| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_166 | = 685 | 0 (0.000) | 2909 (2.810) | 238/244 | -0.0 | 95.4% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | Xen14_17 | = 79810 | 283 (2.070) | coding (460/741 nt) | Xen14_02064 | IS4 family transposase ISEc13 | |||||
Only 100 of 3991 total aligned reads displayed.
CGCCAGTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGTAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCTCCCTGCCGCAGGCCCAGCACCCGCACCGCGATAACCACCATGCGCTCAAGGTTATCCCGGGTCTGCATTCGCAGCGATTCCACACATGTACCACCACTTTTCCACGCTTTGTGGTATTCCTCTATCAGCCAGCGTTGCTCGTAATGGCTGACGATAC > Xen14_17/79661‑79959 | gCCAGTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGc > 1:1099346/1‑150 (MQ=255) gCCAGTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGc > 1:2111574/1‑150 (MQ=255) ccAGTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCa > 1:1325717/1‑150 (MQ=255) aGTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAgg < 1:2916010/150‑1 (MQ=255) gTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCATAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGc > 1:2707310/1‑150 (MQ=255) gTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGc < 1:3131689/150‑1 (MQ=255) gTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGc < 1:3686811/150‑1 (MQ=255) tttCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGcc > 1:2180439/1‑150 (MQ=255) ttCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGccc < 1:604763/150‑1 (MQ=255) tCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGCCCa > 1:3244585/1‑150 (MQ=255) cAGACAGGCCCATTTCAGTGTCTGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGCCCAg > 1:1912519/1‑150 (MQ=255) aaaCAGGCCCATTTCATGGTCGGTGTTTGCGCCGGAAGCTGCTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGTAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCTCCCTGCCGCAGGCCCAGc < 1:1648260/148‑1 (MQ=255) cAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGCCCAGCAcc < 1:1390925/150‑1 (MQ=255) cAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGCCCAGCAcc < 1:2408633/150‑1 (MQ=255) ggCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCATCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGCCCAGCACCCg > 1:3384095/1‑150 (MQ=255) gCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCATTGATACCGCCCTGCCGCAGGCCCAGCACCCGc < 1:814598/150‑1 (MQ=255) cccATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGCCCAGCACCCGCa > 1:3354600/1‑150 (MQ=255) ttCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGCCCAGCACCCGCACcgcg < 1:3174347/150‑1 (MQ=255) tctatttgtaTCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGCCCAGCACCCGCACCGCGATa < 1:1199370/141‑1 (MQ=255) aGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGACACCGCCCTGCCGCAGGCCCAGCACCCGCACCGCGATa < 1:3208435/150‑1 (MQ=255) gtgtCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGCCCAGCACCCGCACCGCGATaa > 1:929493/1‑150 (MQ=255) gtgtCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGCAGGCCCAGCACCCGCACCGCGATaa < 1:1271518/150‑1 (MQ=255) cGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgc < 1:2494263‑M2/150‑31 (MQ=255) gCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCATCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgcct < 1:636178‑M2/150‑33 (MQ=255) cATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgcctt > 1:2350253‑M2/1‑117 (MQ=255) cTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCATCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgat > 1:1978199‑M2/1‑114 (MQ=255) tgtgACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgata < 1:3030537‑M2/150‑38 (MQ=255) tgtgACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCATCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgata > 1:1688302‑M2/1‑113 (MQ=255) cGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccac > 1:1057930‑M2/1‑108 (MQ=255) gAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccacca > 1:1567450‑M2/1‑106 (MQ=255) gtgtgcttccagcttAACCCACGGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctc > 1:2216694‑M2/6‑99 (MQ=255) tttCCTTCCAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcg < 1:2954576‑M2/150‑53 (MQ=255) cttccAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggt > 1:3646790‑M2/1‑94 (MQ=255) cttccAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgcctt > 1:2320917‑M2/1‑94 (MQ=255) ttccAGCTTAACTCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCCGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataatcaccatgcgctcgaggtt > 1:411055‑M2/1‑93 (MQ=255) tccAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggtta < 1:351924‑M2/150‑59 (MQ=255) tccAGCTTAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTCCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgcattgataaccaccatgcgctcgaggtta < 1:778747‑M2/150‑59 (MQ=255) ttAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgg < 1:2379324‑M2/150‑65 (MQ=255) tAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccggg > 1:146242‑M2/1‑85 (MQ=255) tAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccggg < 1:228994‑M2/150‑66 (MQ=255) tAACCCACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATCTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccggg < 1:886895‑M2/150‑66 (MQ=255) cccACAGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtct < 1:2648967‑M2/150‑69 (MQ=255) acaGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgca > 1:3553049‑M2/1‑79 (MQ=255) acaGCAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgca > 1:1939906‑M2/1‑79 (MQ=255) agcagtttcCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcatt > 1:1612662‑M2/4‑77 (MQ=255) agtTTCCATTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgc < 1:3063303‑M2/150‑77 (MQ=255) agtTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgc > 1:3418563‑M2/1‑74 (MQ=255) agtTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgc < 1:3321639‑M2/150‑77 (MQ=255) gtTTCCACTCTGTCGGCATCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgca < 1:2140073‑M2/150‑78 (MQ=255) tttCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcag < 1:2736681‑M2/150‑79 (MQ=255) tttCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcag < 1:1797137‑M2/150‑79 (MQ=255) ttCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagc > 1:1830716‑M2/1‑71 (MQ=255) ttCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagc > 1:852123‑M2/1‑71 (MQ=255) ttCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggtta > 1:3610688‑M2/1‑71 (MQ=255) cACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgat > 1:1001339‑M2/1‑68 (MQ=255) ctGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcat > 1:483088‑M2/1‑64 (MQ=255) tGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccac > 1:2604861‑M2/1‑63 (MQ=255) tCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggcctgcattcgcagcgattccacac > 1:1300307‑M2/1‑61 (MQ=255) gTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgta < 1:1418743‑M2/150‑95 (MQ=255) cAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtacc > 1:3782528‑M2/1‑54 (MQ=255) aGTATTTTCTCGCAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtacca < 1:973466‑M2/150‑98 (MQ=255) gTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccac < 1:3284222‑M2/150‑99 (MQ=255) tATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccacc > 1:2076340‑M2/1‑51 (MQ=255) tATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccacc > 1:1881529‑M2/1‑51 (MQ=255) aTTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGNTACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtcngcattngcagcgattccacacatgnaccacca < 1:2009730‑M2/150‑101 (MQ=255) aTTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatctcgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccacca < 1:2554414‑M2/150‑101 (MQ=255) ttttCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCTCCCTGCCGCAGGCCCAGCACCCGCACCGCGATAACCACCATGCGCTCAAGGTTATCCCGGGtatg > 1:3482511/1‑103 (MQ=255) tttCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatccagggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccact < 1:3717791‑M2/150‑103 (MQ=255) ttCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccactt < 1:3103940‑M2/150‑104 (MQ=255) tcACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttc > 1:123086‑M2/1‑44 (MQ=255) tcACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttc > 1:3825811‑M2/1‑44 (MQ=255) tcACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttc > 1:114245‑M2/1‑44 (MQ=255) cacaGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCTCCCTGCCGCAGGCCCAGCACCCGCACCGCGATAACCACCATGCGCTCAAGGTTATCCCGGGTCTGCATTCGCAGCGATTCCACACATGTACCACCACTTTTCCACGCTTtgtagt > 1:1731064/1‑147 (MQ=255) cacaGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttcc > 1:1033095‑M2/1‑43 (MQ=255) caGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccac > 1:2773415‑M2/1‑41 (MQ=255) caGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccac < 1:267998‑M2/150‑110 (MQ=255) caGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccac > 1:702370‑M2/1‑41 (MQ=255) cTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccac > 1:2994618‑M2/1‑38 (MQ=255) ttttGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtgg > 1:1531149‑M2/1‑32 (MQ=255) tttGTGTTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggt < 1:2850804‑M2/150‑120 (MQ=255) gtgtTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggtatt > 1:2448583‑M2/1‑28 (MQ=255) tgtTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccatgccttgtggtattc < 1:3451770‑M2/150‑124 (MQ=255) tgtTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggtatt < 1:514087‑M2/149‑123 (MQ=255) gtTTCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaccgccttgatacccaccctgtgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggtattcc < 1:668981‑M2/150‑125 (MQ=255) tttCTTCACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggtattcct < 1:2891257‑M2/150‑126 (MQ=255) tcttcACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggtattcctct < 1:2257961‑M2/150‑128 (MQ=255) cttcACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggtattcctcta < 1:2043162‑M2/150‑129 (MQ=255) cACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggtattcctctatca < 1:1858533‑M2/150‑132 (MQ=255) cACTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggtattcctctatca > 1:1495580‑M2/1‑19 (MQ=255) cTGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggtattcctctatcagc > 1:3575295‑M2/1‑17 (MQ=255) tGATACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccttgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggtattcctctatcagcc > 1:442568‑M2/1‑16 (MQ=255) aTACCGCCCTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggtattcctcgatcagccag > 1:1357810‑M2/1‑14 (MQ=255) ccgccctgcCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggtattcctctatcagccagcgt < 1:2810017‑M2/147‑140 (MQ=255) gccctGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgtcttgataacgaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggtattcctctatcagccagcgtcg > 1:733701‑M2/2‑9 (MQ=255) gccctGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggtattcctctatcagccagcgtcg > 1:56559‑M2/2‑9 (MQ=255) cccTGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggtattcctctatcagccagcgtcgc > 1:2522317‑M2/1‑8 (MQ=255) tGCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggtattcctctatcagccagcgtcgctcg > 1:1765896‑M2/1‑5 (MQ=255) gCCGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggtattcctctatcagccagcgtcgctcgt < 1:3750920‑M2/150‑147 (MQ=255) ccGcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggtattcctctatcagccagcgtcgctcgta > 1:53825‑M2/1‑3 (MQ=255) gcaggcccagcacccgcaccgcgataaacgccttgataaccaccatgcgctcgaggttatcccgggtctgcattcgcagcgattccacacatgtaccaccacttttccacgccttgtggtattcctctatcagccagcgtcgctcgtaat > 1:1164703‑M2/1‑1 (MQ=255) | CGCCAGTTTCAGACAGGCCCATTTCAGTGTCGGCATCTGTGACGGAAGCGGTTTTCCTTCCAGCTTAACCCACAGTAGTTTCCACTCTGTCGGCGTCAGTATTTTCTCACAGCTGTCATTTTGTGTTTCTTCACTGATACCTCCCTGCCGCAGGCCCAGCACCCGCACCGCGATAACCACCATGCGCTCAAGGTTATCCCGGGTCTGCATTCGCAGCGATTCCACACATGTACCACCACTTTTCCACGCTTTGTGGTATTCCTCTATCAGCCAGCGTTGCTCGTAATGGCTGACGATAC > Xen14_17/79661‑79959 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |