| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_106 | = 1601 | 115 (1.200) | 94 (0.230) | 37/296 | 1.9 | 62.1% | coding (17/453 nt) | Xen14_04641 | IS256 family transposase IS1414 |
| ? | Xen14_167 | = 666 | 0 (0.000) | intergenic (+42/–) | Xen14_04773/– | IS3 family transposase IS629/– | |||||
Only 100 of 209 total aligned reads displayed.
AAAATCATTGGAATATCGCGATGGAGCGCCCCATTACCCATGAGGCGATCAATTGCAAAAGAGCCTGTGCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACAGGCTCTGGCTAACGAACTGTCCAAAAACCTCAAAACCCCTGAAGACCTCAGTCAGTTTGATCGGCTGCTGAAAAAGCTCAGCGTTGAAGCCGCTCTCAATGCTGAGATGACACACCATCTTGGGTATGAGAAAAATCAGTCCAGAC > Xen14_106/1453‑1750 | aaaaTCATTGGAATATCGCGATGGAGCGCCCCATTACCCATGATGCGATCAATTGCAAAAGAGCCTGTGCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTa < 1:2310010/150‑1 (MQ=255) aTTGGAATATCGCGATGGAGCGCCCCATTACCCATGAGGCGATCAATTGCAAAAGAGCCTGTGCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACAGGct > 1:2192363/1‑150 (MQ=255) atCGCGATGGAGCGCCCCATTACCCATGAGGCGATCAATTGCAAAAGAGCCTGTGCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACAGGCTCTGGCTaa > 1:1511380/1‑150 (MQ=255) atCGCGATGGAGCGCCCCATTACCCATGAGGCGATCAATTGCAAAAGAGCCTGTGCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACAGGCTCTGGCTaa > 1:3054059/1‑150 (MQ=255) gcgATGGAGCGCCCCATTACCCATGAGGCGATCAATTGCAAAAGAGCCTGTGCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACAGGCTCTGGCTAACGa > 1:1765081/1‑150 (MQ=255) gcgATGGAGCGCCCCATTACCCATGAGGCGATCAATTGCAAAAGAGCCTGTGCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACAGGCTCTGGCTAACGa > 1:1765084/1‑150 (MQ=255) gcgATGGAGCGCCCCATTACCCATGAGGCGATCAATTGCAAAAGAGCCTGTGCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACAGGCTCTGGCTAACGa > 1:2190637/1‑150 (MQ=255) aGCGCCCCATTACCCATGAGGCGATCAATTGCAAAAAAGCCTGTGCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACAGGCTCTGGCTAACGAACTGTcc > 1:2036485/1‑150 (MQ=255) cgcCCCATTACCCATGAGGCGATCAATTGCAAAAGAGCCTGTGCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACAGGCTCTGGCTAACGAACTGTCCaa < 1:2297550/150‑1 (MQ=255) ccccATTACCCATGAGGCGATCAATTGCAAAAGAGCCTGTGCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGCTACAGGCTCTGGCTAACGAACTGTCCacaa > 1:3013611/1‑147 (MQ=255) ccATTACCCATGAGGCGATCAATTGCAAAAGAGCCTGTGCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACAGGCTCTGGCTAACGAACTGTCCAAAAAc > 1:1422599/1‑150 (MQ=255) cATTACCCATGAGGCGATCAATTGCAAAAGAGCCTGTGCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACAGGCTCTGGCTAACGAACTGTCCAAAAAcc < 1:258761/150‑1 (MQ=255) cATTACCCATGAGGCGATCAATTGCAAAAGAGCCTGTGCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACAGGCTCTGGCTAACGAACTGTCCAAAAAcc < 1:258759/150‑1 (MQ=255) 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ccTGTGCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACAGGCTCTGGCTAACGAACTGTCCAAAAACCTCAAAACCCCTGAAGACCTCAGTCAGTTTGAt > 1:3490734/1‑150 (MQ=255) cTGTGCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACAGGCTCTGGCTAACGAACTGTCCAAAAACCTCAAAACCCCTGAAGACCTCAGTCAGTTTGATc < 1:2278174/150‑1 (MQ=255) cTGTGCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACAGGCTCTGGCTAACGAACTGTCCAAAAACCTCAAAACCCCTGAAGACCTCAGTCAGTTTGATc < 1:1581081/150‑1 (MQ=255) tgtgCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACAGGCTCTGGCTAACGAACTGTCCAAAAACCTCAAAACCCCTGAAGACCTCAGTCAGTTTGATCg < 1:1476180/150‑1 (MQ=255) gCATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACAGGCTCTGGCTAACGAACTGTCCAAAAACCTCAAAACCCCTGAAGACCTCAGTCAGTTTGATCGgct < 1:2529184/150‑1 (MQ=255) aTAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACAGGCTCTGGCTAACGAACTGTCCAAAAACCTCAAAACCCCTGAAGACCTCAGTCAGTTTGATCGgctgc > 1:419477/1‑150 (MQ=255) aTAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACAGGCTCTGGCTAACGAACTGTCCAAAAACCTCAAAACCCCTGAAGACCTCAGTCAGTTTGATCGgctgc > 1:2193970/1‑150 (MQ=255) tAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACAGGCTCTGGCTAACGAACTGTCCAAAAACCTCAAAACCCCTGAAGACCTCAGTCAGTTTGATCGgctgct < 1:3133589/150‑1 (MQ=255) gATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATCCAGCATCAAATGAAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTACAGGCTCTGGCTAACGAACTGTCCAAAAACCTCAAAACCCCTGAAGACCTCAGTCAGTTTGATCGgct > 1:3531103/1‑145 (MQ=255) tGATTTTGATATGTTCAATCCAACATCAAAAGCAGGTTAATTTATGGACGAAAAACAGTTtgaaccgccccgggtttcctggagagtgttttatctgtgaactcaggctgccagatcatcgtttccgatggaagcataataagctttttc < 1:1096454‑M1/150‑91 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |