| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_12 | 25 = | 1077 (12.020) | 53 (0.040) | 44/280 | 0.9 | 9.4% | intergenic (–/+303) | –/Xen14_01540 | –/hypothetical protein |
| ? | Xen14_166 | = 677 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1168 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATC > Xen14_12/1‑174 | cgctggctgatagaggaataccccaagtcgtggcaaagtggtggtacacgtgtggaatcgctgcgaatgcagacccgggataacctcgagcgcatggtggttatcgaggcgtttatcgcggtgcgggtgctgggcctgtggtagggcggt < 1:3888622‑M1/20‑12 (MQ=255) ggctgatagaggaataccacaatgcgtggaaaagtggtggtacatgtgtggaatcgctgcgaatgcagacccgggataacctcgagcgcatggtggttatcaaggcgtttatcgcggtgcgggtgcTGGGCCTGTCTGAAACTGGCGaaa > 1:3837633‑M1/127‑150 (MQ=255) tagaggaataccacaaggcgtggaaaagtggtggtacatgtgtggaatcgctgcgaatgcagacccgggataacctcgagcgcatggtggttatcaaggcgtttatcgcggtgcgggtgcTGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTgggg > 1:4315342‑M1/121‑150 (MQ=255) gcgaatgcagacccgggataacctcgagcgcatggtggttatcaaggcgtttatcgcggtgcgggtgcTGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTggg > 1:1404399‑M1/69‑150 (MQ=255) ataacctcgagcgcatggtggttatcaaggcgtttatcgcggtgcgggtgcTGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACtt < 1:3686217‑M1/99‑1 (MQ=255) tcgagcgcatggtggttatcaaggcgtttatcgcggtgcgggtgcTGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACCTCAGGat < 1:2003951‑M1/105‑1 (MQ=255) aaggaaaaccgcttccGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGGAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTg > 1:1860182/15‑150 (MQ=14) aggaaaaccgcttccGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTc < 1:3308287/117‑1 (MQ=11) aggaaaaccgcttccGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGa > 1:2463538/14‑150 (MQ=255) 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acTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCa < 1:179692/150‑1 (MQ=255) acTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCa < 1:767388/150‑1 (MQ=255) acTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCa > 1:560637/1‑150 (MQ=255) acTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCa < 1:2678994/150‑1 (MQ=255) cTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTTAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACTTGGTGATGAAGTCTTTTGAttaa > 1:4454739/1‑147 (MQ=17) cTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAg < 1:3747336/150‑1 (MQ=255) cTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAg > 1:871611/1‑150 (MQ=255) cTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCC‑GGTTGGGTAGTCACGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAAGATATGGTTGAGGGTTCCCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAgg > 1:973782/1‑150 (MQ=17) cTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTAGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAg > 1:3786943/1‑150 (MQ=255) tGAAATGGGCCTGTCCGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAgg < 1:2368323/150‑1 (MQ=255) gAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGAt > 1:4235301/1‑145 (MQ=255) gAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGga > 1:2088084/1‑150 (MQ=255) gAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGga > 1:4062529/1‑150 (MQ=255) gAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCAGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGga > 1:909954/1‑150 (MQ=255) aaaTGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTAAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGgag < 1:3130104/150‑1 (MQ=255) 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tGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATc < 1:117492/150‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGTCACAGATGCCGACACTGAAATGGGCCTGTCTGAAACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATC > Xen14_12/1‑174 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |