| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_105 | 3420 = | 131 (0.870) | 123 (1.300) | 52/186 | 0.1 | 74.9% | intergenic (+42/+32) | hypF/Xen14_04636 | Carbamoyltransferase HypF/IS3 family transposase IS1397 |
| ? | Xen14_49 | 56 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+131) | –/gldA | –/Glycerol dehydrogenase | |||||
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
TGCTCTTTCCACAGAGTTTACCGGCGGGTGACGGCGGGTTGTCTCTGGGGCAGGGGGTTATTGTTGCGGCGCGTTGGTTGGCAGGGGAAGTCCAGAACGGATAAAACGTGCTGCATTTGGACACCATTGCCGGATGCGGCG‑TAAATGAACTGAACCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCGGTATTCTACCGGGCTGAGTCCCCCAAGACTGAGTTTTATTCTTTTTTGATTCCAGTAAGTTATGTATTCGTTAACGGCATTTTCCAGCTC > Xen14_105/3275‑3568 | tGCTCTTTCCACAGAGTTTACCGGCGGGTGACGGCGGGTTGTCTCTGGGGCAGGGGGTTATTGTTGCGGCGCGTTGGTTGGCAGGGGAAGTCCAGAACGGATAAAACGTGCTGCATTTGGACACCATTGCCGGATGCGGCG‑TAAAtgaac < 1:2418056/150‑1 (MQ=255)tGCTCTTTCCACAGAGTTTACCGGCGGGTGACGGCGGGTTGTCTCTGGGGCAGGGGGTTATTGTTGCGGCGCGTTGGTTGGCAGGGGAAGTCCAGAACGGATAAAACGTGCTGCATTTGGACACCATTGCCGGATGCGGCG‑TAAAtgaac < 1:3772100/150‑1 (MQ=255) tctTTCCACAGAGTTTACCGGCGGGTGACGGCGGGTTGTCTCTGGGGCAGGGGGTTATTGTTGCGGCGCGTTGGTTGGCAGGGGAAGTCCAGAACGGATAAAACGTGCTGCATTTGGACACCATTGCCGGATGCGGCG‑TAAAtgaactga > 1:756079/1‑150 (MQ=255) 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tctcTGGGGCAGGGGGTTATTGTTGCGGCGCGTTGGTTGGCAGGGGAAGTCCAGAACGGATAAAACGTGCTGCATTTGGACACCATTGCCGGATGCGGCG‑TAAATGAACTGAACCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCttttt > 1:2488149/1‑150 (MQ=255) ctctGGGGCAGGGGGTTATTGTTGCGGCGCGTTGGTTGGCAGGGGAAGTCCAGAACGGATAAAACGTGCTGCATTTGGACACCATTGCCGGATGCGGCG‑TAAATGAACTGAACCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTg < 1:477765/150‑1 (MQ=255) ctctGGGGCAGGGGGTTATTGTTGCGGCGCGTTGGTTGGCAGGGGAAGTCCAGAACGGATAAAACGTGCTGCATTTGGACACCATTGCCGGATGCGGCG‑TAAATGAACTGAACCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTg < 1:1505999/150‑1 (MQ=255) ggggCAGGGGGTTATTGTTGCGGCGCGTTGGTTGGCAGGGGAAGTCCAGAACGGATAAAACGTGCTGCATTTGGACACCATTGCCGGATGCGGCG‑TAAATGAACTGAACCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATAc < 1:82940/150‑1 (MQ=255) ggCAGGGGGTTATTGTTGCGGCGCGTTGGTTGGCAGGGGAAGTCCAGAACGGATAAAACGTGCTGCATTTGGACACCATTGCCGGATGCGGCG‑TAAATGAACTGAACCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTc > 1:1149769/1‑150 (MQ=255) attgcctgatgcgctacgcttatcaggcctacgcaatctctgcaatatagtaaatttacgtacttttgtaggccggataaggcgttcacTGAACTGAACCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGCCCGGt < 1:872231‑M1/61‑1 (MQ=255) ttgcctgatgcgctacgcttatcaggcctacgcaatctctgcaatatagtaaatttacgtacttttgtaggccggataaggcgttcacTGAACTGAACCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCGGTa > 1:860652‑M1/89‑150 (MQ=255) ttgttgCGGCGCGTTGGTTGGCAGGGGAAATCCAGAACGGATAAAACGTGCTGCATTTGGACACCATTGCCGGATGCGGCG‑TAAATGAACTGAACCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCGGTATTc < 1:847162/150‑1 (MQ=255) gttgCGGCGCGTTGGTTGGCAGGGGAAGTCCAGAACGGATAAAACGTGCTGCATTTGGACACCATTGCCGGATGCGGCG‑TAAATGAACTGAACCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCGGTAt > 1:530055/1‑146 (MQ=255) atgcgctacgcttatcaggcctacgcaatctctgcaatatagtaaatttacgtacttttgtaggccggataaggcgttcacTGAACTGAACCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCGGTATTCTAcc < 1:1372116‑M1/69‑1 (MQ=255) 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tcacTGAACTGAACCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCGGTATTCTACCGGGCTGAGTCCCCCAAGACTGAGTTTTATTCTTTTTTGATTCCAGTAAGTTATGTATTCGTTAACGGCATTTTCCAg < 1:2099148‑M1/146‑1 (MQ=255) tAAATGAACTGAACCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCGGTATTCTACCGGGCTGAGTCCCCCAAGACTGAGTTTTATTCTTTTTTGATTCCAGTAAGTTATGTATTCGTTAACGGCATTTTCCAg < 1:1293055/150‑1 (MQ=255) gctaTGAACTGAACCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCGGTATTCTACCGGGCTGAGTCCCCCAAGACTGAGTTTTATTCTTTTTTGATTCCAGTAAGTTATGTATTCGTTAACGGCATTTTCCAg < 1:3099439/147‑1 (MQ=255) gccaTGAACTGAACCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCGGTATTCTACCGGGCTGAGTCCCCCAAGACTGAGTTTTATTCTTTTTTGATTCCAGTAAGTTATGTATTCGTTAACGGCATTTTCCAg < 1:2927846/147‑1 (MQ=255) aaaTGAACTGAACCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCGGTATTCTACCGGGCTGAGTCCCCCAAGACTGAGTTTTATTCTTTTTCGATTCCAGTAAGTTATGTATTCGTTAACGGCATTTTCCAGc < 1:293806/150‑1 (MQ=255) 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tgaactgaacCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCGGTATTCTACCGGGCTGAGTCCCCCAAGACTGAGTTTTATTCTTTTTTGATTCCAGTAAGTTATGTATTCGTTAACGGCATTTTCCa > 1:3233318/1‑145 (MQ=255) tgaactgaacCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCGGTATTCTACCGGGCTGAGTCCCCCAAGACTGAGTTTTATTCTTTTTTGATTCCAGTAAGTTATGTATTCGTTAACGGCATTTTCCa > 1:3233316/1‑145 (MQ=255) | TGCTCTTTCCACAGAGTTTACCGGCGGGTGACGGCGGGTTGTCTCTGGGGCAGGGGGTTATTGTTGCGGCGCGTTGGTTGGCAGGGGAAGTCCAGAACGGATAAAACGTGCTGCATTTGGACACCATTGCCGGATGCGGCG‑TAAATGAACTGAACCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCGGTATTCTACCGGGCTGAGTCCCCCAAGACTGAGTTTTATTCTTTTTTGATTCCAGTAAGTTATGTATTCGTTAACGGCATTTTCCAGCTC > Xen14_105/3275‑3568 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |