| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_55 | = 26715 | 0 (0.000) | 54 (0.590) +GTAGCAGTAAT |
35/274 | 1.4 | 100% | intergenic (‑222/–) | Xen14_03965/– | hypothetical protein/– |
| ? | Xen14_90 | = 74 | NA (NA) | coding (1/747 nt) | yafV | Omega‑amidase YafV | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTACCCCCAAACGAATCGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTTCGTCGCTA > Xen14_90/1‑220 | ataatggtgggttACCCCCAAACGAATCGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCAAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGaa > 1:3199207/12‑150 (MQ=21) aatggtgggttACCCCCAAACGGATCGGAAAATCGATACTGGAGAAACTCTAACGCGGTGGCCATTTTGTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAgg < 1:3430694/141‑1 (MQ=25) atggtgggttACCCCCAAACGAATCGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTg > 1:116538/9‑133 (MQ=255) atggtgggttACCCCCAAACGAATCGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGt > 1:1454652/9‑150 (MQ=255) cAAACGAATCGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTa > 1:2674754/1‑139 (MQ=255) cAAACGAATCGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGAt < 1:1199555/150‑1 (MQ=255) cAAACGAATCGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGAt < 1:1371432/150‑1 (MQ=255) aaTCGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATc < 1:1460790/150‑1 (MQ=255) aTCGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCg < 1:2970337/150‑1 (MQ=255) tCGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGt < 1:2365621/150‑1 (MQ=255) tCGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGt < 1:2365618/150‑1 (MQ=255) cGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAATCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGtt > 1:2969875/1‑150 (MQ=255) cGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGtt < 1:2404257/150‑1 (MQ=255) aaTCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTAcc < 1:3195657/150‑1 (MQ=255) aaTCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTAcc < 1:34859/150‑1 (MQ=255) aTCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCg > 1:1908792/1‑150 (MQ=255) gATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGACGCGATGTGATCGTTCTACCGgag < 1:3762119/150‑1 (MQ=255) gATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTGTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGACGCGATGTGATCGTTCTACCGgag < 1:3763497/150‑1 (MQ=255) tACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGAt < 1:454583/150‑1 (MQ=255) ggAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTc > 1:1912154/1‑136 (MQ=255) gAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTa < 1:2112683/150‑1 (MQ=255) aaCTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAATCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAg < 1:2617686/150‑1 (MQ=255) aaCTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAg > 1:1771994/1‑150 (MQ=255) ctctAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCg > 1:3303983/1‑150 (MQ=255) ctctAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCg > 1:2093451/1‑150 (MQ=255) ctctAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCg > 1:2443942/1‑150 (MQ=255) ctctAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAAACTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCg > 1:1293528/1‑150 (MQ=255) ctctAACGCGGTGGCAAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCg > 1:1293529/1‑150 (MQ=255) gctgTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGc < 1:2444982/147‑1 (MQ=255) gcgGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGc < 1:1317936/150‑1 (MQ=255) gcgGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGc < 1:3158006/150‑1 (MQ=255) gcgGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGc < 1:2444981/150‑1 (MQ=255) gcgGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGc < 1:3435820/150‑1 (MQ=255) cgGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGCATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGcc < 1:1921328/150‑1 (MQ=255) ggTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCa < 1:1711487/150‑1 (MQ=255) ggTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCa < 1:1711486/150‑1 (MQ=255) gTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCAt > 1:3495848/1‑150 (MQ=255) gTGGCCAGTTTTTGTTAACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCAt < 1:3022834/150‑1 (MQ=255) tGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATg < 1:1321443/150‑1 (MQ=255) tGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATg < 1:1962377/150‑1 (MQ=255) ggCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATgg > 1:1105811/1‑150 (MQ=255) gCCAGTTTTTATTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGa < 1:2307342/150‑1 (MQ=255) tttttGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCgg > 1:2450745/1‑150 (MQ=255) tgttgACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGTCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATTGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCCTGGAAGCGGCAGc > 1:1550634/1‑150 (MQ=255) ttgACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCtt < 1:3154776/150‑1 (MQ=255) tgACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTtc > 1:1391353/1‑150 (MQ=255) tgACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCAGCAGCTtc < 1:243646/150‑1 (MQ=255) tgACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCAGCAGCTtc < 1:243643/150‑1 (MQ=255) gACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTtcg > 1:721111/1‑150 (MQ=255) gACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTtcg > 1:1783158/1‑150 (MQ=255) gACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTtcg > 1:1783157/1‑150 (MQ=255) gACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTtcg > 1:1783150/1‑150 (MQ=255) gACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTtcg > 1:1783149/1‑150 (MQ=255) gACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTtcg > 1:1783143/1‑150 (MQ=255) gACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTtcg > 1:1783142/1‑150 (MQ=255) gACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTtcg > 1:1783141/1‑150 (MQ=255) aCCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTtcgt > 1:1060517/1‑150 (MQ=255) aCCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTtcgt > 1:1060516/1‑150 (MQ=255) ccACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTtcgtc < 1:259067/150‑1 (MQ=255) cACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTtcgtcg < 1:2735438/150‑1 (MQ=255) atttCATACAGCACCCCCTGGTGTGGATGGAGGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATTGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTTCGTCGc < 1:2260970/148‑1 (MQ=255) ttCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTTCATCGCTa < 1:2649731/150‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTACCCCCAAACGAATCGGAAAATCGATACTGGAAAAACTCTAACGCGGTGGCCAGTTTTTGTTGACCACTTCATGCAGCAACCACTGGTGTGGATGGATGGTCCTGCCAACCTGCGCCATTTTGATCGTCAACTGGAAGGTATTACCGGGCGCGATGTGATCGTTCTACCGGAGATGTTTACCAGCGGCTTTGCCATGGAAGCGGCAGCTTCGTCGCTA > Xen14_90/1‑220 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |