| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_12 | = 189 | 60 (0.770) | 85 (1.240) | 39/294 | 0.3 | 58.8% | intergenic (–/+139) | –/Xen14_01540 | –/hypothetical protein |
| ? | Xen14_21 | = 59 | NA (NA) | intergenic (–/+18) | –/add | –/Adenosine deaminase | |||||
GGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_12/42‑189‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGGCTCTCTTACCAGCCGCGCCCTAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen14_21/59‑1 GGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGTTTGGGTATTCATTTGGGATGGCTGGTTTAGACTTCAGGATATGGGTGAGGGTTACCTGGTGAGGAAGCCTCTTGATC‑AGGAGATCTGAGCAAGAGACAGGGg < 1:2283342/150‑2GGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGC > 1:63930/1‑150 CGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCAT > 1:3005909/1‑150 GAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGgtac > 1:3170595/1‑146 GAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCACCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGgtac > 1:3170596/1‑146 CTGGGGCGATGGCGTGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGgtacagag > 1:1113944/1‑142 CTGGGGCGATGGCGTGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGgtacagag > 1:1113945/1‑142 CTGGGGCGATGGCGTGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGgtacagag > 1:1113941/1‑142 TGGGGCGATGGCATAACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGACGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAATTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGG < 1:2444978/150‑1 aGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGgtacagagaga < 1:885118/149‑12 aGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGgtacagagaga < 1:2459329/149‑12 GGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGgtacagagaga < 1:928142/150‑12 GGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGgtacagagaga < 1:928141/150‑12 GGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGgtacagagaga < 1:928140/150‑12 GGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGgtacagagaga < 1:928137/150‑12 GGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGgtacagagaga > 1:2418305/1‑139 GGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGG < 1:2532292/150‑1 GGCGATGGCATGACAACAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGGAGTCATGTGGGATGGCGGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGG < 1:2532290/150‑1 GCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGT > 1:2343528/1‑150 GCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGT > 1:2103850/1‑150 CGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTT > 1:866282/1‑150 GATGGCATGACAGCAAANGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGgtacagagagaggca > 1:2580223/1‑135 GATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGgtacagagagaggca < 1:3521206/150‑16 GATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGgtacagagagaggca > 1:2961763/1‑135 ATGGCATGACAGCAAACGCACCGTTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATGTGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATA‑AGGAGATCGAATAAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTT < 1:2585740/150‑1 TGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTT < 1:2628310/150‑1 TGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTT < 1:54598/150‑1 ggaagGACAACAAACGCACCGTTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGGGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGGGAGGAATTCTCTGGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTC < 1:2586363/145‑1 GGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAATTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTC < 1:3264930/150‑1 GGCATGACAACAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTC < 1:3141200/150‑1 GCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGCTCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCA > 1:3677159/1‑150 ATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAATTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAA < 1:3522493/150‑1 ATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAA > 1:3712258/1‑150 TGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAAT < 1:2206726/150‑1 GACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTTCTCGAGG‑GATCTTATCAAGAGACAGGGCATAGCCAGAGGTTTTTCAAATG > 1:2589531/1‑150 ACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCAGGAGGTTTTTCAAATGC > 1:2615142/1‑150 caaCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCG < 1:1133715/147‑1 CAGCAAACGCACCGTTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGAGGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCG < 1:1133719/150‑1 AGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGC > 1:1547454/1‑150 GCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCC > 1:1964584/1‑150 CAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCT > 1:2667321/1‑150 CAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCT > 1:2667319/1‑150 CAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTAATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCT > 1:2667318/1‑150 CAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGATAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCT > 1:2667316/1‑150 AACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGGAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTAT < 1:2825057/150‑1 ACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATA < 1:149231/150‑1 ACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATA < 1:149235/150‑1 ACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATA < 1:149234/150‑1 ACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGAGGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATGGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATA < 1:1298616/150‑1 ACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGGAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATGGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATA < 1:1298613/150‑1 CACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGa > 1:1306310/1‑149 CACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGa > 1:1306308/1‑149 CGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCCAATGCGCATATAAGACTCTCTT > 1:2230349/1‑150 GCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATTAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTA > 1:1780426/1‑150 GCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTA > 1:1284116/1‑150 GCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTA > 1:1780425/1‑150 GCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTA > 1:1780422/1‑150 GCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGAAAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTA > 1:1353896/1‑150 CCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTAC > 1:509205/1‑150 CCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTAC > 1:3285788/1‑150 cctGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGTTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACTTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTACC < 1:2226481/147‑1 CCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTACCA > 1:252329/1‑150 GGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAGGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGATAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTACCAGC < 1:716346/150‑1 GGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAGGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGATAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTACCAGC < 1:716345/150‑1 GGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAGGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGATAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTACCAGC < 1:716344/150‑1 GTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTACCAGCC < 1:1277852/150‑1 GTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAACCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTCCCAGCC > 1:1911590/1‑150 TGGGTAATCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTACCAGCCGC > 1:819663/1‑150 TGGGTAATCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTACCAGCCGC > 1:819661/1‑150 TAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGGTCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTACCAGCCGCGCCC < 1:37555/150‑1 TAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTACCAGCCGCGCCC < 1:241449/150‑1 ggtaATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTAAGGATGTGGTGGGGGGTTACCTGGGGAGGAAGTCTTTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTACCAGCCGCGCCCT < 1:13328/146‑1 AGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTACCAGCCGCGCCCT < 1:2321541/150‑1 AGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGCGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATAAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAAGGCGCCTATAAGACTCTCTTACCAGCCGCGCCCT < 1:13331/150‑1 GTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTACCAGCCGCGCCCTA > 1:355062/1‑150 GTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTACCAGCCGCGCCCTA > 1:3103696/1‑150 CATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTACCAGCCGCGCCCTAA < 1:2378812/149‑1 ATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAATTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTACCAGCCGCGCCCTAACa < 1:1570303/150‑2 ATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTACCAGCCGCGCCCTAACa > 1:2188039/1‑149 ATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTAGGGATATGTTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTACCAGCCGCGCCCTAACa < 1:1570302/150‑2 GGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTACCAGCCGCGCCCTAACaggcg < 1:3666968/150‑6 GATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTACCAGCCG < 1:2165149/134‑1 ATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAATTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTACCAGCCGCGCCCTAACaggcgcac < 1:142662/150‑9 GGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTACCAGCCGCGCCCTAACaggcgcacac < 1:1678005/150‑11 GGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGACTCTCTTACCAGCCGCGCCCTAACaggcgcacac < 1:1303873/150‑11 GGCGAAACTGGGGCGATGGCATGACAGCAAACGCACCGGTCGCCCCGGTTGGGTAGTCATGTGGGATGGCTGGTTCAGACTTCAGGATATGGTTGAGGGTTACCTGGTGATGAAGTCTCTTGATC‑AGGAGATCTGATCAAGAGACAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_12/42‑189‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gGCATAGCCGGAGGTTTTTCAAATGCGCCTATAAGGCTCTCTTACCAGCCGCGCCCTAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Xen14_21/59‑1 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |