| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_105 | 3420 = | 150 (0.850) | 103 (0.960) | 54/186 | 0.3 | 68.6% | intergenic (+42/+32) | hypF/Xen14_04636 | Carbamoyltransferase HypF/IS3 family transposase IS1397 |
| ? | Xen14_49 | 56 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+131) | –/gldA | –/Glycerol dehydrogenase | |||||
Only 100 of 254 total aligned reads displayed.
CATTGCTCTTTCCACAGAGTTTACCGGCGGGTGACGGCGGGTTGTCTCTGGGGCAGGGGGTTATTGTTGCGGCGCGTTGGTTGGCAGGGGAAGTCCAGAACGGATAAAACGTGCTGCATTTGGACACCATTGCCGGATGCGGCG‑TAAATGAACTGAACCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCGGTATTCTACCGGGCTGAGTCCCCCAAGACTGAGTTTTATTCTTTTTTGATTCCAGTAAGTTATGTATTCGTTAACGGCATTTTCCAGCTC > Xen14_105/3272‑3568 | caTTGCTCTTTCCACAGAGTTTACCGGCGGGTGACGGCGGGTTGTCTCTGGGGCAGGGGGTTATTGTTGCGGCGCGTTGGTTGGCAGGGGAAGTCCAGAACAGATAAAACATGCTGCATTTGGACACCATTGCCGGATGTGGCG‑TAAAtg > 1:1904575/1‑150 (MQ=255) gCTCTTTCCACAGAGTTTACCGGCGGGTGACGGCGGGTTGTCTCTGGGGCAGGGGGTTATTGTTGCGGCGCGTTGGTTGGCAGGGGAAGTCCAGAACGGATAAAACGTGCTGCATTTGGACACCATTGCCGGATGCGGCG‑TAAAtgaact > 1:1479045/1‑150 (MQ=255) actctTTCCACAGATTTTACCTGCGGGTGACTGCGGGTTGTCACTGGGGCAGGGGGTTATTGTTGCGGCGCGTTGGTTGGCAGGGGAAGTCCAGAATGGATAAAACGTGCTGCATTTGGACACCATTGCCGGATGCGGCG‑TAAAtgaact < 1:2958697/149‑1 (MQ=255) 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gaacTGAACTGAACCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCGGTATTCTACCGGGCTGAGTCCCCCAAGACTGAGTTTTATTCTTTTTTGATTCCAGTAAGTTATGTATTCGTTAACGGCATTTTCCAg > 1:560392‑M1/5‑150 (MQ=255) ctaTGAACTGAACCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCGGTATTCTACCGGGCTGAGTCCCCCAAGACTGAGTTTTATTCTTTTTTGATTCCAGTAAGTTATGTATTCGTTAACGGCATTTTCCAGc < 1:205722/148‑1 (MQ=255) cacTGAACTGAACCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCGGTATTCTACCGGGCTGAGTCCCCCAAGACTGAGTTTTATTCTTTTTTGATTCCAGTAAGTTATGTATTCGTTAACGGCATTTTCCAGc < 1:761538‑M1/147‑1 (MQ=255) aaaTGAACTGAACCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCGGTATTCTACCGGGCTGAGTCCCCCAAGACTGAGTTTTATTCTTTTTTGATTCCAGTAAGTTATGTATTCGTTAACGGCATTTTCCAGc > 1:3463838/1‑150 (MQ=255) caTGAACTGAACCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCGGTATTCTACCGGGCTGAGTCCCCCAAGACTGAGTTTTATTCTTTTTTGATTCCAGTAAGTTATGTATTCGTTAACGGCATTTTCCAGct > 1:1141760/2‑150 (MQ=255) | CATTGCTCTTTCCACAGAGTTTACCGGCGGGTGACGGCGGGTTGTCTCTGGGGCAGGGGGTTATTGTTGCGGCGCGTTGGTTGGCAGGGGAAGTCCAGAACGGATAAAACGTGCTGCATTTGGACACCATTGCCGGATGCGGCG‑TAAATGAACTGAACCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCGGTATTCTACCGGGCTGAGTCCCCCAAGACTGAGTTTTATTCTTTTTTGATTCCAGTAAGTTATGTATTCGTTAACGGCATTTTCCAGCTC > Xen14_105/3272‑3568 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |