| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_163 | = 753 | 0 (0.000) | 95 (0.540) | 52/294 | 0.3 | 67.4% | intergenic (‑125/–) | ompX_3/– | Outer membrane protein X/– |
| ? | Xen14_170 | = 168 | 92 (0.950) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
ACAATCCGTGGTAAATGTTCTTCAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAAGCTGATTTCATTCGCTACGAACGCCCTGTTCCCGGTGATCGGGTTCAGATGGATACCTGTTAAATTGGCCCCGGCTTATATCAGTACACATC > Xen14_170/19‑313 | cGTGGTAAATGTTCTTCAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAg < 1:2309427/150‑1 (MQ=255) aaTGTTCTTCAAAGTGAAGATGTAAAACTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTg < 1:2719190/150‑1 (MQ=255) gTTCTTCAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCa < 1:419417/150‑1 (MQ=255) gTTCTTCAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCa > 1:3078821/1‑150 (MQ=255) gTTCTTCAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCAATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCa > 1:715887/1‑150 (MQ=255) ttcttcAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAGATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAg < 1:1722396/150‑1 (MQ=255) cttcAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGGGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtg < 1:1794356‑M2/150‑20 (MQ=255) cttcAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtg < 1:535182‑M2/150‑20 (MQ=255) cttcAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtg < 1:1747594‑M2/150‑20 (MQ=255) 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ttcAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAAt > 1:1879623/1‑150 (MQ=255) tcAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATc > 1:3783870/1‑150 (MQ=255) aaaGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAg > 1:1978046/1‑150 (MQ=255) gTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgta > 1:856094‑M2/1‑124 (MQ=255) tGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgacc < 1:2635489‑M2/145‑23 (MQ=255) 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gCTTCGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgaccaaaaaagcggcttccgg < 1:1697433‑M2/150‑40 (MQ=255) gCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGTGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTa < 1:444139/150‑1 (MQ=255) tCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAAt < 1:3699689/150‑1 (MQ=255) cGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgaccaaaaaagcggcttccggcatc < 1:1926337‑M2/150‑44 (MQ=255) cGGTGATCCAGGTCCGGTATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgaccaaaaaagcggcttccggcatc < 1:2434490‑M2/150‑44 (MQ=255) 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aaaCAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAAGCTGATTTCATTCGCTACGAACGCCCTGTTCCCGGTGATCGGGTTCAGATGGATACCTGTTAAAt > 1:3200061/1‑150 (MQ=255) cagaccagacGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAAGCTGATTTCATTCGCTACGAACGCCCTGTTCCCGGTGATCGGGTTCAGATGGATACCTGTTAAATTgg < 1:1667459/150‑1 (MQ=255) agaccagacGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAAGCTGATTTCATTCGCTACGAACGCCCTGTTCCCGGTGATCGGGTTCAGATGGATACCTGTTAAATTGGc > 1:390497/1‑150 (MQ=255) agaccagacGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAAGCTGATTTCATTCGCTACGAACGCCCTGTTCCCGGTGATCGGGTTCAGATGGATACCTGTTAAATTGGc < 1:3525924/150‑1 (MQ=255) gaccagacGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAAGCTGATTTCATTCGCTACGAACGCCCTGTTCCCGGTGATCg < 1:517113/121‑1 (MQ=255) gaccagacGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAAGCTGATTTCATTCGCTACGAACGCCCTGTTCCCGGTGATCg < 1:1259171/121‑1 (MQ=255) ccagacGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgaccaaaaaagcggcttccggcatcagtattcgttgaaatatttataaccccaataaatggcgtcaggaatgacgccttttttattgcagaaaagcgagaggtaatt < 1:1720783‑M2/150‑126 (MQ=255) cagacGGTTCAGATGAGGCGCTTACAAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAAGCTGATTTCATTCGCTACGAACGCCCTGTTCCCGGTGATCGGGTTCAGATGGATACCTGTTAAATTGGCCCCg < 1:2677292/150‑1 (MQ=255) gacGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAAGCTGATTTCATTCGCTACGAACGCCCTGTTCCCGGTGATCGGGTTCAGATGGATACCTGTTAAATTGGCCCCGGc > 1:821638/1‑150 (MQ=255) gacGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAAGCTGATTTCATTCGCTACGAACGCCCTGTTCCCGGTGATCGGGTTCAGATGGATACCTGTTAAATTGGCCCCGGc < 1:961405/150‑1 (MQ=255) acGGTTCAGATGAGGCGCTTAcgactgtacggtgattgtgaccaaaaaagcggcttccggcatcagtattcgttgaaatatttataaccccaataaatggcgtcaggaatgacgccttttttattgcagaaaagcgagaggtaattatgc > 1:1542550‑M2/1‑21 (MQ=255) 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ACAATCCGTGGTAAATGTTCTTCAAAGTGAAGACGTAAAGCTTCGGTGATCCAGGTCCGATATTCCATACGATAGTGTCCATTAAAAATGATGGACATTATTTTTGTGGAGCCGGAGGAAACAGACCAGACGGTTCAGATGAGGCGCTTACCAAAGTCCTTTGCCAGAATCAGGTTAAACCTGTTGTTAAATTTCGGCGTGAAGCTGATTTCATTCGCTACGAACGCCCTGTTCCCGGTGATCGGGTTCAGATGGATACCTGTTAAATTGGCCCCGGCTTATATCAGTACACATC > Xen14_170/19‑313 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |