| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_123 | 1 = | 0 (0.000) | 548 (0.820) +GCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACAT |
161/228 | 1.3 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | Xen14_205 | = 404 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 822 total aligned reads displayed.
CACGGTACTGGTTCACTATCGGTCAGTCAGGAGTATTTAGCCTTGGAGGATGGTCCCCCCATATTCAGACAGGATACCACGTGTCCCGCCCTACTCATCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen14_123/149‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC < Xen14_205/404‑256 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ACGGTACTGGTTCACTATCGGTCAGTCAGGAGTATTTAGCCTTGGAGGATGGTCCCCCCATATTCAGACAGGATACCACGTGTCCCGCCCTACTCATCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGCGC < 1:2512869/150‑1 TGGTTCACTATCGGTCAGTCAGGAGTATTTAGCCTTGGAGGATGGTCCCCCCATATTCAGACAGGATACCACGTGTCCCGCCCTACTCATCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGCGCGCCTTTC < 1:1669138/150‑1 GGTTCACTATCGGTCAGTCAGGAGTATTTAGCCTTGGAGGATGGTCCCCCCATATTCAGACAGGATACCACGTGTCCCGCCCTACTCATCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGCGCGCCTTTCC < 1:560556/150‑1 TTCACTATCGGTCAGTCAGGAGTATTTAGCCTTGGAGGATGGTCCCCCCATATTCAGACAGGATACCACGTGTCCCGCCCTACTCATCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGCGCGCCTTTCCAG < 1:1528241/150‑1 CACTATCGGTCAGTCAGGAGTATTTAGCCTTGGAGGATGGTCCCCCCATATTCAGACAGGATACCACGTGTCCCGCCCTACTCATCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGCGCGCCTTTCCAGAC < 1:2961209/150‑1 CTATCGGTCAGTCAGGAGTATTTAGCCTTGGAGGATGGTCCCCCCATATTCAGACAGGATACCACGTGTCCCGCCCTACTCATCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGCGCGCCTTTCCAGACGC > 1:2244233/1‑150 TATCGGTCAGTCAGGAGTATTTAGCCTTGGAGGATGGTCACCCCATATTCAGACAGGATACCACGTGTCCCGCCCTACTCATCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGCGCGCCTTTCCAGACGCT < 1:2829857/150‑1 GGTCAGTCAGGAGTATTTAGCCTTGGAGGATGGTCCCCCCATATTCAGACAGGATACCACGTGTCCCGCCCTACTCATCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCA > 1:2860595/1‑150 GGTCAGTCAGGAGTATTTAGCCTTGGAGGATGGTCCCCCCATATTCAGACAGGATACCACGTGTCCCGCCCTACTCATCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCCGTCACCCTGTATCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCA > 1:154723/1‑150 GTCAGGAGTATTTAGCCTTGGAGGATGGTCCCCCCATATTCAGACAGGATACCACGTGTCCCGCCCTACTCATCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAAC < 1:977714/150‑1 CAGGAGTATTTAGCCTTGGAGGATGGTCCCCCCATATTCAGACAGGATACCACGTGTCCCGCCCTACTCATCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAACAC > 1:1965696/1‑150 CAGGAGTATTTAGCCTTGGAGGATGGTCCCCCCATATTCAGACAGGATACCACGTGTCCCGCCCTACTCATCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAACAC < 1:1360726/150‑1 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1:2762009/1‑150 ACAGGATACCACGTGTCCCGCCCTACTCATCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACACTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGC > 1:1159767/1‑150 AGGATACCACGTGTCCCGCCCTACTCATCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACACTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCG > 1:1305587/1‑150 TACCACGTGTCCCGCCCTACTCATCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACACTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTAC < 1:488244/150‑1 ACCACGTGTCCCGCCCTACTCATCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACT > 1:629800/1‑150 ACCACGTGTCCCGCCCTACTCATCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACACTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACT > 1:3086685/1‑150 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CCTGTATCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACACTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCC < 1:3314224/150‑1 GTATCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAACNCACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCA < 1:1773720/150‑1 GTATCGCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCA < 1:3411503/150‑1 GCGCGCCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAAC > 1:445530/1‑150 CCTTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTCCCTCGAGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAATCTATG > 1:3639094/1‑150 TTTCCAGACGCTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGA < 1:2028856/150‑1 TTCCAGACGCTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGAT < 1:1089918/150‑1 CCAGACGCTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTC < 1:1414550/150‑1 ACGCTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTT < 1:112869/150‑1 ACGCTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTT < 1:834951/150‑1 CTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAAT > 1:1460960/1‑150 CTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAAT < 1:3208753/150‑1 CTTCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAAT > 1:3444469/1‑150 TCCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGA < 1:2208517/150‑1 CCACTAACACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGAT < 1:2919467/150‑1 CACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGATACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGT > 1:1183366/1‑150 ACACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTC < 1:1000214/150‑1 CACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCG < 1:2887177/150‑1 ACACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGA < 1:3734253/150‑1 CACATTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAA > 1:665222/1‑150 TTGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGT > 1:1490636/1‑102 |||||||||||||||||||||||||||||||||| CACGGTACTGGTTCACTATCGGTCAGTCAGGAGTATTTAGCCTTGGAGGATGGTCCCCCCATATTCAGACAGGATACCACGTGTCCCGCCCTACTCATCGAGCTCACAATATGTGCATTTTTGTGTACGGGGCTGTCACCCTGTATCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen14_123/149‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGATTCAGGCTCTGGGCTCCTCCCCGTTCGCTCGCCGCTACTGGGGGAATCTCGGTTGATTTCTTTTCCTCGGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC < Xen14_205/404‑256 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |