| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_1 | = 242479 | 1141 (16.420) | 347 (4.750) | 103/286 | 0.0 | 23.9% | coding (67/375 nt) | Xen14_00217 | IS3 family transposase ISLad1 |
| ? | Xen14_186 | 394 = | NA (NA) | intergenic (‑103/–) | Xen14_04784/– | IS3 family transposase ISCfr6/– | |||||
Only 100 of 347 total aligned reads displayed.
ACCACCGGCATCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_1/242331‑242479‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccctgGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_186/394‑465 ACCACCGGCATCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGG < 1:3714894/150‑1ACCACCGGCATCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGG < 1:3623068/150‑1 CCACCGGCATCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGA < 1:938746/150‑1 CCACCGGCATCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCACTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGA > 1:3835359/1‑150 CCGGCATCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGC < 1:2074946/150‑1 CGGCATCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCC < 1:2127133/150‑1 CGGCATCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCC < 1:962824/150‑1 GGCATCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCC > 1:1348940/1‑150 GGCATCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCC > 1:2211922/1‑150 GGCATCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCC < 1:3177343/150‑1 GGCATCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGGGATGTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGACCTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCC > 1:721371/1‑150 GCATCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCT < 1:830762/150‑1 CCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTA > 1:2209252/1‑150 CATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAA > 1:2406657/1‑150 CATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAA < 1:2059268/150‑1 ATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAG > 1:2389858/1‑150 ATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTCTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGAGCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAG < 1:3089932/150‑1 TCGTTCTTCATACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAG < 1:3721153/150‑1 CGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGT > 1:3503957/1‑150 GTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTC < 1:1705102/150‑1 TTCTCCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCAAAATAACCGCCAGAACTGCCTGCTCGTATAATGACCACCCTGGACGCCCTTCCAAGAGgca > 1:2264123/1‑147 TCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAA > 1:162616/1‑150 cttcaggagtCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAG > 1:3806113/11‑150 CTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAG > 1:1711668/1‑150 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1:101248/1‑150 TCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCC < 1:3295829/150‑1 AGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGT < 1:2209739/150‑1 AGACTCCTGAAGAAGCGTTCAATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCACGCCGT > 1:1145755/1‑150 ACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTA < 1:3067212/150‑1 ACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTA < 1:3067208/150‑1 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1:1753301/1‑150 AAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGAT > 1:3126974/1‑150 AAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGAT > 1:3418601/1‑150 GAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGC < 1:1067925/150‑1 GCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCGCAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGT > 1:158179/1‑150 GCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGT < 1:2317536/150‑1 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AGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGT < 1:1853258/150‑1 GTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTA > 1:2103590/1‑150 TTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTTGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGG > 1:3212770/1‑114 TTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAAT < 1:1389365/150‑1 TTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAAT > 1:2817482/1‑150 TCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCATGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATG < 1:1046795/150‑1 TCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATG < 1:1983022/150‑1 CGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTA < 1:2668632/150‑1 GCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTAT > 1:1470523/1‑150 GCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaa < 1:1994088/150‑3 CTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttc > 1:2522911/1‑143 ATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATTGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttcgcg > 1:1898790/1‑140 ATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttcgcg < 1:2005147/150‑11 ATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttcgcg > 1:125555/1‑140 ACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttcgcgtg < 1:196670/150‑13 CTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttcgcgtga > 1:3678798/1‑137 CTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttcgcgtga > 1:2786201/1‑137 CTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttcgcgtga > 1:2028699/1‑137 TCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttcgcgtgag < 1:371073/150‑15 CTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttcgcgtgaga < 1:2960813/150‑16 TGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTGGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTATaaacttcgcg > 1:3757158/1‑130 ACCACCGGCATCCATTCGTTCTTCAGACTCCTGAAGAAGCGTTCCATTGGGCTGTTATCCCAGCAGTTTCCGCGCCGGCTCATACTCTGCGTGATCTGGTATCGCCACAATAACTGCCGGAACTGCCTGCTCGTATAATGACTACCCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_1/242331‑242479‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccctgGACGCCCTTCTAAGAGTCAAGCCGTTATCGGGATGCTGTTGATCTGCCTGTTTTGATTACGCAGTAATGTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_186/394‑465 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |