255) aaagttgaaagatttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGgcg < 1:3879749‑M2/50‑1 (MQ=255) aagttgaaagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGgcgc > 1:217395‑M2/100‑150 (MQ=255) aagttgaaagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGgcgc > 1:217391‑M2/100‑150 (MQ=255) aagttgaaagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGgcgc > 1:217396‑M2/100‑150 (MQ=255) agttgaaagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCa < 1:4171883‑M2/52‑1 (MQ=255) agttgaaagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCa > 1:3159849‑M2/99‑150 (MQ=255) aattgaaagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCa > 1:787206‑M2/99‑150 (MQ=255) gttgaaagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCAt > 1:1959876‑M2/98‑150 (MQ=255) ttgaaagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATgg > 1:1740608‑M2/97‑144 (MQ=255) aaagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTa < 1:986047‑M2/57‑1 (MQ=255) gttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCgg > 1:805292‑M2/89‑150 (MQ=255) tttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGcc > 1:3390338‑M2/87‑150 (MQ=255) ccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCACTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACg < 1:672423‑M2/68‑1 (MQ=255) agaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACgtgtg < 1:1391094‑M2/72‑1 (MQ=255) aatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTg < 1:1227699‑M2/75‑1 (MQ=255) aatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTg < 1:1227698‑M2/75‑1 (MQ=255) aatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCACCTTATCCGGCCTACGTGTGTTg < 1:1227701‑M2/75‑1 (MQ=255) atgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGAt < 1:2346637‑M2/79‑1 (MQ=255) gcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATaa > 1:866738‑M2/70‑150 (MQ=255) cctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCGGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAAt < 1:2377804‑M2/82‑1 (MQ=255) ctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAAtg < 1:1983154‑M2/83‑1 (MQ=255) gcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAAtgtg < 1:3071339‑M2/85‑1 (MQ=255) atgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTa > 1:3396325‑M2/64‑150 (MQ=255) cagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCAc > 1:646112‑M2/59‑150 (MQ=255) agccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACg > 1:3923457‑M2/58‑150 (MQ=255) caggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATa > 1:865804‑M2/55‑150 (MQ=255) gtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGc > 1:2263901‑M2/52‑150 (MQ=255) gtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGc > 1:2837350‑M2/52‑150 (MQ=255) taatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCt < 1:600538‑M2/100‑1 (MQ=255) gatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTgcg > 1:3679332‑M2/47‑150 (MQ=255) atttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTgaga > 1:1376949‑M2/46‑123 (MQ=255) tacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaattgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATc > 1:1836132‑M2/43‑150 (MQ=255) tacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCATATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATc > 1:2054343‑M2/43‑150 (MQ=255) agcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTTAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATATGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCggg > 1:1664780‑M2/40‑150 (MQ=255) cTTCAAATGAATGTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGgt > 1:295587/1‑150 (MQ=255) cTTCAAATGAATGTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGgt > 1:3689834/1‑150 (MQ=255) cTTCAAATGAATGTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGgt > 1:829527/1‑150 (MQ=255) cTTCAAATGAATGTTTCATAAACCGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTTCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGgt > 1:18165/1‑150 (MQ=255) tCAAATGAATGTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAAtg > 1:498003/1‑106 (MQ=255) cAAATGAATGTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGtgtg < 1:2457614/150‑1 (MQ=255) aatgaatgTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATTGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGc < 1:448280/150‑1 (MQ=255) aatgaatgTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATTGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGc < 1:448281/150‑1 (MQ=255) aatgaatgTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATTGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGc < 1:448282/150‑1 (MQ=255) atgTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGcaacaa > 1:1175556/1‑150 (MQ=255) tgTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGCaacaac < 1:126638/150‑1 (MQ=255) gTTTCATCAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGCAacaaca > 1:2772244/1‑150 (MQ=255) gTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATg < 1:1971745/129‑1 (MQ=255) ttCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGCAACAACATc > 1:2824049/1‑150 (MQ=255) tAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGCAACAACATCacac < 1:2624275/150‑1 (MQ=255) tAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGCAACAACATCacac < 1:2624274/150‑1 (MQ=255) tAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGCAACAACATCacac < 1:1011433/150‑1 (MQ=255) aCTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGCAACAACATCACACCTg > 1:2097708/1‑150 (MQ=255) aCTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGCAACAACATCACACCTg > 1:2097705/1‑150 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTTTACTTCAAATGAATGTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGCAACAACATCACACCTG > Xen14_60/1‑177 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |