| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | Xen14_174 | 1 = | 0 (0.000) | 71 (0.740) +TTGCCCGGCCAGTACGATGACGTAGTACC |
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Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGGCTTCCGCTTCCGGATTCATACGATGCGCCCCATCCGCGCATTAAGCAACTGGCCCGTCGTAACACAGTGACTCCCGGTGGTGAAGTATGCGTATTTAACGACATCATTCCTGCTGACCATTG > Xen14_174/1‑149 | caaactgaaagagggctggcagccatacggcggaccggttgccattacgccgtacacactgatgcaggcggtggctattgaaggagagccacaggtcggcccttcatctgagccggattggtactacgtcatcgtactggccgggcaaTc < 1:3477056‑M1/2‑1 (MQ=255) aaactgaaagagggctggcagccatacggcggaccggttgccattacgccgtacacactgatgcaggcggtggctattgaaggagagccacaggtcggcccttcatctgagccggattggtactacgtcatcgtactggccgggcaaTcc > 1:3686110‑M1/148‑150 (MQ=255) aaactgaaagagggctggcagccatacggcggaccggttgccattacgccgtacacacggatgcaggcggtggctattgaaggagagccacaggtcggcccttcatctgagccggattggtactacgtcatcgtactggccgggcaaTcc > 1:91715‑M1/148‑150 (MQ=255) actgaaagagggctggcagccatacggcggaccggttgccattacgccgtacacactgatgcaggcggtggctattgaaggagagccataggtcggcccttcatctgagccggattggtactacgtcatcgtactggccgggcaaTCCaa < 1:2153788‑M1/5‑1 (MQ=255) actgaaagagggctggcagccatacggcggaccggttgccattacgccgtacacactgatgcaggcggtggctattgaaggagagccacaggtcggcccttcatctgagccggattggtaatacgtcatcgtactggccgggcaaTCCaa > 1:551359‑M1/146‑150 (MQ=255) tgaaagagggctggcagccatacggcggaccggttgccattacgccgtacacactgatgcaggcggtggctattgaaggagagccacaggtcggcccttcatctgagccggattggtactacgtcatcgtactggccgggcaaTCCAATg > 1:3179375‑M1/144‑150 (MQ=255) ggcggaccggttgccattacgccgtacacactgatgcaggcggtggctattgaaggagagccacaggtcggcccttcatctgagccggattggtactacgtcatcgtactggccgggcaaTCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGgctt > 1:1748046‑M1/121‑150 (MQ=255) ccggttgccattacgccgtacacactgatgcaggcggtggctattgaaggagagccacaggtcggcccttcatctgagccggattggtactacgtcatcgtactggccgggcaaTCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGggcttccgctg < 1:3388374‑M1/36‑2 (MQ=255) 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cgtactggccgggcaaTCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGGCTTCCGCTTCCGGATTCATACGATGCGCCCCATCCGCGCATTAAGCAACTGGCCCGTCGTAACACAGTGACTCCCGGTGGTGAAGTATGCGTATTTAACGAcatcat > 1:3757617‑M1/17‑150 (MQ=255) gtactggccgggcagTCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGGCTTCCGCTTCCGGATTCATACGATGCGCCCCATCCGCGCATTAAGCAACTGGCCCGTCGTAACACAGTGACTCCCGGTGGTGAAGTATGCGTATTTAACGACATCAtt > 1:2054022‑M1/16‑150 (MQ=255) gtactggccgggcagTCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGGCTTCCGCTTCCGGATTCATACGATGCGCCCCATCCGCGCATTAAGCAACTGGCCCGTCGTAACACAGTGACTCCCGGTGGTGAAGTATGCGTATTTAACGACATCAtt > 1:2054021‑M1/16‑150 (MQ=255) gtactggccgggcaaTCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGGCTTCCGCTTCCGGATTCATACGATGCGCCCCATCCGCGCATTAAGCAACTGGCCCGTCGTAACACAGTGACTCCCGGTGGTGAAGTATGCGTATTTAACGACATCAtt < 1:2906868‑M1/135‑1 (MQ=255) actggccgggcagTCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGGCTTCCGCTTCCGGATTCATACGATGCGCCCCATCCGCGCATTAAGCAACTGGCCCGTCGTAACACAGTGACTCCCGGTGGTGAAGTATGCGTATTTAACGACATCATTcc > 1:550160‑M1/14‑150 (MQ=255) ggccgggcaaTCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGGCTTCCGCTTCCGGATTCATACGATGCGCCCCATCCGCGCATTAAGCAACTGGCCCGTCGTAACACAGTGACTCCCGGTGGTGAAGTATGCGTATTTAAc < 1:3198417‑M1/126‑1 (MQ=255) ccgggcagTCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGGCTTCCGCTTCCGGATTCATACGATGCGCCCCATCCGCGCACTAAGCAACTGGCCCGTCGTAACACAGTGACTCCCGGTGGTGAAGTATGCGTATTTAACGACATCATCCctgctg < 1:888470‑M1/142‑1 (MQ=255) cgggcaaTCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGGCTTCCGCTTCCGGATTCATACGATGCGCCCCATCCGCGCATTAAGCAACTGGCCCGTCGTAACACAGTGACTCCCGGTGGTGAAGTATGTGTATTTAACGACATCATTCCTGCTGa < 1:2554639‑M1/143‑1 (MQ=255) cgggcaaTCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGGCTTCCGCTTCCGGATTCATACGATGCGCCCCATCCGCGCATTAAGCAACTGGCCCGTCGTAACACAGTGACTCCCGGTGGTGAAGTATGCGTATTTAACGACATCATTCCTGCTGa < 1:2456713‑M1/143‑1 (MQ=255) gggcaaTCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGGCTTCCGCTTCCGGATTCATACGATGCGCCCCATCCGCGCATTAAGCAACTGGCCCGTCGTAACACAGTGACTCCCGGTGGTGAAGTATGCGTATTTAACGACATCATTCCTGCTGAc > 1:3194871‑M1/7‑150 (MQ=255) 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gtCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGGCTTCCGCTTCCGGATTCATACGATGCGCCCCATCCGCGCATTAAGCAACTGGCCCGTCGTAACACAGTGACTCCCGGTGGTGAAGTATGCGTATTTAACGACATCATTCCTGCTGACCATTg < 1:423523/149‑1 (MQ=255) gtCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGGCTTCCGCTTCCGGATTCATACGATGCGCCCCATCCGCGCATTAAGCAACTGGCCCGTCGTAACACAGTGACTCCCGGTGGTGAAGTATGCGTATTTAACGACATCATTCCTGCTGACCATTg > 1:3001257/2‑150 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCAATGCCATGGCTTACGGTGAAGGGCTTCCGCTTCCGGATTCATACGATGCGCCCCATCCGCGCATTAAGCAACTGGCCCGTCGTAACACAGTGACTCCCGGTGGTGAAGTATGCGTATTTAACGACATCATTCCTGCTGACCATTG > Xen14_174/1‑149 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |