| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_12 | = 188 | 70 (0.900) | 47 (0.390) | 23/296 | 2.6 | 40.2% | intergenic (–/+140) | –/Xen14_01540 | –/hypothetical protein |
| ? | Xen14_68 | 16331 = | NA (NA) | intergenic (+51/–) | rph/– | Ribonuclease PH/– | |||||
Only 100 of 461 total aligned reads displayed.
ACTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGCATAAACAGGGGCATCAGCTCTGAACCGGGCCTGAACAATACGATCCCCATACGCGGGGCAATTTCAGGGGTCAGTAGTGCTCTCACGGTCACCTCAGCGAACGGTATTGCATGAACGCAGAAGAAAAAATTCAGCCATCACGCAGTA > Xen14_12/39‑337 | aCTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGTGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAg > 1:1018641/1‑150 (MQ=255)aCTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAg < 1:3825451/150‑1 (MQ=255)aCTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAg < 1:1981478/150‑1 (MQ=255) cTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGTAGATCTGATCAAGAGACAGc > 1:3642299‑M2/1‑149 (MQ=255) cTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGc < 1:2189923‑M2/150‑2 (MQ=255) cTGGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCC‑GGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGcc < 1:693320‑M2/150‑3 (MQ=255) cTGGCGAAACTGAGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCATGAGATCTGATCAAGAGACAgg < 1:1559598/150‑1 (MQ=255) ggCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGTTTGGGTATTCATTTGGGATGGCTGGTTTAGACTTCAGGATATGGGTGAGGGTTACCTGGTGAGGAAGCCTCTTGATCAGGAGATCTGAGCAAGAGACAGGgg < 1:2283342‑M1/150‑3 (MQ=255) gNGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGctgt < 1:3798449‑M2/150‑5 (MQ=255) gCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGcggt > 1:655800‑M2/1‑146 (MQ=255) gCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGcggt > 1:2720173‑M2/1‑146 (MQ=255) gCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGcggt > 1:2377945‑M2/1‑146 (MQ=255) cGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGcggta < 1:1690626‑M2/150‑6 (MQ=255) cGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGagcta > 1:1601628‑M1/1‑145 (MQ=255) cGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGGccag > 1:3746995/1‑147 (MQ=255) cGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGT‑ACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGGGACAGccccag < 1:3154589‑M2/150‑7 (MQ=255) cGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGCAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGctgtc < 1:1187837‑M2/150‑6 (MQ=255) cGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCG‑CACGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGATGATGAAGTCTCTTGATCAGGGGGTCTGATCAAGAGACAGtcagca > 1:2726741‑M1/1‑144 (MQ=255) 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aaaCTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCG‑CCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGtcagcatg > 1:1472542‑M1/1‑142 (MQ=255) cacTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGcattaagc < 1:2699749‑M2/149‑9 (MQ=255) aaCTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGcattaagc < 1:2034618‑M2/150‑9 (MQ=255) aCTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGctgtccgcc < 1:3549269‑M2/150‑10 (MQ=255) aCTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTCGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATCAGGAGATCTGATCAAGAGACAGccgcacagg < 1:894808‑M2/150‑10 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |