| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_168 | = 629 | 0 (0.000) | 62 (0.100) +ACCCCCAGCCTAGCT |
43/266 | 0.1 | 90.2% | intergenic (‑111/–) | Xen14_04774/– | IS200/IS605 family transposase IS200C/– |
| ? | Xen14_29 | = 59 | 15 (0.280) | intergenic (–/+64) | –/trpA | –/Tryptophan synthase alpha chain | |||||
CTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_168/497‑629‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATCAAGAGACTTCATCACCAGGTAACCCTCAACCA < Xen14_29/59‑2 ||||||||||||||| CTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCTGCCTAGCTCT < 1:383880/150‑1 AAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGT > 1:3458230/1‑150 AGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTC < 1:629522/150‑1 GCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTCAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCT > 1:1306430/1‑150 TCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCNTAGCTCTGTCTCT < 1:2863484/150‑1 CTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTT < 1:3624612/150‑1 TTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTG < 1:1953370/150‑1 TTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTG < 1:1953371/150‑1 TTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTGGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTG < 1:1953366/150‑1 TTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGA < 1:2788390/150‑1 TTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGAT < 1:2783700/150‑1 TTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGAT < 1:2783695/150‑1 TTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGAT < 1:2783690/150‑1 TTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGAT < 1:1822332/150‑1 TTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGAT < 1:1822333/150‑1 TCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATC < 1:3446635/150‑1 CGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCA > 1:2463608/1‑150 CGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCA < 1:849779/150‑1 GTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCATCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAG < 1:2759482/150‑1 GTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTTTTGATCAG > 1:358298/1‑150 CCCCATTGGGACCCCCTTCTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATC < 1:1658844/150‑1 CCCCATCGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATC < 1:3554543/150‑1 CCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCT > 1:942159/1‑150 atttGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCT < 1:1554944/146‑1 ATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCT < 1:1554946/150‑1 ATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCT < 1:1569397/150‑1 TTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTG < 1:3495578/150‑1 TGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGA < 1:651308/150‑1 TGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGA < 1:49238/150‑1 GGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGAT < 1:417974/150‑1 GGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGAT > 1:1434280/1‑150 GGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATC < 1:1408978/150‑1 GGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATC < 1:104897/150‑1 GGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATC < 1:1408979/150‑1 ggCCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATCA < 1:637554/148‑1 GACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTAGATCAGATCTCCTGATCA < 1:1395432/150‑1 GACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTAGATCAGATCTCCTGATCA < 1:1395427/150‑1 CCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATCAAG < 1:1074520/150‑1 CCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATCAAGA < 1:2487237/150‑1 CCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATCAAGAG < 1:618774/150‑1 CCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATCAAGAG < 1:618772/150‑1 CCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATCAAGAG < 1:1877459/150‑1 CCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATCAAGAG < 1:1743910/150‑1 CCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTGTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATCAAGAG < 1:1743913/150‑1 CTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATCAAGAGAC < 1:1133242/150‑1 TTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATCAAGAGACT > 1:3809823/1‑150 TTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATCAAGAGACTT > 1:619491/1‑150 TGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATCAAGAGACTTCA > 1:3596782/1‑150 TGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATCAAGAGACTTCA < 1:2798511/150‑1 ATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATCAAGAGACTTCATC > 1:2776504/1‑150 TTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCGAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATCAAGAGGCTTCATCAC < 1:2015824/150‑1 TTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCA > 1:1662158/1‑123 TCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATCAAGAGACTTCATCACC > 1:628638/1‑150 CTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATCAAGAGACTTCAT < 1:2231833/145‑1 TTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATCAAGAGACTTCATCACCAG > 1:159145/1‑150 TTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATCAAGAGACTTCATCACCAG < 1:2556844/150‑1 GTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAGGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATCAAGAGACTTCATCACCAGGT > 1:2413080/1‑150 TTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATCAAGAGACTTCATCACCAGGTAA > 1:12043/1‑150 CTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATCAAGAGACTTCATCACCAGGTAACCCTCA > 1:3434999/1‑150 CTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATCAAGAGACTTCATCACCAGGTAACCCTCA > 1:3229979/1‑150 TGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATCAAGAGACTTCATCACCAGGTAACCCTCAAC < 1:897787/150‑1 CAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAGCTCTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATCAAGAGACTTCATCACCAGGTAACCCTCAACCA > 1:1284502/1‑150 ||||||||||||||| CTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_168/497‑629‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTGTCTCTTGATCAGATCTCCTGATCAAGAGACTTCATCACCAGGTAACCCTCAACCA < Xen14_29/59‑2 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |