| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_184 | = 473 | 0 (0.000) | 40 (0.100) | 24/234 | 1.8 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | Xen14_60 | 32 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+159) | –/hisI | –/Histidine biosynthesis bifunctional protein HisIE | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTTTACTTCAAATGAATGTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGCAACAACATCACA > Xen14_60/1‑173 | gaaagttgaaagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGgc < 1:987141‑M2/49‑1 (MQ=255) agttgaaagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCa > 1:2383025‑M2/99‑150 (MQ=255) gttgaaagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCAt < 1:1530583‑M2/53‑1 (MQ=255) ttgaaagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATc < 1:2569884‑M2/54‑1 (MQ=255) tgaaagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCt < 1:3381562‑M2/55‑1 (MQ=255) tgaaagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCt < 1:1753846‑M2/55‑1 (MQ=255) aagagttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTAt > 1:2026242‑M2/93‑150 (MQ=255) agttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCg < 1:2808329‑M2/61‑1 (MQ=255) agttttgccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCg < 1:883877‑M2/61‑1 (MQ=255) ccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACg > 1:870868‑M2/83‑150 (MQ=255) ccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACg > 1:870871‑M2/83‑150 (MQ=255) ccgtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACg < 1:1971322‑M2/68‑1 (MQ=255) gtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACgtg > 1:327983‑M2/81‑150 (MQ=255) gtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACgtg < 1:2820466‑M2/70‑1 (MQ=255) gtagaaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACgtg > 1:327982‑M2/81‑150 (MQ=255) aaatgatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGtt < 1:2367208‑M2/74‑1 (MQ=255) gatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTgaga < 1:2231670‑M2/78‑1 (MQ=255) gatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTgaga > 1:2887212‑M2/73‑150 (MQ=255) gatgcctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTgaga > 1:3487547‑M2/73‑150 (MQ=255) ctgcatgaccagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaacgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAAtg < 1:2176650‑M2/83‑1 (MQ=255) atgaccagccaggtaatgatttacagcggccagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTa < 1:947305‑M2/87‑1 (MQ=255) cagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCAc < 1:1863319‑M2/92‑1 (MQ=255) cagccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCAc < 1:1863314‑M2/92‑1 (MQ=255) agccaggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACg < 1:3517925‑M2/93‑1 (MQ=255) caggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcatacactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATa > 1:1336171‑M2/55‑150 (MQ=255) caggtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATa > 1:1336172‑M2/55‑150 (MQ=255) gtaatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGc < 1:3319919‑M2/99‑1 (MQ=255) aatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCtt > 1:1056563‑M2/50‑150 (MQ=255) aatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCtt > 1:1056568‑M2/50‑150 (MQ=255) aatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCtt > 1:1056564‑M2/50‑150 (MQ=255) aatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCtt > 1:1056569‑M2/50‑150 (MQ=255) aatgatttacagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCtt > 1:1056570‑M2/50‑150 (MQ=255) acagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCg < 1:2630519‑M2/109‑1 (MQ=255) acagcggcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCg < 1:3599292‑M2/109‑1 (MQ=255) gcaagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAAt > 1:1295859‑M2/36‑150 (MQ=255) caagttttgcttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATg < 1:2514354‑M2/116‑1 (MQ=255) caagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATg < 1:2514353‑M2/116‑1 (MQ=255) caagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATg < 1:60013‑M2/116‑1 (MQ=255) caagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATg < 1:60014‑M2/116‑1 (MQ=255) caagttttacttcaaatgaatgtttcataaactgTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATg < 1:2412532‑M2/116‑1 (MQ=255) ttttACTTCAAAGGAATGTTTCATAAACTGTACTCTCAGATGTCAGATTATTTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGGTAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTc < 1:3616941/150‑1 (MQ=37) tttACTTCAAATGAATGTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTcc > 1:2215131/1‑150 (MQ=255) cTTCAAATGAATGTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAAAATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGgt > 1:3728424/1‑150 (MQ=255) aaaTGAATGTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTATGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTgg < 1:280349/150‑1 (MQ=255) aatgaatgTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGc < 1:2285504/150‑1 (MQ=255) gTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGCAacaaca > 1:681227/1‑150 (MQ=255) tttCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGCAACAACAt > 1:3595356/1‑150 (MQ=255) cATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGCAACAACATcac > 1:2447175/1‑150 (MQ=255) cATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGCAACAACATcac < 1:236855/150‑1 (MQ=255) aTAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGCAACAACATcaca < 1:1649297/150‑1 (MQ=255) aTAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATATGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGCAACAACATcaca < 1:377184/150‑1 (MQ=255) aTAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATATGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGCAACAACATcaca < 1:377181/150‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTTTACTTCAAATGAATGTTTCATAAACTGTACCTTCAGATGTCAGATTATGTCCAACATTTGGGGTGCAGTTCATGGCGCATCTTATCCGGCCTACGTGTGTTGAGATAATGTGTAGGCACGATAAGCTTGCGCATCGGGCAATGGCTCCGGGTGTGGCAACAACATCACA > Xen14_60/1‑173 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |