| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_123 | 1 = | 0 (0.000) | 580 (0.790) +GCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACAT |
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| ? | Xen14_205 | = 404 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 903 total aligned reads displayed.
CACGGTACTGGTTCACTATCGGTCAGTCAGGAGTATTTAGCCTTGGAGGATGGTCCCCCCATATTCAGACAGGATACCACGTGTCCCGCCCTACTCATCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen14_123/149‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC < Xen14_205/404‑256 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ACGGTACTGGTTCACTATCGGTCAGTCAGGAGTATTTAGCCTTGGAGGATGGTCCCCCCATATTCAGACAGGATACCACGTGTCCCGCCCTACTCATCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGCGC < 1:279642/150‑1 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1:3173468/150‑1 ATGGTCCCCCCATATTCAGACATGATACCACGTGTCCCGCCCTACTCATCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGG > 1:3647956/1‑150 CCCCCCATATTCAGACAGGATACCACGTGTCCCGCCCTACTCATCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACACTGATTCAGGCTCTGGGCTCCT > 1:2263196/1‑150 CCCCCATATTCAGACAGGATACCACGTGTCCCGCCCTACTCATCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACACTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTC > 1:1865533/1‑150 CCCATATTCAGACAGGATACCACGTGTCCCGCCCTACTCATCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCC < 1:1699812/150‑1 TATTCAGACAGGATACCACGTGTCCCGCCCTACTCATCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTT < 1:2357441/150‑1 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CATCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACACTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTT < 1:2527487/150‑1 TCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACACTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCT < 1:2670956/150‑1 GAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTT > 1:4045142/1‑150 GAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTT < 1:1950179/150‑1 GAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGAGCTGTCACCCTGTATCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACACTGATTCAGGCTCTGGGCACCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTT > 1:983840/1‑150 GCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTC > 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1:1507337/150‑1 TGTATCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACACTGATTTATGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTC < 1:3072445/150‑1 GTATCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCA > 1:2707763/1‑150 TATCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTCCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCAT < 1:559190/150‑1 ATCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTGACACACACACTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATT > 1:1133688/1‑150 TCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACACTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTC < 1:3609857/146‑1 GCGCGCCTTTCCAGACGCTTCAACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAAC < 1:3979614/150‑1 CCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATG > 1:2098704/1‑150 CCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATG > 1:764586/1‑150 CCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCC > 1:3681182/1‑137 CCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAG < 1:3809081/122‑1 CCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACATTCATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATG > 1:444157/1‑150 TCCAGACGCTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGG < 1:1559205/101‑1 CAGACGCTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCA > 1:1049823/1‑150 GACGCTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGT < 1:619277/150‑1 CTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAAT > 1:1475542/1‑150 CTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGCTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCACCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAAT > 1:1436232/1‑150 CTTCCACTAACACACACATCGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAAT < 1:3427213/150‑1 TTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATG < 1:2045696/150‑1 CATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC > 1:1111205/1‑150 ATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA > 1:531387/1‑150 |||||||||||||||||||||||||||||||||| CACGGTACTGGTTCACTATCGGTCAGTCAGGAGTATTTAGCCTTGGAGGATGGTCCCCCCATATTCAGACAGGATACCACGTGTCCCGCCCTACTCATCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen14_123/149‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC < Xen14_205/404‑256 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |