| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_148 | = 989 | 0 (0.000) | 37 (0.590) | 23/202 | 0.3 | 100% | intergenic (‑92/–) | Xen14_04761/– | hypothetical protein/– |
| ? | Xen14_182 | = 431 | 0 (0.000) | intergenic (+22/–) | Xen14_04782/– | hypothetical protein/– | |||||
GCAGGACAGGGTAATCACACAGGTGGTGATACTGGATACAGATAAAAAGCTGATACAGTGTGTGGTAAGACCGCTGCAAATCCTGCGTGCTGACGGGACGTGGGAAAATATTGGCGGGATGAAATAGCCGACGGGTTCACAAAAAAACCGGAGTCCGG‑CTCCGGTTTTTGTTGTCATGCCATGGTGATGTTTGTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_182/283‑478 | gCAGGACAGGGTAATCACACAGGTTGTGATACTGGATACAGATAAAAAGCTGATACAGTGTGTGGTAAGACCGCTGCAAATCCTGCGTGCTGACGGGACGTGGGAAAATATTGGCGGGATGAAATAGCCGACGGGTTCACAAAAAAACCg < 1:2565827/150‑1 (MQ=255)gCAGGACAGGGTAATCACACAGGTGGTGATACTGGATACAGATAAAAAGCTGATACAGTGTGTGGTAAGACCGCTGCAAATCCTGCGTGCTGACGGGACGTGGGAAAATATTGGCGGGATGAAATAGCCGACGGGTTCACAAAAAAACCg < 1:3421231/150‑1 (MQ=255) gccgcatgggTAATCACACAGGTGGTGATACTGGATACAGATAAAAAGCTGATACAGTGTGTGGTAAGACCGCTGCAAATCCTGCGTGCTGACGGGACGTGGGAAAATATTGGCGGGATGAAATAGCCGACGGGTTCACAAAAAAACCgg < 1:3780998/143‑1 (MQ=255) ggACAGGGTAATCACACAGGTGGTGATACTGGATACAGATAAAAAGCTGATACAGTGTGTGGTAAGACCGCTGCAAATCCTGCGTGCTGACGGGACGTGGGAAAATATTGGCGGGATGAAATAGCCGACGGGTTCACAAAAAAATCGGAg < 1:3227457/150‑1 (MQ=255) ggACAGGGTAATCACACAGGTGGTGATACTGGATACAGATAAAAAGCTGATACAGTGTGTGGTAAGACCGCTGCAAATCCTGCGTGCTGACGGGACGTGGGAAAATATTGGCGGGATGAAATAGCCGACGGGTTCACAAAAAAACCGGAg > 1:1111721/1‑150 (MQ=255) ggACAGGGTAATCACACAGGTGGTGATACTGGATACAGATAAAAAGCTGATACAGTGTGTGGTAAGACCGCTGCAAATCCTGCGTGCTGACGGGACGTGGGAAAATATTGGCGGGATGAAATAGCCGACGGGTTCACAAAAAAACCGGAg > 1:1111722/1‑150 (MQ=255) ggACAGGGTAATCACACAGGTGGTGATACTGGATACAGATAAAAAGCTGATACAGTGTGTGGTAAGACCGCTGCAAATCCTGCGTGCTGACGGGACGTGGGAAAATATTGGCGGGATGAAATAGCCGACGGGTTCACAAAAAAACCGGAg > 1:1700269/1‑150 (MQ=255) ggACAGGGTAATCACACAGGTGGTGATACTGGATACAGATAAAAAGCTGATACAGTGTGTGGTAAGACCGCTGCAAATCCTGCGTGCTGACGGGACGTGGGAAAATATTGGCGGGATGAAATAGCCGACGGGTTCACAAAAAAAACGGAg > 1:3326613/1‑150 (MQ=255) aGGGTAATCACACAGGTGGTGATACTGGATACAGATAAAAAGCTGATACAGTGTGTGGTAAGACCGCTGCAAATCCTGCGTGCTGACGGGACGTGGGAAAATATTGGCGGGATGAAATAGCCGACGGGTTCACAAAAAAACCGGAGTCCg < 1:489273/150‑1 (MQ=255) aGGGTAATCACACAGGTGGTGATACTGGATACAGATAAAAAGCTGATACAGTGTGTGGTAAGACCGCTGCAAATCCTGCGTGCTGACGGGACGTGGGAAAATATTGGCGGGATGAAATAGCCGACGGGTTCACAAAAAAACCGGAGTCCg < 1:489272/150‑1 (MQ=255) aGGGTAATCACACAGGTGGTGATACTGGATACAGATAAAAAGCTGATACAGTGTGTGGTAAGACCGCTGCAAATCCTGCGTGCTGACGGGACGTGGGAAAATATTGGCGGGATGAAATAGCCGACGGGTTCACAAAAAAACCGGAGTCCg < 1:489269/150‑1 (MQ=255) ggTAATCACACAGGTGGTGATACTGGATACAGATAAAAAGCTGATACAGTGTGTGGTAAGACCGCTGCAAATCCTGCGTGCTGACGGGACGTGGGAAAATATTGGCGGGATGAAATAGCCGACGGGTTCACAAAAAAACCGGAGTCCGG‑c < 1:3528148/150‑1 (MQ=255) ggTAATCACACAGGTGGTGATACTGGATACAGATAAAAAGCTGATACAGTGTGTGGTAAGACCGCTGCAAATCCTGCGTGCTGACGGGACGTGGGAAAATATTGGCGGGATGAAATAGCCGACGGGTTCACAAAAAAACCGGAGTCCGG‑c < 1:1692745/150‑1 (MQ=255) 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GCAGGACAGGGTAATCACACAGGTGGTGATACTGGATACAGATAAAAAGCTGATACAGTGTGTGGTAAGACCGCTGCAAATCCTGCGTGCTGACGGGACGTGGGAAAATATTGGCGGGATGAAATAGCCGACGGGTTCACAAAAAAACCGGAGTCCGG‑CTCCGGTTTTTGTTGTCATGCCATGGTGATGTTTGTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_182/283‑478 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |