| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_123 | = 2649 | 324 (0.300) | 205 (0.410) +GACAGGTCATAACGTGACGTGTTGATA |
109/242 | 0.0 | 56.8% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | Xen14_3 | = 166278 | 57 (0.380) | intergenic (‑142/–) | Xen14_00565/– | tRNA‑Thr(ggt)/– | |||||
Only 100 of 274 total aligned reads displayed.
TTGAAGACGACGACGTTGATAGGCCGGGTGTGTAAGCGCAGCGATGCGTTGAGCTAACCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGATGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_123/2501‑2649‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGCGGTGGTCCCACCTGACCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGACATCAAATCA < Xen14_3/166278‑166142 |||||||||||||||||||||||||||| AAGACGACGACGTTGATAGGCCGGGTGTGTAAGCGCAGCGATGCGTTGAGCTAACCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGATGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACA > 1:3965296/1‑150 AGACGACGACGTTGATAGGCCGGGTGTGTAAGCGCAGCGATGCGTTGAGCTAACCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGATGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCGGCCTGATACAGATTAAATCGACAG < 1:1250885/150‑1 CGACGACGTTGATAGGCCGGGTGTGTAAGCGCAGCGATGCGTTGAGCTAACCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGGTGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑C > 1:563886/1‑150 CGACGTTGATAGGCCGGGTGTGTAAGCGCAGCGATGCGTTGAGCTAACCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGGTGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATA < 1:1650962/150‑1 CGACGTTGATAGGCCGGGTGTGTAAGCGCAGCGATGCGTTGAGCTAACCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGATGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATA > 1:3759141/1‑150 atgGGCCGGGTGTGGAAGCGCAGTGATGCGTTGAGCTAACCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGGTGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGTGACG < 1:2892670/147‑1 ATAGGCCGGGTGTGTAAGCGCAGCGATGCGTTGAGCTAACCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGATGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGGGACG < 1:3940636/150‑1 AGGCCGGGTGTGTAAGCGCAGCGATGCGTTGAGCTAACCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGGTGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGTGACGTG < 1:531047/150‑1 AGGCCGGGTGTGTAAGCGCAGCGATGCGTTGAGCTAACCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGGTGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGTGACGTG < 1:531049/150‑1 GCCGGGTGTGTAAGCGCAGCGATGCGTTGAGCTAACCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGGTGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGTGACGTGTT < 1:3823689/150‑1 CCGGGTGTGTAAGCGCAGCGATGCGTTGAGCTAACCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGGTGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGTGACGTGTTG < 1:592391/150‑1 CGGGTGTGTAAGCGCAGCGATGCGTTGAGCTAACCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGATGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGGGACGTGTTGA > 1:641001/1‑150 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> 1:872624/1‑150 AAGCGCAGCGATGCGTTGAGCTAACCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGGTGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGTGACGTGTTGATAAAACAGA > 1:2190661/1‑150 AAGCGCAGCGATGCGTTGAGCTAACCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGGTGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGTGACGTGTTGATAAAACAGA < 1:1553643/150‑1 AGCGCAGCGATGCGTTGAGCTAACCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGATGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGGGACGTGTTGATAAAACAGAA > 1:3804265/1‑150 AGCGATGCATTGAGCTAACCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCGTACAACGCCGAAGGTGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGTGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGC < 1:2388783/150‑1 GCGTTGAGCTAACCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGATGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGGGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCG < 1:2491603/150‑1 GTTGAGCTAACCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGATGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGGGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGC > 1:1431793/1‑150 TTGAGCTAACTGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGATGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGGGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCC < 1:3434855/150‑1 TGAGCTAACCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGGTGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGTGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCT > 1:3088134/1‑150 GCTAACCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGGTGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGTGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAG > 1:42446/1‑150 GCTAACCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGATGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGGGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAG > 1:1915691/1‑150 AACCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGGTGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGTGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGC > 1:2245348/1‑150 ACCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGGTGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGTGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGCG > 1:2038901/1‑150 ACCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGGTGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGTGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGCG < 1:1798465/150‑1 ACCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGGTGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGTGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGCG > 1:238910/1‑150 ACCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGGTGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGTGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCATTAGCGCG > 1:1904698/1‑150 CCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGATGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGGGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGCGG > 1:1704425/1‑150 CGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGATGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGGGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGCGGT > 1:197293/1‑150 TACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGGTGTTTTGGCGGGTTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAAATTAAATCGACAGGT‑CATAACGTGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGCGGTGGT > 1:4028277/1‑150 ACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGGTGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGTGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGCGGTGGTC < 1:517825/150‑1 CTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGATGTTTTGGCGGATTGAGAGGAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGGGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGCGGTGGTCC > 1:2071802/1‑150 TAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGGTGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGTGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGCGGTGGTCCC > 1:3683040/1‑150 TAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGGTGTTTGGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATGAAATTGAC‑GGTGCATAACGTGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGCGGTGGTCCC 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< 1:748261/150‑1 AGCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGTGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGCGGTGGTCCCACCTGACCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCATAGCGCAGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCC > 1:2605183/1‑150 GCCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGTGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGCGGTGGTCCCACCTGACCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCA < 1:2297631/150‑1 CCTGATACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGTGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGCGGTGGTCCCACCTGACCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCAT < 1:2127531/150‑1 TACAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGGGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGCGGTGGTCCCACCTGATCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAG > 1:3817456/1‑150 acgGATTAAATCGACAGCT‑CATAATGTGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCTTTAGCGCGGTGATCCCACCTGACCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAGACGCCTTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGA < 1:3770223/147‑1 CAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGTGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGCGGTGGTCCCACCTGACCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAG < 1:457215/150‑1 CAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGTGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCCGGCGGCCTTAGCGCGGTGGTCCCACCTGACCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAG < 1:4414048/150‑1 CAGATTAAATCGACAGGT‑CATAACGGGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGCGGTGGTCCCACCTGATCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAG > 1:77322/1‑150 ATTAAATCGACAGGT‑CATAACGTGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCTTGGCGGCCTTAGCGCGGTGGTCCCACCTGACCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAG < 1:2584339/150‑1 ATCGACAGGT‑CATAACGGGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGCGGTGGTCCCACCTGATCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAAC > 1:1409204/1‑150 AGGT‑CATAACGTGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGCGGTGGTCCCACCTGACCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAG < 1:3913263/150‑1 AGGT‑CAGAACGTGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCTGCCTTAGCGCGGTGGTCCCACCTGACCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAG < 1:4041825/150‑1 GGT‑CATAACGGGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGCGGTGGTCCCACCTGATCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGg < 1:2207145/150‑2 GGT‑CATAACGGGACGTGCTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGCGGTGGTCCCACCTGATCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAG < 1:753499/135‑1 TAACGTGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGCGGTGGTCCCACCTGACCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGT > 1:1690939/1‑105 TAACGGGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGCGGTGGTCCCACCTGATCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCA < 1:1442850/150‑1 AACGGGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGCGGTGGTCCCACCTGATCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAA > 1:584054/1‑150 AACGGGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGCGGTGGTCCCACCTGATCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAA > 1:584048/1‑150 cggGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGCGGTGGTCCCACCTGATCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAAT < 1:1177998/147‑1 gcgcCGTGTTGATAAAACCGAATTTACCTGGCGACCTTCGCGCGGTGGTCCCACATGACCCCATGCCGAACTCCGACGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATG > 1:3179485/5‑120 gGACGTGTTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGCGGTGGTCCCACCTGATCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATtt < 1:1495355/149‑3 |||||||||||||||||||||||||||| TTGAAGACGACGACGTTGATAGGCCGGGTGTGTAAGCGCAGCGATGCGTTGAGCTAACCGGTACTAATGAACCGTGAGGCTTAACCTTACAACGCCGAAGATGTTTTGGCGGATTGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_123/2501‑2649‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAACAGAATTTGCCTGGCGGCCTTAGCGCGGTGGTCCCACCTGACCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGACATCAAATCA < Xen14_3/166278‑166142 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |