| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | Xen14_168 | = 629 | 0 (0.000) | 43 (0.080) | 31/220 | 2.7 | 100% | intergenic (‑111/–) | Xen14_04774/– | IS200/IS605 family transposase IS200C/– |
| ? | Xen14_58 | 39 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+73) | –/creD_1 | –/Inner membrane protein CreD | |||||
Only 100 of 458 total aligned reads displayed.
GTTCCATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_168/480‑629 | gTTCCATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGa > 1:1233412/1‑150 (MQ=255)gTTCCATCGGGTGTGCGCCAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGa > 1:2657050/1‑150 (MQ=255) tCCATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGacc > 1:1943519/1‑148 (MQ=255) tCCATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAac < 1:327809‑M1/150‑3 (MQ=255) tCCATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAac < 1:1067797‑M1/150‑3 (MQ=255) tCCATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAac < 1:2420258‑M1/150‑3 (MQ=255) tCCATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAac > 1:1745658‑M1/1‑148 (MQ=255) tCCATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAac < 1:1342448‑M1/150‑3 (MQ=255) ccATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAacc > 1:3320894‑M1/1‑147 (MQ=255) 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ttttCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCTGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAacccccagcctagctgggggttttc < 1:1004413‑M1/150‑26 (MQ=255) ttttCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAGGCTTTCCGGAccccccagcctagctgggg > 1:916194‑M1/1‑125 (MQ=255) ttttCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAacccccagcctagctgggggttttc < 1:2838982‑M1/150‑26 (MQ=255) ttttCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAacccccagcctagctgggggttttc < 1:1723439‑M1/150‑26 (MQ=255) ttCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAacccccagcctagctgggggttttctg < 1:1107379‑M1/150‑28 (MQ=255) 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aTCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAacccccagcctagctgggggttttctgtgcacaagaagagctcgtacgaaagtacgagctttttttcgtatattgcatacaccggggggatgagaagccccga > 1:618693‑M1/1‑47 (MQ=255) | GTTCCATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_168/480‑629 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |