| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_168 | 1 = | 0 (0.000) | 61 (0.100) | 37/246 | 2.1 | 100% | intergenic (–/+59) | –/Xen14_04774 | –/IS200/IS605 family transposase IS200C |
| ? | Xen14_80 | 26 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+67) | –/arcA | –/Aerobic respiration control protein ArcA | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTTAGGGCGCGGCTGGTAAGAGAGCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAGAAGCGATAACCTTCACCGTGAATGGTGGCGATGATTTCCGGCGTATCCGGCGTAGATTCGA > Xen14_80/1‑175 | ttccctatccgggcagcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGAc > 1:390143‑M2/98‑150 (MQ=255) tccctatccgggcagcccgtttgcgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACg > 1:2394475‑M2/97‑150 (MQ=255) tccctatccgggcagcccgtttgcgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACg > 1:2394470‑M2/97‑150 (MQ=255) cctatccgggcagcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACggt < 1:2934627‑M2/56‑1 (MQ=255) cctatccgggcagcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACggt > 1:708395‑M2/95‑150 (MQ=255) tatccgggcagcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACggtgg < 1:983673‑M2/58‑1 (MQ=255) tatccgggcagcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACggtgg < 1:322691‑M2/58‑1 (MQ=255) tatccgggcagcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACggtgg < 1:3448300‑M2/58‑1 (MQ=255) gcagcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGcc > 1:2138061‑M2/86‑150 (MQ=255) cagcccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCg > 1:3635227‑M2/85‑150 (MQ=255) cccgtttacgggccgtaagtaacgaatttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGACTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGAtt < 1:3707910‑M2/69‑1 (MQ=255) cccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGAtt > 1:3110973‑M2/82‑150 (MQ=255) cccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGAtt > 1:408584‑M2/82‑150 (MQ=255) cccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGAtt < 1:3748052‑M2/69‑1 (MQ=255) ccgtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTa < 1:1171765‑M2/70‑1 (MQ=255) gtttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAAt < 1:3400553‑M2/72‑1 (MQ=255) tttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATc < 1:3198836‑M2/73‑1 (MQ=255) tttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATc < 1:3592074‑M2/73‑1 (MQ=255) tttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATc < 1:1709538‑M2/73‑1 (MQ=255) tttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATc < 1:1709534‑M2/73‑1 (MQ=255) tttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATc < 1:1709531‑M2/73‑1 (MQ=255) tttacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATc < 1:2841212‑M2/73‑1 (MQ=255) tacgggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAAACTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCtt > 1:3147530‑M2/76‑150 (MQ=255) ggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATc < 1:869319‑M2/73‑1 (MQ=255) ggccgtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAg < 1:1343920‑M2/79‑1 (MQ=255) gtaagtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCa < 1:2109636‑M2/83‑1 (MQ=255) gtaacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAGAACCCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGc > 1:3253310‑M2/64‑150 (MQ=255) aacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAg > 1:903237‑M2/62‑150 (MQ=255) aacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAg > 1:2728059‑M2/62‑150 (MQ=255) aacgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAg > 1:2728057‑M2/62‑150 (MQ=255) cgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCTGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAGaa < 1:3009872‑M2/91‑1 (MQ=255) cgaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAGaa < 1:3009871‑M2/91‑1 (MQ=255) gaagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAGAAg > 1:3335069‑M2/59‑150 (MQ=255) aagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGTTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAGAAGc < 1:308987‑M2/93‑1 (MQ=255) aagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAGAAGc < 1:2584860‑M2/93‑1 (MQ=255) aagttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctggtagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAGAAGc < 1:308986‑M2/93‑1 (MQ=255) gttggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATCAATCTTCCAGATCACCGCAGAAGCGa > 1:3799063‑M2/56‑150 (MQ=255) tggatgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAGAAGCGATa > 1:2731170‑M2/54‑150 (MQ=255) atgcaaatgtcagatcgtgtgcgcctgttagggcgcggctggtaagagagCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAGAAGCGATAAcc < 1:728040‑M2/100‑1 (MQ=255) 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ccTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAGAAGCGATAACCTTCACCGTGAATGGTGGCGATGATTTCCGGCGTATCCGGCGTAGATTCGa > 1:438116/1‑150 (MQ=255) ccTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAGAAGCGATAACCTTCACCGTGAATGGTGGCGATGATTTCCGGCGTATCCGGCGTAGATTCGa < 1:1561576/150‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTTAGGGCGCGGCTGGTAAGAGAGCCTTATAGGCGCATTTGAAAAACCTCCGGCTATGCCGGAGGATATTTATTGACGGTGGTAAAGCCGATTAATCTTCCAGATCACCGCAGAAGCGATAACCTTCACCGTGAATGGTGGCGATGATTTCCGGCGTATCCGGCGTAGATTCGA > Xen14_80/1‑175 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |