| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_177 | = 549 | 0 (0.000) | 39 (0.470) +ACTAAAACAACAAAGTCCATAAGGAGTTTACTCACATCTGACAAAATCAATATAAAC |
26/182 | 1.1 | 68.3% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | Xen14_96 | 5541 = | 59 (0.490) | intergenic (‑234/+256) | Xen14_04570/Xen14_04571 | hypothetical protein/tRNA‑Arg(tct) | |||||
AGTGCTACCTGTAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_177/400‑549 | aGTGCTACCTGTAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTCGCACTCTGCAAATATGTCCTTATgg < 1:1210821/150‑1 (MQ=255) tGCTACCTGTAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgc < 1:3144164‑M1/150‑3 (MQ=255) gCTACCTGTAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAACAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGatt > 1:31472‑M1/1‑147 (MQ=255) cTACCTGTAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGacta < 1:578807‑M1/150‑5 (MQ=255) tGTAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATACTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaaca < 1:954995‑M1/150‑10 (MQ=255) gTAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGACTGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTATGC‑AATATGTCCTTATGGactaaaacaac > 1:1452614‑M1/1‑139 (MQ=255) gTAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaa < 1:3772624‑M1/150‑11 (MQ=255) tAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaac < 1:2524834‑M1/150‑12 (MQ=255) tAACCATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAAATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaac > 1:2678625‑M1/1‑139 (MQ=255) cATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaag < 1:3537456‑M1/150‑16 (MQ=255) cATTTACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaag < 1:3451746‑M1/150‑16 (MQ=255) ttACAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCTTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtcc < 1:3608004‑M1/150‑19 (MQ=255) cAACGTAGTACCATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtcccta > 1:3677995‑M1/1‑129 (MQ=255) acatagtaccaTTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCGTATGGactaaaacaacaaagtccataag < 1:1415661‑M1/147‑24 (MQ=255) ccATTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaag < 1:508727‑M1/134‑16 (MQ=255) aTTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggag < 1:3663612‑M1/143‑27 (MQ=255) aTTCAATAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactc > 1:3339361‑M1/1‑117 (MQ=255) aTAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatc < 1:2818405‑M1/150‑39 (MQ=255) aTAAAACATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGaccaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatc > 1:3185624‑M1/1‑112 (MQ=255) aaaaCATTCTGGAATTTAATCGAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGTAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtagtggagatcgac > 1:1946663‑M1/1‑110 (MQ=255) aaaaCATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACGGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctg > 1:1892336‑M1/1‑110 (MQ=255) aaaaCATTCTGGAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACGGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctg > 1:1892338‑M1/1‑110 (MQ=255) gAATTTAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaa > 1:1665397‑M1/1‑99 (MQ=255) tttAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatata < 1:3068047‑M1/150‑55 (MQ=255) tttAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAAAACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatata < 1:2488087‑M1/150‑55 (MQ=255) ttAATCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGACTGAATGCTTTAATGACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataa > 1:1582419‑M1/1‑95 (MQ=255) aaTCAAAAACAGCCAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaac > 1:3183598‑M1/1‑93 (MQ=255) aaaCAGCCAGGAATGCCCTACGAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaatcaatataaacagcccct > 1:1286829‑M1/1‑87 (MQ=255) cAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatacaaacagcccctccggag > 1:2862973‑M1/1‑80 (MQ=255) cAGGAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaacagcccctccggag > 1:3793945‑M1/1‑80 (MQ=255) gAATGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaacagcccctccggagagg < 1:3451362‑M1/150‑74 (MQ=255) aTGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaacagcccctccggagagggg < 1:1458164‑M1/150‑76 (MQ=255) aTGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaacagcccctccggagagggg < 1:1458163‑M1/150‑76 (MQ=255) aTGCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaacagcccctccggagagggg > 1:3362475‑M1/1‑75 (MQ=255) gCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaacagcccctccggagaggggct > 1:509167‑M1/1‑73 (MQ=255) gCCCTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaacagcccctccggagaggggct > 1:770984‑M1/1‑73 (MQ=255) cccTACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAAGAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaacagcccctccggagaggggctg < 1:1921214‑M1/150‑79 (MQ=255) tACAAATACAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaacagcccctccggagaggggctggag < 1:3732725‑M1/150‑82 (MQ=255) 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cAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaacagcccctccggagaggggctggagagtggcgc < 1:1816911‑M1/150‑90 (MQ=255) cAGATAACGTATTGAATGAATGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaacagcccct > 1:3728015‑M1/1‑61 (MQ=255) tgaatgaaTGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaacagcccctccggagaggggctggagagtggcgctatgtgccattg > 1:2232435‑M1/1‑49 (MQ=255) tgaatgaaTGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaacagcccctccggagaggggctggagagtggcgctatgtgccattg > 1:2232433‑M1/1‑49 (MQ=255) gaatgaatGCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaacagcccctccggagaggggctggagagtggcgctatgtgccattgc > 1:3442727‑M1/1‑48 (MQ=255) atgaatgCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaacagcccctccggagaggggctggagagtggcgctatgtgccattgcat < 1:1238237‑M1/150‑105 (MQ=255) tgaatgCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaacaacccctccggagaggggctggagagtggcgctatgtgccattgcatg > 1:3346964‑M1/1‑45 (MQ=255) gaatgCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGgctaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaacagcccctccggagaggggctggagagtggcgctatgtgccattgcatgg > 1:631573‑M1/1‑44 (MQ=255) aatgCTTTAATAACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGactaaaacaacaaagtccataaggagtttactcacatctgacaaaatcaatataaacagcccctccggagaggggctggagagtggcgctatgtgc > 1:923064‑M1/1‑43 (MQ=255) cTTTAATCACCGTTGCACTCTGCAAATATGTCCTTATGGcctcaaacaacaacgtacataaggagtttaatcacatctgaaaaaatcaatataaacagaccctccggagaggagctggagagtggcgctatgtgccattgcatggtgacg > 1:3422709‑M1/1‑39 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |