| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | Xen14_68 | = 16345 | 0 (0.000) | intergenic (+65/–) | rph/– | Ribonuclease PH/– | |||||
Only 100 of 297 total aligned reads displayed.
TGAAGAGCTACTCACCTTGTTGGCGCTGGCCCGAGGGGGAATCGAATCCATTGTAGCGACGCAGAAGGCGGCGCTGGCAAACTGATTTTTAAGGCGACTGATGAGTCGCCTTTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_68/16196‑16382 | cgcTGGCCCGAGGGGGAATCGAATCCATTGTAGCGACGCAGAAGGCGGCGCTGGCAAACTGATTTTTAAGGCGACTGATGAGTCGCCTTTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAg < 1:2384748/150‑1 (MQ=255) gcTGGCCCGAGGGGGAATCGAATCCATTGTAGCGACGCAGAAGGCGGCGCTGGCAAACTGATTTTTAAGGCGACTGATGAGTCGCCTTTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCCCGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGc > 1:314370/1‑150 (MQ=255) tGGCCCGAGGGGGAATCGAATCCATTGTAGCGACGCAGAAGGCGGCGCTGGCAAACTGATTTTTAAGGCGACTGATGAGTCGCCTTTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTCGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCa > 1:3708491/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |