| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | Xen14_85 | = 11155 | 0 (0.000) | intergenic (+105/–) | Xen14_04471/– | hypothetical protein/– | |||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
GGCATCTGATTATGCATTAAAAATAAATGAAAACTCTGATTAAGACGGGGGTAGCTGATAATAAGACAATCAATGACAGATATTAATGAATAAACATAATCAGGCGCTCAATACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCGGATAAGTAAGGGGAGATTGCACTATGCAAATGCAGCATCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_85/11008‑11197 | ggcATCTGATTATGCATTAAAAATAAATGAAAACTCTGATTAAGACGGGGGTAGCTGATAATAAGACAATCAATGACAGATATTAATGAATAAACATAATCAGGCGCTCAATACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCgg < 1:1661958/150‑1 (MQ=255) gcATCTGATTATGCATTAAAAATAAATGAAAACTCTGATTAAGACGGGGGTAGCTGATAATAAGACAATCAATGACAGATATTAATGAATAAACATAATCAGGCGCTCAATACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCGGa < 1:905208/150‑1 (MQ=255) gcATCTGATTATGCATTAAAAATAAATGAAAACTCTGATTAAGACGGGGGTAGCTGATAATAAGACAATCAATGACAGATATTAATGAATAAACATAATCAGGCGCTCAATACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCGGa < 1:905205/150‑1 (MQ=255) gcATCTGATTATGCATTAAAAATAAATGAAAACTCTGATTAAGACGGGGGTAGCTGATAATAAGACAATCAATGACAGATATTAATGAATAAACATAATCAGGCGCTCAATACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCGGa < 1:905204/150‑1 (MQ=255) 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tGATTATGCATTAAAAATAAATGAAAACTCTGATTAAGACGGGGGTAGCTGATAATAAGACAATCAATGACAGATATTAATGAATAAACATAATCAGGCGCTCAATACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCGGAtaagt < 1:1268870/150‑1 (MQ=255) tGATTATGCATTAAAAATAAATGAAAACTCTGATTAAGACGGGGGTAGCTGATAATAAGACAATCAATGACAGATATTAATGAATAAACATAATCAGGCGCTCAATACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCGGAtaagt < 1:2251123/150‑1 (MQ=255) tGATTATGCATTAAAAATAAATGAAAACTCTGATTAAGACGGGGGTAGCTGATAATAAGACAATCAATGACAGATATTAATGAATAAACATAATCAGGCGCTCAATACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCGGAtaagt < 1:2251120/150‑1 (MQ=255) aTTATGCATTAAAAATAAATGAAAACTCTGATTAAGACGGGGGTAGCTGATAATAAGACAATCAATGACAGATATTAATGAATAAACATAATCAGGCGCTCAATACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCGGAtaagtca > 1:452228/1‑148 (MQ=255) aTTATGCATTAAAAATAAATGAAAACTCTGATTAAGACGGGGGTAGCTGATAATAAGACAATCAATGAAAGATATTAATGAATAAACATAATCAGGCGCTCAATACTGTGTAAGTTCACAGAGATATTGCAATTGCCTCCGGAtaagtca > 1:452223/1‑148 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |