| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_141 | 1 = | 0 (0.000) | 43 (0.040) +GCTCTCCT |
32/280 | 2.7 | 100% | intergenic (–/‑23) | –/Xen14_04755 | –/hypothetical protein |
| ? | Xen14_75 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/‑127) | –/Xen14_04339 | –/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 808 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGATCTCCCGCAATACGGTTAAACGTTATTTGCAGGCAAAATCTGAGCCGCCAAAATATACGCCGC > Xen14_141/1‑150 | acatcaacggtattacgccctaaacggtcaatagctaccacaactaacgtatcgtcacaccttactgtcacgaacggtgcaatagtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagct < 1:1542612‑M2/1‑1 (MQ=255) ctggatttgataagtagctcaaggccatcgccatcatagagaacgtagtccgcttccttggtgtcactaacggtgcaatagtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagtTTATg < 1:138216‑M2/5‑1 (MQ=255) tggatttgataagtagctcaaggccatcgccatcatagagaacgtagtccgcttccttggtgtcactaacggtgcaatagtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagtTTATgg < 1:2580161‑M2/6‑1 (MQ=255) caccatccgctcaaccttaccttttgttctggccctgcgtggacggcatgcccgtggtgtcacgaacggtgcaatagtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCa < 1:1002461‑M1/9‑1 (MQ=255) ccatccgctcaaccttaccttttgttctggccctgcgtggacggcatgcccgtggtgtcacgaacggtgcaatagtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCACt > 1:1815312‑M1/140‑150 (MQ=255) tacgccctaaacggtcaatagctaccacaactaacgtatcgtcacaccttactgtcacgaacggtgcaatagtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCACtttt > 1:2488590‑M2/137‑150 (MQ=255) taagtagctcaaggccatcgccatcatagagaacgtagtccgcttccttggtgtcactaacggtgcaatagtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagtTTATGGTCACTTTTg < 1:3690609‑M2/15‑1 (MQ=255) aagtagctcaaggccatcgccatcatagagaacgtagtccgcttccttggtgtcactaacggtgcaatagtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagtTTATGGTCACTTTTga < 1:1792024‑M2/16‑1 (MQ=255) agtagctcaaggccatcgccatcatagagaacgtagtccgcttccttggtgtcactaacggtgcaatagtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagtTTATGGTCACTTTTgag > 1:2523556‑M2/134‑150 (MQ=255) ttttcgttaagcactgcaccgctattttcatgaagatagataacgattgtcacgaacggtgcaatagtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCACttttgggac < 1:1866601‑M1/19‑5 (MQ=255) caaggccatcgccatcatagagaacgtagtccgcttccttggtgtcactaacggtgcaatagtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgatctcctgattcaggagagtTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTa > 1:4208342‑M2/127‑150 (MQ=255) gtcaatagctaccacaactaacgtatcgtcacaccttactgtcacgaacggtgcaatagtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATgg < 1:4165017‑M2/27‑1 (MQ=255) tagctaccacaactaacgtatcgtcacaccttactgtcacgaacggtgcaatagtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAAtt < 1:1937057‑M2/32‑1 (MQ=255) tctggccctgcgtggacggcatgcccgtggtgtcacgaacggtgcaatggtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTCTGGAAATtaaag < 1:3153969‑M1/36‑2 (MQ=255) atcatagagaacgtagtccgcttccttggtgtcactaacggtgcaatagtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcccgattcaggagagtTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAAt < 1:59877‑M2/37‑1 (MQ=255) cctgcgtggacggcatgcccgtggtgtcacgaacggtgcaatagtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGc > 1:1284283‑M1/109‑150 (MQ=255) attttcatgaagatagataacgattgtcacgaacggtgcaatagtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctactctcctgattcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGGCAGTCATGGAAATTAAAATCCTGc > 1:3912493‑M1/109‑150 (MQ=255) tccgcttccttggtgtcactaacggtgcaatagtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagtTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGa < 1:840563‑M2/53‑1 (MQ=255) 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tgcaatagtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCagag < 1:1169185‑M2/78‑1 (MQ=255) gcaatagtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAgaga < 1:3232064‑M2/79‑1 (MQ=255) gcaatagtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAgaga > 1:66397‑M2/72‑150 (MQ=255) caatagtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagtTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGaa > 1:758821‑M2/71‑150 (MQ=255) caatagtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGaa > 1:1065767‑M2/71‑150 (MQ=255) aatagtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCACTTCTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAAc > 1:2792473‑M2/70‑150 (MQ=255) tagtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagtTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTg > 1:2908515‑M2/68‑150 (MQ=255) tagtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTg > 1:4125238‑M2/68‑150 (MQ=255) gtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTggg > 1:1112078‑M2/66‑150 (MQ=255) gtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTggg > 1:802581‑M2/66‑150 (MQ=255) gtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTggg < 1:1718120‑M2/85‑1 (MQ=255) gtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTggg > 1:3871524‑M2/66‑150 (MQ=255) gtgatccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTggg < 1:1428788‑M2/85‑1 (MQ=255) gatccacacccaacgcctgaaatcagatccggggggtaatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCCGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGa > 1:3705881‑M2/64‑150 (MQ=255) atccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagtTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATAAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGAt > 1:2349273‑M2/63‑150 (MQ=255) atccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGAt > 1:3799706‑M2/63‑150 (MQ=255) tccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagtTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGAtc > 1:2630268‑M2/62‑150 (MQ=255) tccacacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGAtc < 1:3530491‑M2/89‑1 (MQ=255) cacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGATCTccc < 1:4424319‑M2/93‑1 (MQ=255) cacccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGATCTccc > 1:1495777‑M2/58‑150 (MQ=255) cccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGATCTCCCGc < 1:2879935‑M2/95‑1 (MQ=255) ccaacgcctgaaatcagatccagggggtgatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGATCTCCCGCa < 1:3770936‑M2/96‑1 (MQ=255) ccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGATCTCCCGCa > 1:1305355‑M2/55‑150 (MQ=255) ccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGATCTCCCGCa > 1:535493‑M2/55‑150 (MQ=255) ccaacgcctgaaatcagatccagggggtaatctgctctcctgattcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGATCTCCCGCa > 1:2818135‑M2/55‑150 (MQ=255) 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ctgattcaggagagtTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGATCTCCCGCAATACCGTTAAACGTTATTTGCAGGCAAAATCTGAgccgc > 1:2261387‑M2/16‑150 (MQ=255) ctgattcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGATCTCCCGCAATACGGTTAAACGTTATTTGCAGGCAAAATCTGAgccgc > 1:2663437‑M2/16‑150 (MQ=255) ctgattcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGATCTCCCGCAATACGGTTAAACGTTATTTGCAGGCAAAATCTGAgccgc < 1:1581851‑M2/135‑1 (MQ=255) tgattcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGATCTCCCGCAATACGGTTAAACGTTATTTGCAGGCAAAATCTGAgccgcc > 1:3054063‑M2/15‑150 (MQ=255) attcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGAtc < 1:2862609‑M2/89‑1 (MQ=255) attcaggagagcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGATCTCCCGCAATACGGTTAAACGTTATTTGCAGGCAAAATCTGAGCCGCCaa > 1:918685‑M2/13‑150 (MQ=255) agcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGATCTCCCGCAATACGGTTAAACGTTATTTGCAGGCAAAATCTGAGCCGCCAAAATATAcgc < 1:3469585‑M2/147‑1 (MQ=255) gtttATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGATCTCCCGCAATACCGTTAAACGTTATTTGCAGGCAAAATCTGAGCCGCCAAAATATAcgcc > 1:488511/3‑150 (MQ=255) gtttATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGATCTCCCGCAATACCGTTAAACGTTATTTGCAGGCAAAATCTGAGCCGCCAAAATATAcgcc > 1:1456891/3‑150 (MQ=255) gcTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGATCTCCCGCAATACGGTTAAACGTTATTTGCAGGCAAAATCTGAGCCGCCAAAATATAcgcc < 1:3426541‑M2/148‑1 (MQ=255) cTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGATCTCCCGCAATACGGTTAAACGTTATTTGCAGGCAAAATCTGAGCCGCCAAAATATacgcca > 1:2387586‑M2/2‑149 (MQ=255) cTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGATCTCCCGCAATACGGTTAAACGTTATTTGCAGGCAAAATCTGAGCCGCCAAAATATAcgccg > 1:2437761‑M2/2‑150 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGATCTCCCGCAATACGGTTAAACGTTATTTGCAGGCAAAATCTGAGCCGCCAAAATATACGCCGC > Xen14_141/1‑150 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |