| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_168 | 1 = | 0 (0.000) | 72 (0.100) | 43/246 | 2.1 | 100% | intergenic (–/+59) | –/Xen14_04774 | –/IS200/IS605 family transposase IS200C |
| ? | Xen14_80 | 26 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+67) | –/arcA | –/Aerobic respiration control protein ArcA | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTTAGGGCGCGGCTGGTAAGAGAGCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAGAAGCGATAACCTTCACCGTGAATGGTGGCGATGATTTCCGGCGTATCCGGCGTAGATTCG > Xen14_80/1‑174 | attccctatccgggcagcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGa > 1:34024‑M2/99‑150 (MQ=255)attccctatccgggcagcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTG‑AAAACCTCCGGCTATGCCGTAGGATATTTATTGAc < 1:1899042‑M2/52‑1 (MQ=255)attccctatccgggcagcccgtttacgggccgtaagtaacgaaattggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGa > 1:2335114‑M2/99‑150 (MQ=255)attccctatccgggcagcccgtttacgggccgtaagtaacgaaattggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGa > 1:2335115‑M2/99‑150 (MQ=255)attccctatccgggcagcccgtttacgggccgtaagtaacgaaattggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGa > 1:2335116‑M2/99‑150 (MQ=255)attccctatccgggcagcccgtttacgggccgtaagtaacgaaattggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGa > 1:2335118‑M2/99‑150 (MQ=255) ttccctatccgggcagcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGAc > 1:876349‑M2/98‑150 (MQ=255) ttccctatccgggcagcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGAc > 1:876350‑M2/98‑150 (MQ=255) ttccctatccgggcagcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGAc > 1:876351‑M2/98‑150 (MQ=255) ttccctatccgggcagcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACATCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGAc > 1:2514253‑M2/98‑150 (MQ=255) cctatccgggcagcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACggt > 1:3287238‑M2/95‑150 (MQ=255) ctatccgggcagcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACggtg > 1:1901003‑M2/94‑150 (MQ=255) tatctgggcagcccgtttacgtgccgtgagtaacgaagtcggatgcaaatgtcaaatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaatagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACATCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACggtgg < 1:4437285‑M2/58‑1 (MQ=255) tatccgggcagcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcaggtcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaatagagCCTTAGAGGCGCATTTGAAGAACCTCCGGTTATGCCGGAGGATATTGAGTGACggtgg < 1:2966320‑M2/58‑1 (MQ=255) 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cgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTaa > 1:3547025‑M2/80‑150 (MQ=255) cgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTaa > 1:2780306‑M2/80‑150 (MQ=255) cgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTaa > 1:2071542‑M2/80‑150 (MQ=255) cgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTaa > 1:920384‑M2/80‑150 (MQ=255) gtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAAt < 1:6674‑M2/72‑1 (MQ=255) tttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATc < 1:2844762‑M2/73‑1 (MQ=255) acgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCt > 1:725177‑M2/75‑148 (MQ=255) cgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTcc < 1:3640020‑M2/77‑1 (MQ=255) gccgtaagtaacgaagttggattcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGa > 1:3400900‑M2/71‑150 (MQ=255) cgtaagtagcgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGACTAATCTTcc > 1:1648958‑M2/69‑145 (MQ=255) 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cTGGTAAGAGAGCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAATGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAGAAGCGATAACCTTCACCGTGAATGGTGGCGATGATTtccggcgtatccg < 1:1205500/150‑1 (MQ=255) gTAAGAGAGCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAGAAGCGATAACCTTCACCGTGAATGGTGGCGATGATTtccggcgtatccggcg < 1:2884194/150‑1 (MQ=255) tAAGAGAGCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAGAAGCGATAACCTTCACCGTGAATGGTGGCGATGATTtccggcgtatccggcgt < 1:819578/150‑1 (MQ=255) tAAGAGAGCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAGAAGCGATAACCTTCACCGTGAATGGTGGCGATGATTtccggcgtatccggcgt < 1:819580/150‑1 (MQ=255) aaGAGAGCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCTGATCACCGCAGAAGCGATAACCTTCACCGTGAATGGTGGCGATGATTtccggcgtatccggcgta < 1:295267/150‑1 (MQ=255) 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gCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAGAAGCGATAACCTTCACCGTGAATGGTGGCGATGATTTCCGGCGTATCCGGCGTAGATTCg > 1:543179/1‑150 (MQ=255) gCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAGAAGCGATAACCTTCACCGTGAATGGTGGCGATGATTTCCGGCGTATCCGGCGTAGATTCg > 1:4087391/1‑150 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTTAGGGCGCGGCTGGTAAGAGAGCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAGAAGCGATAACCTTCACCGTGAATGGTGGCGATGATTTCCGGCGTATCCGGCGTAGATTCG > Xen14_80/1‑174 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |