| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_134 | 212 = | 89 (0.860) | 41 (0.430) +GTATCAGTTAGCG |
29/270 | 1.7 | 33.9% | intergenic (–/+635) | –/Xen14_04742 | –/tRNA‑Arg(tct) |
| ? | Xen14_134 | = 213 | 86 (0.830) | intergenic (–/+634) | –/Xen14_04742 | –/tRNA‑Arg(tct) | |||||
GTTACGGTAAAAAGTGATTGCTTACTGTTTTTGTGAATGGCATTGCAGCAGCCGGATAATGTCAGTGCTGGCTGACGGTGTACTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen14_134/360‑212‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTGGTTTGCGGGGAGTTTGTTAAAAGAAACTGGCATGGTGAATCCACCTGTGCGGAGGGGCAATCAGCGA < Xen14_134/213‑99 ||||||||||||| GTTACGGTAAAAAGTGATAGCTTACTGTTTTTGTGAATGGCATTGCAGCAGCCAGATAATGTCAGTGCTGGCTGACGGTGTGCTGTTGGTGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGG < 1:3371533/150‑1GTTACGGGAAAAAGTGATAGCTTACTGTTTTTGTGAATGACATTGCAGCAGCCGGATAATGTCAGTGCTGGCTGACGGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGG < 1:2124461/150‑1 CGGTAAAAAGTGATAGCTTACTGTTTTTGTGAATGGCATTGCAGCAGCCGGATAATGTCAGTGCTGGCTGACGGTGTGCTGGCGGCGGGTGTGGCGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATC > 1:2062021/1‑150 GTAAAAAGTGATAGCTTACTGTTTTTGTGAATGGCATTGCAGCAGCCGGATAATGTCAGTGCTGGCTGAAGGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAG > 1:2941637/1‑150 AAAAGTGATAGCTTACTGTTTTTGTGAATGGCATTGCAGCAGCCGGATAATGTCAGTGCTGGCTGACGGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTA > 1:3188677/1‑150 AGTGATAGCTTACTGTTTTTGTGAATGGCATTGCAGCAGCCGGATAATGTCAGTGCTGGCTGACGGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCG < 1:24421/150‑1 AGTGATAGCTTACTGTTTTTGTGAATGGCATTGCAGCAGCCGGATAATGTCAGTGCTGGCTGACGGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCG < 1:24426/150‑1 TGATAGCTTACTGTTTTTGTGAATGGCATTGCAGCAGCCGGATAATGTCAGTGCTGGCTGACGGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGG > 1:2328677/1‑150 aGCTTACTGTTTTTGTGAATGGCATTGCAGCAGCCGGATAATGTCAGTGCTGGCTGACGGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAA < 1:186848/149‑1 CTTACTGTTTTTGTGAATGGCATTGCCGCAGCCGGATAATGTCAGTGCTGGCTGACGGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCGGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAAT < 1:3056902/150‑1 TACTGTTTTTGTGAATGGCATTGCAGCAGCCGGATAATGTCAGTGCTGGCTGACGGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTT > 1:1301120/1‑150 ACTGTTTTTGTGAATGGCATTGCAGCAGCCGGATAATGTCAGTGCTGGCTGACGGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTT < 1:1824260/150‑1 GCATTGCAGCAGCCGGATAATGTCAGTGCTGGCTGACGGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATT > 1:3304672/1‑150 ATTGCAGCAGCCGGATAATGTCAGTGCTGGCTGACGGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAGGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCA < 1:844100/150‑1 ATTGCAGCAGCCGGATAATGTCAGTGCTGGCTGACGGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAGGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCA < 1:844101/150‑1 ATTGCAGCAGCCGGATAATGTCAGTGCTGGCTGACGGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCA < 1:1045533/150‑1 TGCAGCAGCCGGATAATGTCAGTGCTGGCTGACGGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGG < 1:1599885/150‑1 GCAGCAGCCGGATAATGTCAGTGCTGGCTGACGGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGC < 1:515851/150‑1 CAGCAGCCGGATAATGTCAGTGCTGGCTGACGGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCG < 1:3818909/150‑1 CAGCAGCCGGATAATGTCAGTGCTGGCTGACGGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCG > 1:854879/1‑150 GTCAGTGCTGGCTGACGGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGCTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAANTTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTG > 1:3544030/1‑150 TCAGTGCTGGCTGACTGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGCATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATAC < 1:3819555/119‑1 TCAGTGCTGGCTGACGGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTGG < 1:2487729/150‑1 CAGTGCTGGCTGACGGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTGGT > 1:334106/1‑150 CAGTGCTGGCTGACGGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTGGT > 1:334103/1‑150 TGGCTGACGGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTGGTTTGCGG < 1:1161840/150‑1 TGGCTGACGGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTGGTTTGCGG < 1:3134098/150‑1 CTGACGGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAA‑GAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTGGTTTGCGGGGAG < 1:2695752/150‑1 CGGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTGGTTTGCGGGGAGTTT < 1:273479/150‑1 GGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTGGTTTGCGGGGAGTTTG > 1:368890/1‑150 GGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTGGTTTGCGGGGAGTTTG > 1:368891/1‑150 GGTGTGCTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTGGTTTGCGGGGAGTTTG > 1:368895/1‑150 CTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTGGTTTGCGGGGAGTTTGTTAAAA > 1:877304/1‑150 CTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTGGTTTGCGGGGAGTTTGTTAAAA < 1:701363/150‑1 CTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTGGTTTGCGGGGAGTTTGTTAAAA < 1:1913686/150‑1 CTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTGGTTTGCGGGGAGTTTGTTAAAA > 1:877300/1‑150 GGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTGGTTTGCGGGGAGTTTGTTAAAAGAAACTGGCATGGT < 1:618369/150‑1 GTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCANAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTGGTTTGCGGGGAGTTTGTTAAAAGAAACTGGCATGGTG < 1:3581162/150‑1 GGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTGGTTTGCGGGGAGTTTGTTAAAAGAAACTGGCATGGTGAA < 1:2187623/150‑1 TTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTGGTTTGCGGGGAGTTTGTTAAAAGAAACTGGCATGGTGAATC < 1:2655468/150‑1 TGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTGGTTTGCGGGGAGTTTGTTAAAAGAAACTGGCATGGTGAATCCccc < 1:2936091/150‑4 CTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGCGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTGGTTTGCGGGGAGT > 1:3799935/1‑116 CCCGTTGCGGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTGGTTTGCGGGGAGTTTGTTAAAAGAAACTGGCA < 1:2504997/131‑1 AAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTACATACTTCACAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTGGTTTGCGGGGAGTTTGTTAAAAGAAACTGGCATGGTGAATCCCCCTGTGCGGctgtctctt > 1:856708/1‑141 AGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTGGTTTGCGGGGAGTTTGTTAAAAGAAACTGGCATGGTGAATCCCCCTGTGCGGctgtctcttgatc < 1:466130/150‑14 GAAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTGGTTTGCGGGGAGTTTGTTAAAAGAAACTGGCATGGTGAATCCCCCTGTGCGGctgtctcttgatca < 1:2291670/150‑15 AAAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTGGTTTGCGGGGAGTTTGTTAAAAGAAACTGGCATGGTGAATCCCCCTGTGCGGctgtctcttgatcag < 1:1600065/150‑16 AAACGCCAGACTGTTAGCCGGGTATCAGTTAGCGGGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTGGTTTGCGGGGAGTTTGTTAAAAGAAACTGGCATGGTGAATCCCCCT > 1:296588/1‑128 ||||||||||||| GTTACGGTAAAAAGTGATTGCTTACTGTTTTTGTGAATGGCATTGCAGCAGCCGGATAATGTCAGTGCTGGCTGACGGTGTACTGGTGGCGGGTGTGGTGGTTGTTGCTTTCCCGTTGCTGAAAAAGAAAACGCCAGACTGTTAGCCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen14_134/360‑212‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAGAAATTTTTAAATACTTCACAATTCAGGCGGTTGACTGTTGTCTGGTTTGCGGGGAGTTTGTTAAAAGAAACTGGCATGGTGAATCCACCTGTGCGGAGGGGCAATCAGCGA < Xen14_134/213‑99 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |