| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_177 | = 549 | 0 (0.000) | 26 (0.310) +GCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAAC |
23/182 | 1.6 | 60.2% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | Xen14_96 | 5541 = | 56 (0.440) | intergenic (‑234/+256) | Xen14_04570/Xen14_04571 | hypothetical protein/tRNA‑Arg(tct) | |||||
TGCTACCTGTAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_177/402‑549‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTCAGTACCAGCACCTGAA > Xen14_96/5541‑5629 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TGCTACCTGTAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGC < 1:1160954/150‑1 CCTGTAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAA < 1:3189135/150‑1 TAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACGGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAAC < 1:3182890/150‑1 TAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAACGAATGCTTTAATGACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAAC < 1:293684/150‑1 CCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAA > 1:4165182/1‑150 CATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAG > 1:2514288/1‑150 CATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAG > 1:4013514/1‑150 TACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCA > 1:462927/1‑150 ACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAG < 1:1081121/150‑1 CGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGG > 1:491390/1‑150 CGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGG > 1:491388/1‑150 GTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTT > 1:1935691/1‑150 CCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCNCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTAC < 1:3760804/150‑1 ATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTC < 1:2439617/150‑1 CAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAAACGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACA > 1:4331504/1‑150 ATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATC > 1:1240463/1‑150 aaaATTCTGGAATTTAATTAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTGAATAACCGTTGCACTCTGCAAATAGGTCCTTAGGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCAGAC < 1:3704386/147‑1 ACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACA < 1:205008/150‑1 ATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAA < 1:1909003/150‑1 ATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAA < 1:2484964/150‑1 ATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAA < 1:2484960/150‑1 AATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAAT > 1:4065720/1‑145 ATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATAT > 1:1576775/1‑150 AATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCTATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAAC > 1:2796627/1‑150 AATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAAC > 1:2398492/1‑150 AATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAAC > 1:2398489/1‑150 AATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAAC > 1:2398488/1‑150 AGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCG < 1:3277328/150‑1 CAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAG < 1:2759326/150‑1 GAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTACTAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGG > 1:2933106/1‑150 AAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGT < 1:2266427/150‑1 AATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTG > 1:1784608/1‑150 ATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGG < 1:3004596/150‑1 TACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGC < 1:846565/150‑1 CAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGATGGGCTGGAGAGTGGCGC < 1:3917152/150‑1 CAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAA < 1:2891271/106‑1 GATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCCAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTA > 1:4257976/1‑150 GAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGC < 1:2083080/150‑1 AATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCA > 1:772119/1‑150 AATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGT < 1:2455227/150‑1 AATAACCGTTGCACTCTGTAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAATAAAGTCCATAAGGGGTTTACTCACATCTGACAAAATCAAGATAAACATCTCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTG < 1:2146688/150‑1 AATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGCGGCGCTATGTACCATTGCATGGTGCCGGGTG < 1:3566639/150‑1 CCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAGAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCC < 1:2252322/150‑1 CCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCC > 1:3705412/1‑150 GCACTCTGCAAATATGTCTTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTCTACTCACATCTGACAAAAGCAATATAAACATCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTG < 1:68550/150‑1 GCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTG < 1:1084893/150‑1 GCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTG > 1:3882394/1‑150 ACTCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAA < 1:3809361/150‑1 TCTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGG < 1:2312689/127‑1 CTGCAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTC < 1:1788796/150‑1 CAAATATGTCCTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTCAGT > 1:4117320/1‑150 CTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTCAGTACCAGCACCT > 1:1112501/1‑150 CTTATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTCAGTACCAGCACCT > 1:1112500/1‑150 ATGGGCTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAACAGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTCAGTACCAGCACCTGAA < 1:1620160/150‑1 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TGCTACCTGTAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_177/402‑549‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGCCCCTCCGGAGAGGGGCTGGAGAGTGGCGCTATGTGCCATTGCATGGTGCCGGGTGCCTCCCGGTGAATTCAGTACCAGCACCTGAA > Xen14_96/5541‑5629 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |