| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_10 | = 471 | 523 (2.970) | 366 (2.690) | 159/268 | 0.0 | 60.7% | intergenic (–/+246) | –/hemG | –/Protoporphyrinogen IX dehydrogenase [menaquinone] |
| ? | Xen14_23 | = 73961 | 0 (0.000) | intergenic (+235/–) | gmhB/– | D‑glycero‑beta‑D‑manno‑heptose‑1,7‑bisphosphate 7‑phosphatase/– | |||||
Only 100 of 366 total aligned reads displayed.
TGATCAAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_10/323‑471‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agattgtctgataaATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACCGGCTGTTTGTGTGAAGTG < Xen14_23/73961‑73827 TGATCAAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAA < 1:138586/150‑1 GATCAAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAAT > 1:1164093/1‑150 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1:150781/150‑1 CAAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACGTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGCTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGT > 1:1231334/1‑150 CAAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCCTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGT < 1:2511620/150‑1 CAAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCCTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGT < 1:2899745/150‑1 CAAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCCTGAGACTTAGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTat > 1:914027/1‑148 ACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCCTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAA < 1:2876490/150‑1 TCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAG < 1:3363765/150‑1 CTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGA > 1:3551424/1‑150 CTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCATATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGA > 1:1008594/1‑150 TCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCCTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGC > 1:2024375/1‑150 CAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGCTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCA > 1:718012/1‑150 CAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACNTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCA < 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TAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTCCGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGCTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGCGCAGTTGC > 1:4424070/1‑150 AAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTATGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCG > 1:3314868/1‑150 AAAGTTTGCTGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGAAGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGA > 1:2770482/1‑150 AAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGC > 1:1525111/1‑148 AGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGCTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACG > 1:3870645/1‑150 GTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGC > 1:1728046/1‑150 TGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGC < 1:2794538/150‑1 TGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTT > 1:1343941/1‑150 TGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGCTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTT > 1:865141/1‑150 TCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAG > 1:259046/1‑150 GAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCAC < 1:1773618/150‑1 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TCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTTGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGG > 1:572106/1‑150 TCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGG < 1:469602/150‑1 AATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGC > 1:4070716/1‑150 GAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGGGGCGTA < 1:679148/150‑1 CGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTAC > 1:1426333/1‑150 TGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGC < 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1:2985471/146‑1 ACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTC < 1:2412434/150‑1 gcTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTC > 1:1288107/3‑150 GTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTC > 1:3402977/1‑150 cTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCA < 1:761493/124‑1 GAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAATCCTGAAATTCAGGgttgactctgaa < 1:804021/148‑13 GAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAA > 1:3662184/1‑150 ATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACC < 1:4022673/150‑1 ATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACC < 1:2364528/150‑1 ATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACC < 1:1053879/150‑1 CTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACCGGC > 1:2245802/1‑150 AGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACCGGCTGTTT < 1:2317560/150‑1 GTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACCGGCTGTTTG < 1:2398046/150‑1 TGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACCGGCTGTTTGT < 1:643087/150‑1 GCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACCGGCTGTTTGTG > 1:1660849/1‑150 CCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACCGGCTGTTTGTGT > 1:1261022/1‑150 CCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGA‑CCGGCTGTTTGTGTG > 1:2963946/1‑150 CCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAAACGAACCGGCTGTTTGTGT > 1:3196644/1‑150 ACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACCGGCTGTTTGTGTGAA < 1:3599965/150‑1 CACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACCGGCTGTTTGTGTGAAG < 1:3929772/150‑1 ACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACCGGCTGTTTGTGTGAAGT < 1:2054489/150‑1 TGATCAAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_10/323‑471‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agattgtctgataaATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACCGGCTGTTTGTGTGAAGTG < Xen14_23/73961‑73827 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |