| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | Xen14_124 | 1 = | 0 (0.000) | 101 (0.740) +G |
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| ? | Xen14_165 | = 691 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 198 total aligned reads displayed.
GATTGTGACTCATCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_165/542‑691 | aTTGTGACTCATCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGt < 1:1919755‑M2/150‑2 (MQ=255) gtgACTCATCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtatt > 1:953233‑M2/1‑146 (MQ=255) gtgACTCATCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtatt > 1:953231‑M2/1‑146 (MQ=255) gACTCATCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattcc < 1:270486‑M2/150‑7 (MQ=255) gACTCATCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCATTTCTTTATACGCCGtattcc < 1:482964‑M2/150‑7 (MQ=255) cTCATCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccat > 1:2401094‑M2/1‑142 (MQ=255) tCATCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattccatt > 1:2714317‑M2/1‑141 (MQ=255) tCATCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattccatt > 1:2714323‑M2/1‑141 (MQ=255) cATCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattc < 1:2755725‑M2/150‑11 (MQ=255) aTCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattct > 1:2816236‑M2/1‑139 (MQ=255) aTCTTCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattct > 1:2816232‑M2/1‑139 (MQ=255) ttCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattccattcttta > 1:1431062‑M2/1‑136 (MQ=255) tCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattctttaa < 1:284463‑M2/150‑16 (MQ=255) tCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattctttaa < 1:284459‑M2/150‑16 (MQ=255) tCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattccattctttaa > 1:3328476‑M2/1‑135 (MQ=255) tCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattccattctttaa > 1:3350436‑M2/1‑135 (MQ=255) tCCTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTT‑GATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattctttaat > 1:1988791‑M2/1‑134 (MQ=255) ccTGATGGTAGCAGTATTTCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattctttaat > 1:940771‑M2/1‑134 (MQ=255) 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tCCTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGTCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattccattctttaattaagagggtgatttatgg > 1:2340267‑M2/1‑116 (MQ=255) tCCTCGCTTTTTTCAAAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattccattctttaattaagagggtgatttatgg < 1:803595‑M2/150‑35 (MQ=255) ccTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGCTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattctttaattaagagggtgatttatggc > 1:2648672‑M2/1‑115 (MQ=255) cTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGtattccattctttaattaagagggtgatttatggct < 1:2433519‑M2/150‑37 (MQ=255) cTCGCTTTTTTCAGAGTTGCCTTCTTCTGTTTTGTGGTTTCTTAATCTGATGTCTTTTGATGTTGTTTTGCCCATGATGGTTTCAGCCATGTTTACGCGTTTCTTTATACGCCGcattccattctttaattaagagggtgatttatggct < 1:1303932‑M2/150‑37 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |