| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_177 | = 549 | 0 (0.000) | 39 (0.460) +ACTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAAC |
26/182 | 1.3 | 69.4% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | Xen14_96 | 5541 = | 56 (0.440) | intergenic (‑234/+256) | Xen14_04570/Xen14_04571 | hypothetical protein/tRNA‑Arg(tct) | |||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
AGTGCTACCTGTAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_177/400‑549 | aGTGCTACCTGTAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATgg > 1:280835/1‑150 (MQ=255) tGCTACCTGTAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgc < 1:1160954‑M1/150‑3 (MQ=255) tGCTACCTGTAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGac < 1:4347871‑M1/150‑3 (MQ=255) ccTGTAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaa > 1:406342‑M1/1‑143 (MQ=255) ccTGTAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaa > 1:406343‑M1/1‑143 (MQ=255) ccTGTAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaa < 1:4149308‑M1/150‑8 (MQ=255) cTGTAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaagac < 1:178049‑M1/150‑9 (MQ=255) tAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACGGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaac < 1:3182890‑M1/150‑12 (MQ=255) cATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaag > 1:2514288‑M1/1‑135 (MQ=255) cATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaag > 1:4013514‑M1/1‑135 (MQ=255) tACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtcca > 1:462927‑M1/1‑131 (MQ=255) aCAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccat > 1:4132236‑M1/1‑130 (MQ=255) cAACGTAGTACCATTCAATAAAACNTTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCATGAATGCCCTACAAATACACATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccata < 1:3761710‑M1/150‑22 (MQ=255) cAACGTAGTACCATTCAATAAAACNTTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACACATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccata < 1:3761713‑M1/150‑22 (MQ=255) cAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccata > 1:1252396‑M1/1‑129 (MQ=255) cAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccata > 1:1252393‑M1/1‑129 (MQ=255) cAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccata > 1:197608‑M1/1‑129 (MQ=255) aCGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataag < 1:1081121‑M1/150‑24 (MQ=255) aCGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGACAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataag < 1:2775059‑M1/150‑24 (MQ=255) aCGTAGTACCATTCAATAAAACATCCTGGAATGTAAGCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACATACAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataag < 1:2775060‑M1/150‑24 (MQ=255) cGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataagg > 1:491390‑M1/1‑126 (MQ=255) cGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataagg > 1:491388‑M1/1‑126 (MQ=255) tagtaCCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggag < 1:1434774‑M1/150‑27 (MQ=255) tagtaCCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggag > 1:3388959‑M1/1‑124 (MQ=255) aCCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGCTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagttta > 1:56710‑M1/1‑120 (MQ=255) aCCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGCTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagttta > 1:56709‑M1/1‑120 (MQ=255) ccATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCNCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttac < 1:3760804‑M1/150‑32 (MQ=255) aTTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactc < 1:2439617‑M1/150‑34 (MQ=255) ttCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaac > 1:1487954‑M1/1‑116 (MQ=255) cAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAAACGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcaca > 1:4331504‑M1/1‑114 (MQ=255) aTAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatc > 1:1240463‑M1/1‑112 (MQ=255) aaaCATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACCCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctga < 1:3426898‑M1/150‑42 (MQ=255) aaaattcTGGAATTTAATTAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTGAATAACCGTTGCACTCTGCAAATAGGTCCTTAGGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatcagac < 1:3704386‑M1/147‑43 (MQ=255) aCATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgaca < 1:205008‑M1/150‑44 (MQ=255) aTTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaa < 1:2484960‑M1/150‑46 (MQ=255) aTTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaa < 1:2484964‑M1/150‑46 (MQ=255) aTTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaa < 1:1909003‑M1/150‑46 (MQ=255) cTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACATATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatc < 1:3878646‑M1/150‑49 (MQ=255) ggAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaa < 1:2789371‑M1/150‑51 (MQ=255) aaTTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaat > 1:4065720‑M1/1‑98 (MQ=255) aTTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatat > 1:1576775‑M1/1‑97 (MQ=255) tttAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatata < 1:4192321‑M1/150‑55 (MQ=255) tttAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatata < 1:1637799‑M1/150‑55 (MQ=255) tAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaa < 1:1987063‑M1/150‑57 (MQ=255) aaTCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtctataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaac > 1:2796627‑M1/1‑93 (MQ=255) aaTCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaac > 1:2398492‑M1/1‑93 (MQ=255) aaTCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaac > 1:2398489‑M1/1‑93 (MQ=255) aaTCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaac > 1:2398488‑M1/1‑93 (MQ=255) aTCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgataaaatcaatataaaca > 1:3302438‑M1/1‑92 (MQ=255) aTCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCCTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaaca < 1:3123329‑M1/150‑59 (MQ=255) aaaaaCAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaacagcc > 1:1626663‑M1/1‑89 (MQ=255) aGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaacagcccctccg < 1:3277328‑M1/150‑68 (MQ=255) cAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaacagcccctccggag < 1:2759326‑M1/150‑71 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |