| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_177 | 1 = | 0 (0.000) | 56 (0.480) +TATTTTTCAGATGGTGGAAAGAAC |
40/248 | 1.1 | 65.3% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | Xen14_96 | = 5308 | 71 (0.560) | intergenic (‑1/+489) | Xen14_04570/Xen14_04571 | hypothetical protein/tRNA‑Arg(tct) | |||||
ATGTTGTTTATTGTTTATTTAAATGCAGGGTGGTTTATATCTCGTCTTGTAGTTTATCCATGCATATCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen14_177/144‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGACCTTGCGGAAAAGCTGACACACAAACTGAAAGAGGGCTGGCAGCCATACGGCGGACCGG < Xen14_96/5308‑5202 |||||||||||||||||||||||| ATGTTGTTTATTGTTTATTTAAATGCAGGGTGGTTTATATCTCGTCTTGTAGTTTATCCATGCATATCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTT < 1:1714101/150‑1 GTTGTTTATTGTTTATTTAAATGCAGGGTGGTTTATATCTCGTCTTGTAGTTTATCCCTGCATATCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCCGTATTCCATGTCAGGTATTTTCAAGAATTCTTTTTC > 1:3117618/1‑150 GTTGTTTATTGTTTATTTAAATGCAGGGTGGTTTATATCTCGTCTTGTAGTTTATCCATGCATATCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTC > 1:2842487/1‑150 GTTGTTTATTGTTTATTTAAATGCAGGGTGGTTTATATCTCGTCTTGTAGTTTATCCATGCATATCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCCGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTC > 1:2934979/1‑150 TGTTTATTGTTTATTTAAATGCAGGGTGGTTTATATCTCGTCTTGTAGTTTATCCATGCATATCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAG < 1:1198768/150‑1 TGTTTATTGTTTATTTAAATGCAGGGTGGTTTATATCTCGTCTTGTAGTTTATCCATGCATATCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAG < 1:4349205/150‑1 GTTTATTGTTTATTTAAATGCAGGGTGGTTTATATCTCGTCTTGTAGTTTATCCATGCATATCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGA > 1:2147597/1‑150 TGTTTATTTAAATGCAGGGTGGTTTATATCTCGTCATGTAGTTTATCCATGCATATCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGG > 1:4426685/1‑150 GTTTATTTAAATGCAGGGTGGTTTATATCTCGTCTTGTAGTTTATCCATGCATATCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGA < 1:3238748/150‑1 GTTTATTTAAATGCAGGGTGGTTTATATCTCGTCTTGTAGTTTATCCATGCATATCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGA > 1:2049513/1‑150 ATTTAAATGCAGGGTGGTTTATATCTCGTCTTGTAGTTTATCCATGCATATCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAATGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGA > 1:3200784/1‑150 TTAAATGCAGGGTGGTTTATATCTCGTCTTGTAGTTTATCCATGCATATCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAAC < 1:4055649/150‑1 TTAAATGCAGGGTGGTTTATATCTCGTCTTGTAGTTTATCCATGCATATCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAAC < 1:4055648/150‑1 GGGTGGTTTATATCTCGTCTTGTAGTTTATCCATGCATATCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATT > 1:2365248/1‑150 GGTTTATATCTCGTCTTGTAGTTTATCCATGCATATCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAA < 1:3647913/150‑1 GTTTATATCTCGTCTTGTAGTTTATCCATGCATATCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCCGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTCTTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAAC > 1:276205/1‑150 TTTATATCTCGTCTTGTAGTTTATCCATGCATATCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACA < 1:2693852/150‑1 ATATCTCGTCTTGTAGTTTATCCATGCATATCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTA < 1:747807/150‑1 TATCTCGTCTTGTAGTTTATCCATGCATATCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTAT < 1:2575113/150‑1 TCTCGTCTTGTAGTTTATCCATGCATATCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGA < 1:1941597/150‑1 GTCTTGTAGTTTAACCATGCATATCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTACTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTT > 1:1930659/1‑150 TTGTAGTTTATCCATGCATATCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTC > 1:119442/1‑150 GCATATCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCG < 1:1486821/150‑1 ATATCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTC < 1:1985696/150‑1 ATCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAG < 1:594010/150‑1 ATCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAG < 1:594009/150‑1 TCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGA > 1:20861/1‑150 CTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTT < 1:2203364/150‑1 TGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGC > 1:3529040/1‑150 ATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGG < 1:1582817/150‑1 ATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGG < 1:4156993/150‑1 TGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTGTTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAA > 1:2270437/1‑150 TGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAA > 1:4067195/1‑150 gatGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTTTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGGGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAG < 1:2217705/147‑1 AGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTTTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGC < 1:4218069/150‑1 GTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGCTG < 1:4418157/150‑1 GTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCG < 1:3323657/129‑1 TTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTCTTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGTTGGAAAGAACCATGGCATTTACACACTATTATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGCT > 1:1477188/1‑148 TTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCATCAGATCTTGCGGAAAAGCTGA > 1:2570721/1‑150 gaatgttcatGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGCTGAC < 1:2112925/140‑1 TTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTC > 1:2427220/1‑129 TTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGCTGACAC > 1:870701/1‑150 ATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAACGAACCATGGCATTTAACCACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGCTGACACAt > 1:3449536/1‑149 ATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTCAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGCTGACACAt > 1:3831405/1‑149 ATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCTTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGCTGACACAt < 1:3551133/150‑2 ATTTAAGGTATGGTTTTATGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTATCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAG > 1:168878/1‑141 AAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGCTGACACATAAAC < 1:2693399/150‑1 AAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGC < 1:3981380/117‑1 AGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTCCATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGCTGACACATAAACT > 1:959186/1‑150 GGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTGCATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGCTGACACATAAACTG < 1:720951/150‑1 GGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGCTGACACATAAACTGAAAGA > 1:435373/1‑150 GTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGCTGACACATAAACTGAAAGAG > 1:777880/1‑150 TTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGCTGACACATAAACTGAAAGAGG < 1:4003423/150‑1 TTTGTGTTTTTTCTGTATTACGTGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGCTGACACATAAACTGAAAGAGGG > 1:3569587/1‑150 TTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGCTGACACATAAACTGAAAGAGGG < 1:3855659/150‑1 TTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGCTGACACATAAACTGAAAGAGGG < 1:3012926/150‑1 TTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCCGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGCTGACACATAAACTGAAAGAGGGC > 1:234859/1‑150 TTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCCGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGCTGACACATAAACTGAAAGAGGGC > 1:234858/1‑150 TGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGCTGACACATAAACTGAAAGAGGGCTGG > 1:3343778/1‑150 GTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGCTGACACATAAACTGAAAGAGGGCTGGC > 1:1072429/1‑150 GTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAG > 1:2911205/1‑122 TTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGCTGACACATAAACTGAAAGAGGGCTGGCAGC < 1:262596/150‑1 TCTGTATTACGTGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGCTGACACATAAACTGAAAGAGGGCTGGCAGCCgt < 1:1674403/150‑3 CTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGCTGACACATAAACTGAAAGAGGGCTGGCAGCCgtt > 1:648119/1‑147 CTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGCTGACACATAAACTGAAAGAGGGCTGG < 1:445363/142‑1 GTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGCTGACACATAAACTGAAAGAGGGCTGGCAGCCgtttg < 1:2715848/150‑6 TACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGCTGACACATAAACTGAAAGAGGGCTGGCAGCCgtttggtag < 1:3670201/150‑10 TACATGTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTAGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGCTGACACATAAACTGAAAGAGGGCTGGCAGCCgtttggtag > 1:3900987/1‑141 GTCAGGTATTTTAAAGAATTATTTTTCAGATGGTGGAAAGAACCATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGATCTTGCGGAAAAGCTGACACATAAACTGAAAGAGGGCTGGCAGCCgtttggtagtccgg > 1:3239745/1‑136 |||||||||||||||||||||||| ATGTTGTTTATTGTTTATTTAAATGCAGGGTGGTTTATATCTCGTCTTGTAGTTTATCCATGCATATCTGCTTGATGATGAGGTTTTTATTTAAGGTATGGTTTTGTGTTTTTTCTGTATTACATGTCAGGTATTTTAAAGAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen14_177/144‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CATGGCATTTAAACACTATGATGTTGTCAGGGCGGCGTCGCCGTCAGACCTTGCGGAAAAGCTGACACACAAACTGAAAGAGGGCTGGCAGCCATACGGCGGACCGG < Xen14_96/5308‑5202 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |