| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_145 | 1 = | 0 (0.000) | 51 (0.180) +GGAGGCAATTGCAATATCTCTGTGAACTTACAC |
36/230 | 0.7 | 58.0% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | Xen14_86 | = 3481 | 95 (1.040) | coding (44/213 nt) | Xen14_04476 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 179 total aligned reads displayed.
CTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATAAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTTCAGCATGGATTGAGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCTTTTGGTGTTCATGCCTGAGACAGATAGCCTCA > Xen14_86/3332‑3630 | tgtgAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTg > 1:1108528‑M2/1‑149 (MQ=255) tgtgAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTg > 1:1108532‑M2/1‑149 (MQ=255) gtgAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTgt < 1:1532276‑M2/150‑3 (MQ=255) gtgAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTgt < 1:1532271‑M2/150‑3 (MQ=255) gtgAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCATCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCATTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTgt < 1:1532284‑M2/150‑3 (MQ=255) tgAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATAAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGc < 1:3450472/150‑1 (MQ=255) gAAGACAGCGACCNCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCTGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTgtgt < 1:2865337‑M2/150‑5 (MQ=255) gAAGACAGCGACCNCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCTGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTgtgt < 1:2865342‑M2/150‑5 (MQ=255) aaGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATAAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCt > 1:3754973/1‑150 (MQ=255) aaGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATAAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCt > 1:670799/1‑150 (MQ=255) aGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATAAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCtt > 1:1543914/1‑150 (MQ=255) aCAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTgtgtaagt < 1:2213447‑M2/150‑9 (MQ=255) cAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTNCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATAAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCg > 1:3581265/1‑150 (MQ=255) cAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATAAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCg > 1:1972856/1‑150 (MQ=255) cGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTgtgtaagttcac > 1:2369778‑M2/1‑138 (MQ=255) aCCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTgtgtaagttcacag > 1:2097524‑M2/1‑136 (MQ=255) ccTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTgtgtaagttcacaga < 1:464389‑M2/150‑16 (MQ=255) gCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTgtgtaagttcacagagatattgcaa < 1:1588584‑M2/150‑26 (MQ=255) gCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTgtgtaagttcacagagatattgcaa > 1:780405‑M2/1‑125 (MQ=255) ggTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTgtgtaagttcacagagatattgcaattg < 1:3084845‑M2/150‑29 (MQ=255) ggTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTgtgtaagttcacagagatattgcaattg < 1:1683839‑M2/150‑29 (MQ=255) ggTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTgtgtaagttcacagagatattgcaattg < 1:3086226‑M2/150‑29 (MQ=255) ggTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTgtgtaagttcacagagatattgcaattg < 1:212871‑M2/150‑29 (MQ=255) tCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTgtgtaagttcacagagatattgcaattgcct > 1:84115‑M2/1‑119 (MQ=255) tCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATAAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACa > 1:657610/1‑150 (MQ=255) cGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATAAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACAt < 1:619981/150‑1 (MQ=255) cGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATAAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACAt < 1:619983/150‑1 (MQ=255) cGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTgtgtaagttcacagagatattgcaattgcctccggata < 1:403286‑M2/150‑39 (MQ=255) 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aCCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATAAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTTCAGc > 1:193655/1‑150 (MQ=255) cTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATAAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTTCAGCAt > 1:516205/1‑150 (MQ=255) cTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATAAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTTCAGCAt > 1:1379000/1‑150 (MQ=255) ggTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATCAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTgtgtaagttcacagagatattgcaattgcctccggataagtaaggggagat < 1:112422‑M2/150‑52 (MQ=255) ggTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATAAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTTCAGCATGGATTGAg > 1:1838188/1‑150 (MQ=255) 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ttttGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTTCAGCATGGATTGAGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCTTTTgg < 1:350565/150‑1 (MQ=255) ttGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTgtgtaagttcacagagatattgcaattgcctccggataagtaaggggagattgcactatgcaaatgcagcatctgatggttggctatcctaagtactaccaaacggccgattatgcgttgaggc > 1:972165‑M2/1‑26 (MQ=255) ctgctTCATAGCCTGCTTCTCCTgtgtaagttcacagagatattgcaattgcctccggataagtaaggggagattgcactatgcaaatgcagcatctgatggttggctatcctaagtactaccaaacggccgattatgcgttgaggcttt < 1:2885562‑M2/150‑128 (MQ=255) ctgctTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTTCAGCATGGATTGAGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAA‑GGGGGCTTTTCTCTATCTGCCTTTTGGTGTTCa > 1:481306/1‑150 (MQ=255) ctgctTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTTCAGCATGGATTGAGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAA‑GGGGGCTTTTCTCTATCTGCCTTTTGGTGTTCa > 1:481308/1‑150 (MQ=255) ctgctTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTTCAGCATGGATTGAGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAA‑GGGGGCTTTTCTCTATCTGCCTTTTGGTGTTCa > 1:481312/1‑150 (MQ=255) tggtggacccatacatctcCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTAGATTTGCCGTTCATAGATTGAGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCTTTTGGTGTTCAt < 1:1457384/135‑1 (MQ=17) gctTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTTCAGCATGGATTGAGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCTTTTGGTGTTCAt < 1:2785629/150‑1 (MQ=255) ttCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTTCAGCATGGATTGAGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCTTTTGGTGTTCATGc < 1:101831/150‑1 (MQ=255) tCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTTCAGCATGGATTGAGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCTTTTGGTGTTCATGcc > 1:282151/1‑150 (MQ=255) tCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTTCAGCATGGATTGAGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCTTTTGGTGTTCATGcc < 1:1924182/150‑1 (MQ=255) cATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTTCAGCATGGATTGAGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCTTTTGGTGTTCATGCCt < 1:3273866/150‑1 (MQ=255) aTAGCCTGCTTCTCCTgtgtaagttcacagagatattgcaattgcctccggataagtaaggggagattgcactatgcaaatgcagcatctgatggttggctatcctaagtactaccaaacggccgattatgcgttgaggctttcagtgat < 1:2994301‑M2/150‑135 (MQ=255) tAGCCTGCTTCTCCTgtgtaagttcacagagctattgcaattgcctccggataagtaaggggagattgcactatgcaaatgcagcatctgatggttggctatcctaagtactaccaaacggccgattatgcgttgaggctttcagtgatg > 1:1046089‑M2/1‑15 (MQ=255) tAGCCTGCTTCTCCTgtgtaagttcacagagatattgcaattgcctccggataagtaaggggagattgcactatgcaaatgcagcatctgatggttggctatcctaagtactaccaaacggccgattatgcgttgaggctttcagtgatg > 1:1046086‑M2/1‑15 (MQ=255) cccatacatctcCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTAGATTTGCCGTTCATAGATTGAGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCCTTTCTCTATCTGCCTTTTGGTGTTCATGCCTgag < 1:2023237/142‑1 (MQ=17) aGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTTCAGCATGGATTGAGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCTTTTGGTGTTCATGCCTgag < 1:1108037/150‑1 (MQ=255) tacatctcCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGNCTAACCTAGATTTGCCGTTCATAGATTGNGCNTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCTTTTGGTGTTCATGCCTGAGGCAg < 1:3568292/146‑1 (MQ=17) gCTTCTCCTgtgtaagttcacagagatattgcaattgcctccggataagtaaggggagattgcactatgcaaatgcagcatctgatggttggctatcctaagtactaccaaacggccgattatgcgttgaggctttcagtgatggctgat > 1:1251717‑M2/1‑9 (MQ=255) cTTCTCCTgtgtaagttcacagagatattgcaattgcctccggataagtaaggggagattgcactatgcaaatgcagcatctgatggttggctatcctaagtactaccaaacggccgattatgcgttgaggctttcagtgatggctgata > 1:1179805‑M2/1‑8 (MQ=255) tcCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTTCAGCATGGATTGAGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCTTTTGGTGTTCATGCCTGAGACAGATAGcc < 1:3287011/150‑1 (MQ=255) ccTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTAGATTTGCCGTTCATAGATTGAGCCTCAGATTAATGTTTATCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCTTTTGGTGTTCATGCCTGAGGCAGATAGCCt < 1:3754066/150‑1 (MQ=17) ccTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTAGATTTGCCGTTCATAGATTGAGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCTTTTGGTGTTCATGCCTGAGGCAGATAGCCt > 1:1993227/1‑150 (MQ=17) cTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTTCAGCATGGATTGAGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCTTTTGGTGTTCATGCCTGAGACAGATAGCCTc > 1:2734564/1‑150 (MQ=255) ttGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAATCTACATGTGTTCAGCATGGATTGAGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCTTTTGGTGTTCATGCCTGAGACAGATAGCCTCa < 1:3512293/150‑1 (MQ=255) ttGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTTCAGCATGGATTGAGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCTTTTGGTGTTCATGCCTGAGACAGATAGCCTCa < 1:171064/150‑1 (MQ=255) ttGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTTCAGCATGGATTGAGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCTTTTGGTGTTCATGCCTGAGACAGAGAGCCTCa < 1:1815737/150‑1 (MQ=255) | CTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACGGTTAAACAGATGACGATAAGGGCGATTAACATCGCCTTTTGCTGCTTCATAGCCTGCTTCTCCTTGCCTTTCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTTCAGCATGGATTGAGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCTATCTGCCTTTTGGTGTTCATGCCTGAGACAGATAGCCTCA > Xen14_86/3332‑3630 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |