| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_138 | = 75 | NA (NA) | 77 (0.940) +GAAAGGGGGGATTTCCGGTCGCAGTGTAAAAGGAAAACGTATCCATACCCGGGCCATTCACA |
42/172 | 0.1 | 100% | coding (1153/1197 nt) | scrY_2 | Sucrose porin |
| ? | Xen14_45 | = 40401 | 0 (0.000) | intergenic (‑73/–) | Xen14_03654/– | hypothetical protein/– | |||||
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
GAACGACACCCCGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_45/40252‑40401 | gAACGACACCCCGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCCCAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGc > 1:3789215/1‑150 (MQ=255) aaCGACACCCCGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCt > 1:2305963‑M2/1‑149 (MQ=255) gACACCCCGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtg > 1:2653778‑M2/1‑146 (MQ=255) cacCCCGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaa < 1:1494432‑M2/150‑7 (MQ=255) cacCCCGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCAATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaa > 1:3635007‑M2/1‑144 (MQ=255) acCCCGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaat > 1:1837540‑M2/1‑143 (MQ=255) acCCCGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaat > 1:3643908‑M2/1‑143 (MQ=255) ccccGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatg > 1:2020416‑M2/1‑142 (MQ=255) ccccGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatg < 1:2452753‑M2/150‑9 (MQ=255) ccccGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatg < 1:843647‑M2/150‑9 (MQ=255) ccccGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatg < 1:1443531‑M2/150‑9 (MQ=255) ccGGCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggc < 1:1871079‑M2/150‑11 (MQ=255) gCAGCGCCTCCGGGGCGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccg > 1:116108‑M2/1‑137 (MQ=255) cGTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttt > 1:2697569‑M2/1‑122 (MQ=255) gTCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgtttt < 1:578029‑M2/150‑30 (MQ=255) tCGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttc > 1:2790424‑M2/1‑120 (MQ=255) cGGGTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatg < 1:3115674‑M2/138‑20 (MQ=255) gTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttt > 1:3222634‑M2/1‑116 (MQ=255) gTGATTCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttt < 1:38682‑M2/150‑35 (MQ=255) ttCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttaca < 1:3465674‑M2/150‑39 (MQ=255) tCTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacac > 1:2683857‑M2/1‑111 (MQ=255) cTGGTACCTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacact > 1:953883‑M2/1‑110 (MQ=255) cTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccg > 1:3719374‑M2/1‑103 (MQ=255) cTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccg < 1:491224‑M2/150‑48 (MQ=255) cTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccg > 1:3719375‑M2/1‑103 (MQ=255) cTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccg > 1:3427731‑M2/1‑103 (MQ=255) cTGAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccg > 1:3427730‑M2/1‑103 (MQ=255) gAATCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTCAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccgga < 1:2272459‑M2/150‑50 (MQ=255) aaTCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCCTCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATCGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCcgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaa < 1:3471089‑M2/150‑51 (MQ=255) aaTCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacacggcgaccggaa > 1:480522‑M2/1‑100 (MQ=255) aaTCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATCGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaa < 1:3191622‑M2/150‑51 (MQ=255) aTCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaa < 1:1453570‑M2/150‑52 (MQ=255) aTCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaa < 1:2961883‑M2/150‑52 (MQ=255) tCACGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaat > 1:1728295‑M2/1‑98 (MQ=255) aCGCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcc > 1:1929251‑M2/1‑96 (MQ=255) gCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccc > 1:2894488‑M2/1‑94 (MQ=255) gCCTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccc > 1:2894485‑M2/1‑94 (MQ=255) ccTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACGATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatccccc > 1:434561‑M2/1‑93 (MQ=255) ccTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatccccc < 1:1993160‑M2/150‑58 (MQ=255) ccTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatccccc < 1:1993159‑M2/150‑58 (MQ=255) cTTCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccc < 1:439572‑M2/150‑59 (MQ=255) tCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtttgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctt > 1:1753220‑M2/1‑90 (MQ=255) tCAGGGACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctt > 1:1753218‑M2/1‑90 (MQ=255) gggACAGGCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcg > 1:304152‑M2/1‑87 (MQ=255) ggCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTACTGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactacgaccggaaatcccccctttcgtaagcg < 1:3487011‑M2/150‑70 (MQ=255) ggCTGCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcg < 1:1857046‑M2/150‑70 (MQ=255) gCATCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtaca > 1:1069385‑M2/1‑77 (MQ=255) aTCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCGTCACCCACAATGCGCGATTGAGTTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtacagc < 1:1745366‑M2/150‑76 (MQ=255) 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aTCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttctacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtacagc < 1:2908295‑M2/150‑76 (MQ=255) aTCAGCGCAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttctacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtacagc < 1:2908296‑M2/150‑76 (MQ=255) gcgcAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgacc < 1:1160446‑M2/117‑47 (MQ=255) gcAGGCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtacagcctgaac > 1:2323167‑M2/1‑69 (MQ=255) gCTCTCCAGCATCGTTTCTGCCATCACCCACAATGCGCGATTGAGCTTAATGTCGGTATCAATGCtgtgaatggcccgggtatggatacgttttccttttacactgcgaccggaaatcccccctttcgtaagcgtacagcctgaaccgtc < 1:815149‑M2/150‑86 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |