| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_159 | = 729 | 52 (0.420) | 50 (0.500) | 29/296 | 2.1 | 42.2% | intergenic (+397/–) | Xen14_04769/– | hypothetical protein/– |
| ? | Xen14_60 | = 18896 | 85 (1.080) | intergenic (+512/+385) | Xen14_04101/yeeW | hypothetical protein/Protein YeeW | |||||
TTGGCGATAGAGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_159/582‑729‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTATGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTTCCGGATCGAT < Xen14_60/18896‑18759 cTGGCGATAGAGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGT < 1:2276926/149‑1 GATAGAGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCATGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGCGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCG < 1:1295938/150‑1 GATAGAGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCG < 1:1500813/150‑1 GATAGAGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGCGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCG < 1:1295939/150‑1 AGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAAC < 1:3677542/150‑1 GCGTTGATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGCATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGATCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACG < 1:975237/150‑1 GCGTTGATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGCATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGATCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACG < 1:975236/150‑1 AATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCA > 1:2363185/1‑150 ACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTAT > 1:3132959/1‑150 AATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGTTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGC < 1:3623295/150‑1 TTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGTTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTT < 1:3711326/150‑1 TGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGCAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTA < 1:286460/150‑1 TGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGCAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTA < 1:286458/150‑1 TGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGCAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTA < 1:286456/150‑1 TGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGCAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTA < 1:286452/150‑1 CAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTA < 1:3815339/150‑1 CAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTA < 1:3815338/150‑1 CAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTACGTATTTGCATCGCTTTAAGATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTA < 1:3815340/150‑1 TAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGT > 1:3313923/1‑150 AATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTG < 1:791432/150‑1 TCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAG < 1:2770678/150‑1 TCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAG < 1:705099/150‑1 TCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGCGAG > 1:707575/1‑150 TCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGCGAG > 1:707570/1‑150 TGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAATATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAG > 1:704038/1‑150 GGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGG < 1:659581/150‑1 TATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCC < 1:109882/150‑1 TATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCC < 1:1544634/150‑1 ATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTATGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCA < 1:2687738/150‑1 ATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCA < 1:2820805/150‑1 ATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCA < 1:2820804/150‑1 CCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATT > 1:2271971/1‑150 CTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACTGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACTGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTTGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCA < 1:3578543/150‑1 CGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTAc < 1:1389060/150‑2 GGTTTGGGTGTGGGACCGGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCATATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATT < 1:1143860/139‑1 GGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTCCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTAcg > 1:1878841/1‑148 TTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCT > 1:1631099/1‑150 TTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCT > 1:2114893/1‑150 GTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAA < 1:1746157/150‑1 GTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAA < 1:1746158/150‑1 GTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAA < 1:1746159/150‑1 GTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAA < 1:1746160/150‑1 TGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAATAT > 1:2343973/1‑150 GGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAATATGG > 1:3009706/1‑150 ACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCCGAATATGGCG > 1:534806/1‑150 ACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAATATGGCG > 1:534810/1‑150 ACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAATATGGCG > 1:534811/1‑150 GTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTTCCGGAT < 1:730918/150‑1 GTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTTCCGGAT < 1:730922/150‑1 CTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTTCCGGATCGAT > 1:641685/1‑150 TTGGCGATAGAGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_159/582‑729‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTATGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTTCCGGATCGAT < Xen14_60/18896‑18759 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |