| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_55 | = 26715 | 0 (0.000) | 53 (0.520) +GTAGCAGTAAT |
37/274 | 2.1 | 100% | intergenic (‑222/–) | Xen14_03965/– | hypothetical protein/– |
| ? | Xen14_90 | = 74 | NA (NA) | coding (1/747 nt) | yafV | Omega‑amidase YafV | |||||
AACGTAACAGAATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_55/26567‑26715 | aaCGTAACAGAATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTg < 1:779334‑M1/150‑2 (MQ=255) cGTAACAGAATTATCACTGTTGATTCTTGCTGGCAGAGGCTTGTGGTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGGATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgta < 1:2673333‑M1/150‑4 (MQ=255) tAACAGAATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGGAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagc > 1:1186791‑M1/1‑145 (MQ=255) tAACAGAATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGGAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagc > 1:1186792‑M1/1‑145 (MQ=255) aaCAGAATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagca < 1:2271192‑M1/150‑7 (MQ=255) aCAGAATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcag < 1:45989‑M1/150‑8 (MQ=255) aTTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAACTAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaatt > 1:2130455‑M1/1‑138 (MQ=255) aTTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaatt > 1:2130462‑M1/1‑138 (MQ=255) aTTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaatt > 1:2130454‑M1/1‑138 (MQ=255) aTTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaatt > 1:2130458‑M1/1‑138 (MQ=255) aTTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaatt > 1:2130459‑M1/1‑138 (MQ=255) aTTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCCTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaatt > 1:2130461‑M1/1‑138 (MQ=255) cACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagt > 1:4116231‑M1/1‑133 (MQ=255) aCTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtg > 1:4086220‑M1/1‑132 (MQ=255) ttGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAACGTTGGCCTGTAGTGCTTCAGTGATTGCTATCTTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtca > 1:4182675‑M1/1‑128 (MQ=255) tcgatTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtca < 1:3077119‑M1/148‑23 (MQ=255) tGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATGACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaa > 1:3300009‑M1/1‑127 (MQ=255) tGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtcattgaagtggtcaa > 1:164276‑M1/1‑127 (MQ=255) gATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaac < 1:4132884‑M1/150‑25 (MQ=255) tctcGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcag > 1:3252478‑M1/1‑123 (MQ=255) tcGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaa < 1:1864080‑M1/150‑30 (MQ=255) cTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactg < 1:43101‑M1/150‑33 (MQ=255) gagGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccacc > 1:3410435‑M1/1‑112 (MQ=255) ggCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccatcgc > 1:2498254‑M1/1‑110 (MQ=255) ttgtgtttgtgtCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcgtt < 1:811964‑M1/150‑44 (MQ=255) ttgtgtttgtgtCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcgtt > 1:3502732‑M1/1‑107 (MQ=255) ttgtgtctgtgtCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcgtt < 1:2443030‑M1/150‑44 (MQ=255) gtttgtgtCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagctgtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcgttagag > 1:2951700‑M1/1‑103 (MQ=255) ttgtgtCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcgttagagtt < 1:4181534‑M1/150‑50 (MQ=255) ttgtgtCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcgttagagtt < 1:3120265‑M1/150‑50 (MQ=255) gtCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGCTTTCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTCGGGTCCCTgtcgcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggcgaccgcgttagagtttttc > 1:436952‑M1/1‑97 (MQ=255) tCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaatt > 1:4012027‑M1/1‑96 (MQ=255) ccTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcgttagagtttttcca < 1:2769968‑M1/150‑56 (MQ=255) tGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcgttagagtttttccagt > 1:1361136‑M1/1‑93 (MQ=255) tGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcattagagtttttccagt > 1:125264‑M1/1‑93 (MQ=255) tGAAAATAACTCAACGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcgttagagt > 1:2923339‑M1/1‑93 (MQ=255) gAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccacagcgttagagtttttccagta > 1:3233946‑M1/1‑92 (MQ=255) aaaTAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACCCTTTACCCATCCTTGGGTCCCTgtggcagcaattgaagtggtcaacaaaaactggctcccgagttagagtttttccaggctc > 1:3848480‑M1/1‑90 (MQ=255) aaTAACTCAAGGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCGAACTCTTTACCCTTCCTTGGGTCCTTgtagcagtaattgaggtggtcaacaaaaactggccattgcgttagagtttttccagtatcg < 1:3881728‑M1/150‑62 (MQ=255) aCTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcgttagagtttttccagtatcgattt > 1:3339037‑M1/1‑85 (MQ=255) aCTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcgttagagtttttccagtatcgattt > 1:3389450‑M1/1‑85 (MQ=255) aCTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcgttagagtttttccagtatcgattt > 1:2768083‑M1/1‑85 (MQ=255) aCTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcgttagagtttttccagtatcgattt > 1:1443518‑M1/1‑85 (MQ=255) cTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcgttagagtttttccagtatcgatttt > 1:2895000‑M1/1‑84 (MQ=255) cTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCATCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcgttagagtttttccagtatcgatttt < 1:287799‑M1/150‑67 (MQ=255) cAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcgttagagtttttccagtatcgattttcc < 1:1058052‑M1/150‑69 (MQ=255) aaatGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTACTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcgttagagtttttccagtatcgattttcc < 1:4083639‑M1/149‑69 (MQ=255) aTGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcgttagagtttttccagtatcgattttccga < 1:2153599‑M1/150‑71 (MQ=255) aTGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcgttagagtttttccagtatcgattttccga > 1:1127077‑M1/1‑80 (MQ=255) tGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcgttagagtttttccagtatcgattttccgat < 1:2754617‑M1/150‑72 (MQ=255) gTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCCTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcgttagagtttttccagtatcg > 1:3951912‑M1/1‑78 (MQ=255) tGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaacttgccaccgcgttagagtttttccagtatcgattttccgattcg < 1:3207001‑M1/150‑75 (MQ=255) ggCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcgttagagtttttccagtatcgattttccgattcgt > 1:3308144‑M1/1‑75 (MQ=255) gTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCTTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcgttagagtttttccagtatcgattttccgattcgtttggg < 1:3488288‑M1/150‑81 (MQ=255) gTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCGGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcgttagagtttttccagtatcgattttccgattcgtttggg < 1:857852‑M1/150‑81 (MQ=255) gTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCGGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcgttagagtttttccagtatcgattttccgattcgtttggg < 1:857853‑M1/150‑81 (MQ=255) gTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCCGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcgttagagtttttccagtatcgattttccgattcgtttggg > 1:1054332‑M1/1‑70 (MQ=255) tATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccatcgcgttagagtttttccagtatcgattttccgattcgtttgggg < 1:1841252‑M1/150‑82 (MQ=255) cTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcgttagagtttttccagtatcgattttccgattcgtttgggggtaac > 1:3827600‑M1/1‑64 (MQ=255) aaaCTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTgtagcagtaattgaagtggtcaacaaaaactggccaccgcgttagagtttttccagtatcgattttccgattcgtttgggggtaacc > 1:607850‑M1/1‑27 (MQ=255) | AACGTAACAGAATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATTGCTTCAGTGATTGCTATCCTCCTGTCTCGGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_55/26567‑26715 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |