/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964451.0.fna -queryname NZ_DS9964451.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964451.0.fna -queryname NZ_DS9964451.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964451.0.fna -queryname NZ_DS9964451.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964571.9.fna -queryname NZ_DS9964571.9
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964571.9.fna -queryname NZ_DS9964571.9
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964571.9.fna -queryname NZ_DS9964571.9
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964501.10.fna -queryname NZ_DS9964501.10
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964501.10.fna -queryname NZ_DS9964501.10
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964501.10.fna -queryname NZ_DS9964501.10
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964531.11.fna -queryname NZ_DS9964531.11
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964531.11.fna -queryname NZ_DS9964531.11
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964531.11.fna -queryname NZ_DS9964531.11
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964551.12.fna -queryname NZ_DS9964551.12
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964551.12.fna -queryname NZ_DS9964551.12
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964551.12.fna -queryname NZ_DS9964551.12
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964431.13.fna -queryname NZ_DS9964431.13
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964431.13.fna -queryname NZ_DS9964431.13
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964431.13.fna -queryname NZ_DS9964431.13
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964471.14.fna -queryname NZ_DS9964471.14
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964471.14.fna -queryname NZ_DS9964471.14
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964471.14.fna -queryname NZ_DS9964471.14
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964491.15.fna -queryname NZ_DS9964491.15
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964491.15.fna -queryname NZ_DS9964491.15
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964491.15.fna -queryname NZ_DS9964491.15
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964421.16.fna -queryname NZ_DS9964421.16
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964421.16.fna -queryname NZ_DS9964421.16
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964421.16.fna -queryname NZ_DS9964421.16
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_JH9764691.17.fna -queryname NZ_JH9764691.17
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_JH9764691.17.fna -queryname NZ_JH9764691.17
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_JH9764691.17.fna -queryname NZ_JH9764691.17
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_JH9764681.18.fna -queryname NZ_JH9764681.18
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_JH9764681.18.fna -queryname NZ_JH9764681.18
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_JH9764681.18.fna -queryname NZ_JH9764681.18
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964541.1.fna -queryname NZ_DS9964541.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964541.1.fna -queryname NZ_DS9964541.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964541.1.fna -queryname NZ_DS9964541.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_JH9764661.19.fna -queryname NZ_JH9764661.19
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_JH9764661.19.fna -queryname NZ_JH9764661.19
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_JH9764661.19.fna -queryname NZ_JH9764661.19
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_JH9764651.20.fna -queryname NZ_JH9764651.20
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_JH9764651.20.fna -queryname NZ_JH9764651.20
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_JH9764651.20.fna -queryname NZ_JH9764651.20
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_JH9764651.20.AOI.fna -queryname NZ_JH9764651.20
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_JH9764651.20.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_JH9764651.20.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -queryname NZ_JH9764651.20
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -table NZ_JH9764651.20.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_JH9764671.21.fna -queryname NZ_JH9764671.21
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_JH9764671.21.fna -queryname NZ_JH9764671.21
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_JH9764671.21.fna -queryname NZ_JH9764671.21
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_JH9764701.22.fna -queryname NZ_JH9764701.22
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_JH9764701.22.fna -queryname NZ_JH9764701.22
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_JH9764701.22.fna -queryname NZ_JH9764701.22
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000091.23.fna -queryname NZ_NFIJ010000091.23
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000091.23.fna -queryname NZ_NFIJ010000091.23
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000091.23.fna -queryname NZ_NFIJ010000091.23
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000181.24.fna -queryname NZ_NFIJ010000181.24
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000181.24.fna -queryname NZ_NFIJ010000181.24
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000181.24.fna -queryname NZ_NFIJ010000181.24
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000171.25.fna -queryname NZ_NFIJ010000171.25
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000171.25.fna -queryname NZ_NFIJ010000171.25
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000171.25.fna -queryname NZ_NFIJ010000171.25
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000311.26.fna -queryname NZ_NFIJ010000311.26
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000311.26.fna -queryname NZ_NFIJ010000311.26
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000311.26.fna -queryname NZ_NFIJ010000311.26
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000301.27.fna -queryname NZ_NFIJ010000301.27
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000301.27.fna -queryname NZ_NFIJ010000301.27
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000301.27.fna -queryname NZ_NFIJ010000301.27
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000061.28.fna -queryname NZ_NFIJ010000061.28
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000061.28.fna -queryname NZ_NFIJ010000061.28
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000061.28.fna -queryname NZ_NFIJ010000061.28
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964521.2.fna -queryname NZ_DS9964521.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964521.2.fna -queryname NZ_DS9964521.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964521.2.fna -queryname NZ_DS9964521.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000051.29.fna -queryname NZ_NFIJ010000051.29
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000051.29.fna -queryname NZ_NFIJ010000051.29
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000051.29.fna -queryname NZ_NFIJ010000051.29
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000131.30.fna -queryname NZ_NFIJ010000131.30
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000131.30.fna -queryname NZ_NFIJ010000131.30
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000131.30.fna -queryname NZ_NFIJ010000131.30
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000351.31.fna -queryname NZ_NFIJ010000351.31
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000351.31.fna -queryname NZ_NFIJ010000351.31
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000351.31.fna -queryname NZ_NFIJ010000351.31
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000011.32.fna -queryname NZ_NFIJ010000011.32
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000011.32.fna -queryname NZ_NFIJ010000011.32
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000011.32.fna -queryname NZ_NFIJ010000011.32
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000101.33.fna -queryname NZ_NFIJ010000101.33
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000101.33.fna -queryname NZ_NFIJ010000101.33
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000101.33.fna -queryname NZ_NFIJ010000101.33
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000341.34.fna -queryname NZ_NFIJ010000341.34
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000341.34.fna -queryname NZ_NFIJ010000341.34
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000341.34.fna -queryname NZ_NFIJ010000341.34
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000381.35.fna -queryname NZ_NFIJ010000381.35
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000381.35.fna -queryname NZ_NFIJ010000381.35
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000381.35.fna -queryname NZ_NFIJ010000381.35
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000321.36.fna -queryname NZ_NFIJ010000321.36
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000321.36.fna -queryname NZ_NFIJ010000321.36
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000321.36.fna -queryname NZ_NFIJ010000321.36
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000201.37.fna -queryname NZ_NFIJ010000201.37
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000201.37.fna -queryname NZ_NFIJ010000201.37
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000201.37.fna -queryname NZ_NFIJ010000201.37
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000161.38.fna -queryname NZ_NFIJ010000161.38
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000161.38.fna -queryname NZ_NFIJ010000161.38
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000161.38.fna -queryname NZ_NFIJ010000161.38
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964411.3.fna -queryname NZ_DS9964411.3
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964411.3.fna -queryname NZ_DS9964411.3
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964411.3.fna -queryname NZ_DS9964411.3
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000371.39.fna -queryname NZ_NFIJ010000371.39
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000371.39.fna -queryname NZ_NFIJ010000371.39
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000371.39.fna -queryname NZ_NFIJ010000371.39
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000021.40.fna -queryname NZ_NFIJ010000021.40
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000021.40.fna -queryname NZ_NFIJ010000021.40
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000021.40.fna -queryname NZ_NFIJ010000021.40
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000081.41.fna -queryname NZ_NFIJ010000081.41
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000081.41.fna -queryname NZ_NFIJ010000081.41
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000081.41.fna -queryname NZ_NFIJ010000081.41
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000191.42.fna -queryname NZ_NFIJ010000191.42
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000191.42.fna -queryname NZ_NFIJ010000191.42
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000191.42.fna -queryname NZ_NFIJ010000191.42
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000361.43.fna -queryname NZ_NFIJ010000361.43
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000361.43.fna -queryname NZ_NFIJ010000361.43
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000361.43.fna -queryname NZ_NFIJ010000361.43
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000151.44.fna -queryname NZ_NFIJ010000151.44
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000151.44.fna -queryname NZ_NFIJ010000151.44
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000151.44.fna -queryname NZ_NFIJ010000151.44
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000261.45.fna -queryname NZ_NFIJ010000261.45
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000261.45.fna -queryname NZ_NFIJ010000261.45
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000261.45.fna -queryname NZ_NFIJ010000261.45
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000391.46.fna -queryname NZ_NFIJ010000391.46
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000391.46.fna -queryname NZ_NFIJ010000391.46
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000391.46.fna -queryname NZ_NFIJ010000391.46
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000291.47.fna -queryname NZ_NFIJ010000291.47
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000291.47.fna -queryname NZ_NFIJ010000291.47
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000291.47.fna -queryname NZ_NFIJ010000291.47
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000141.48.fna -queryname NZ_NFIJ010000141.48
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000141.48.fna -queryname NZ_NFIJ010000141.48
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000141.48.fna -queryname NZ_NFIJ010000141.48
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000141.48.AOI.fna -queryname NZ_NFIJ010000141.48
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000141.48.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000141.48.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -queryname NZ_NFIJ010000141.48
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -table NZ_NFIJ010000141.48.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964441.4.fna -queryname NZ_DS9964441.4
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964441.4.fna -queryname NZ_DS9964441.4
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964441.4.fna -queryname NZ_DS9964441.4
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000231.49.fna -queryname NZ_NFIJ010000231.49
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000231.49.fna -queryname NZ_NFIJ010000231.49
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000231.49.fna -queryname NZ_NFIJ010000231.49
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000111.50.fna -queryname NZ_NFIJ010000111.50
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000111.50.fna -queryname NZ_NFIJ010000111.50
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000111.50.fna -queryname NZ_NFIJ010000111.50
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000121.51.fna -queryname NZ_NFIJ010000121.51
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000121.51.fna -queryname NZ_NFIJ010000121.51
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000121.51.fna -queryname NZ_NFIJ010000121.51
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000071.52.fna -queryname NZ_NFIJ010000071.52
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000071.52.fna -queryname NZ_NFIJ010000071.52
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000071.52.fna -queryname NZ_NFIJ010000071.52
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000241.53.fna -queryname NZ_NFIJ010000241.53
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000241.53.fna -queryname NZ_NFIJ010000241.53
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000241.53.fna -queryname NZ_NFIJ010000241.53
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000221.54.fna -queryname NZ_NFIJ010000221.54
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000221.54.fna -queryname NZ_NFIJ010000221.54
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000221.54.fna -queryname NZ_NFIJ010000221.54
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000031.55.fna -queryname NZ_NFIJ010000031.55
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000031.55.fna -queryname NZ_NFIJ010000031.55
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000031.55.fna -queryname NZ_NFIJ010000031.55
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000331.56.fna -queryname NZ_NFIJ010000331.56
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000331.56.fna -queryname NZ_NFIJ010000331.56
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000331.56.fna -queryname NZ_NFIJ010000331.56
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000271.57.fna -queryname NZ_NFIJ010000271.57
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000271.57.fna -queryname NZ_NFIJ010000271.57
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000271.57.fna -queryname NZ_NFIJ010000271.57
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000281.58.fna -queryname NZ_NFIJ010000281.58
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000281.58.fna -queryname NZ_NFIJ010000281.58
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000281.58.fna -queryname NZ_NFIJ010000281.58
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964561.5.fna -queryname NZ_DS9964561.5
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964561.5.fna -queryname NZ_DS9964561.5
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964561.5.fna -queryname NZ_DS9964561.5
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964561.5.AOI.fna -queryname NZ_DS9964561.5
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964561.5.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964561.5.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -queryname NZ_DS9964561.5
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -table NZ_DS9964561.5.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000041.59.fna -queryname NZ_NFIJ010000041.59
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000041.59.fna -queryname NZ_NFIJ010000041.59
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000041.59.fna -queryname NZ_NFIJ010000041.59
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000211.60.fna -queryname NZ_NFIJ010000211.60
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000211.60.fna -queryname NZ_NFIJ010000211.60
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000211.60.fna -queryname NZ_NFIJ010000211.60
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000251.61.fna -queryname NZ_NFIJ010000251.61
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000251.61.fna -queryname NZ_NFIJ010000251.61
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_NFIJ010000251.61.fna -queryname NZ_NFIJ010000251.61
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_UYXL010000021.62.fna -queryname NZ_UYXL010000021.62
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_UYXL010000021.62.fna -queryname NZ_UYXL010000021.62
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_UYXL010000021.62.fna -queryname NZ_UYXL010000021.62
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_UYXL010000011.63.fna -queryname NZ_UYXL010000011.63
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_UYXL010000011.63.fna -queryname NZ_UYXL010000011.63
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_UYXL010000011.63.fna -queryname NZ_UYXL010000011.63
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_UYXL010000011.63.AOI.fna -queryname NZ_UYXL010000011.63
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_UYXL010000011.63.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_UYXL010000011.63.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -queryname NZ_UYXL010000011.63
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -table NZ_UYXL010000011.63.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964461.6.fna -queryname NZ_DS9964461.6
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964461.6.fna -queryname NZ_DS9964461.6
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964461.6.fna -queryname NZ_DS9964461.6
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964401.7.fna -queryname NZ_DS9964401.7
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964401.7.fna -queryname NZ_DS9964401.7
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964401.7.fna -queryname NZ_DS9964401.7
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964511.8.fna -queryname NZ_DS9964511.8
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964511.8.fna -queryname NZ_DS9964511.8
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result/NZ_DS9964511.8.fna -queryname NZ_DS9964511.8
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Tannerellaceae//Parabacteroides_johnsonii.result