/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000211.0.fna -queryname NZ_ADEF010000211.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000211.0.fna -queryname NZ_ADEF010000211.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000211.0.fna -queryname NZ_ADEF010000211.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000471.9.fna -queryname NZ_ADEF010000471.9
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000471.9.fna -queryname NZ_ADEF010000471.9
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000471.9.fna -queryname NZ_ADEF010000471.9
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000121.99.fna -queryname NZ_AUMG010000121.99
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000121.99.fna -queryname NZ_AUMG010000121.99
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000121.99.fna -queryname NZ_AUMG010000121.99
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000961.100.fna -queryname NZ_AUMG010000961.100
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000961.100.fna -queryname NZ_AUMG010000961.100
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000961.100.fna -queryname NZ_AUMG010000961.100
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000321.101.fna -queryname NZ_AUMG010000321.101
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000321.101.fna -queryname NZ_AUMG010000321.101
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000321.101.fna -queryname NZ_AUMG010000321.101
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000111.102.fna -queryname NZ_AUMG010000111.102
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000111.102.fna -queryname NZ_AUMG010000111.102
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000111.102.fna -queryname NZ_AUMG010000111.102
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000901.103.fna -queryname NZ_AUMG010000901.103
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000901.103.fna -queryname NZ_AUMG010000901.103
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000901.103.fna -queryname NZ_AUMG010000901.103
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000771.104.fna -queryname NZ_AUMG010000771.104
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000771.104.fna -queryname NZ_AUMG010000771.104
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000771.104.fna -queryname NZ_AUMG010000771.104
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000421.105.fna -queryname NZ_AUMG010000421.105
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000421.105.fna -queryname NZ_AUMG010000421.105
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000421.105.fna -queryname NZ_AUMG010000421.105
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000411.106.fna -queryname NZ_AUMG010000411.106
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000411.106.fna -queryname NZ_AUMG010000411.106
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000411.106.fna -queryname NZ_AUMG010000411.106
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000021.107.fna -queryname NZ_AUMG010000021.107
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000021.107.fna -queryname NZ_AUMG010000021.107
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000021.107.fna -queryname NZ_AUMG010000021.107
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000381.108.fna -queryname NZ_AUMG010000381.108
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000381.108.fna -queryname NZ_AUMG010000381.108
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000381.108.fna -queryname NZ_AUMG010000381.108
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000381.108.AOI.fna -queryname NZ_AUMG010000381.108
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000381.108.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000381.108.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -queryname NZ_AUMG010000381.108
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -table NZ_AUMG010000381.108.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000181.10.fna -queryname NZ_ADEF010000181.10
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000181.10.fna -queryname NZ_ADEF010000181.10
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000181.10.fna -queryname NZ_ADEF010000181.10
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000531.109.fna -queryname NZ_AUMG010000531.109
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000531.109.fna -queryname NZ_AUMG010000531.109
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000531.109.fna -queryname NZ_AUMG010000531.109
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000401.110.fna -queryname NZ_AUMG010000401.110
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000401.110.fna -queryname NZ_AUMG010000401.110
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000401.110.fna -queryname NZ_AUMG010000401.110
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000171.111.fna -queryname NZ_AUMG010000171.111
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000171.111.fna -queryname NZ_AUMG010000171.111
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000171.111.fna -queryname NZ_AUMG010000171.111
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000171.111.AOI.fna -queryname NZ_AUMG010000171.111
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000171.111.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000171.111.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -queryname NZ_AUMG010000171.111
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -table NZ_AUMG010000171.111.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000051.112.fna -queryname NZ_AUMG010000051.112
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000051.112.fna -queryname NZ_AUMG010000051.112
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000051.112.fna -queryname NZ_AUMG010000051.112
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000701.113.fna -queryname NZ_AUMG010000701.113
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000701.113.fna -queryname NZ_AUMG010000701.113
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000701.113.fna -queryname NZ_AUMG010000701.113
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000061.114.fna -queryname NZ_AUMG010000061.114
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000061.114.fna -queryname NZ_AUMG010000061.114
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000061.114.fna -queryname NZ_AUMG010000061.114
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000811.115.fna -queryname NZ_AUMG010000811.115
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000811.115.fna -queryname NZ_AUMG010000811.115
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000811.115.fna -queryname NZ_AUMG010000811.115
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000221.116.fna -queryname NZ_AUMG010000221.116
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000221.116.fna -queryname NZ_AUMG010000221.116
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000221.116.fna -queryname NZ_AUMG010000221.116
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000221.116.AOI.fna -queryname NZ_AUMG010000221.116
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000221.116.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000221.116.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -queryname NZ_AUMG010000221.116
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -table NZ_AUMG010000221.116.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000671.117.fna -queryname NZ_AUMG010000671.117
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000671.117.fna -queryname NZ_AUMG010000671.117
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000671.117.fna -queryname NZ_AUMG010000671.117
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000071.118.fna -queryname NZ_AUMG010000071.118
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000071.118.fna -queryname NZ_AUMG010000071.118
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000071.118.fna -queryname NZ_AUMG010000071.118
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000141.11.fna -queryname NZ_ADEF010000141.11
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000141.11.fna -queryname NZ_ADEF010000141.11
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000141.11.fna -queryname NZ_ADEF010000141.11
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000041.119.fna -queryname NZ_AUMG010000041.119
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000041.119.fna -queryname NZ_AUMG010000041.119
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000041.119.fna -queryname NZ_AUMG010000041.119
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000151.120.fna -queryname NZ_AUMG010000151.120
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000151.120.fna -queryname NZ_AUMG010000151.120
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000151.120.fna -queryname NZ_AUMG010000151.120
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000731.121.fna -queryname NZ_AUMG010000731.121
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000731.121.fna -queryname NZ_AUMG010000731.121
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000731.121.fna -queryname NZ_AUMG010000731.121
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000561.122.fna -queryname NZ_AUMG010000561.122
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000561.122.fna -queryname NZ_AUMG010000561.122
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000561.122.fna -queryname NZ_AUMG010000561.122
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000391.123.fna -queryname NZ_AUMG010000391.123
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000391.123.fna -queryname NZ_AUMG010000391.123
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000391.123.fna -queryname NZ_AUMG010000391.123
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000691.124.fna -queryname NZ_AUMG010000691.124
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000691.124.fna -queryname NZ_AUMG010000691.124
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000691.124.fna -queryname NZ_AUMG010000691.124
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000681.125.fna -queryname NZ_AUMG010000681.125
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000681.125.fna -queryname NZ_AUMG010000681.125
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000681.125.fna -queryname NZ_AUMG010000681.125
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000141.126.fna -queryname NZ_AUMG010000141.126
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000141.126.fna -queryname NZ_AUMG010000141.126
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000141.126.fna -queryname NZ_AUMG010000141.126
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000291.127.fna -queryname NZ_AUMG010000291.127
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000291.127.fna -queryname NZ_AUMG010000291.127
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000291.127.fna -queryname NZ_AUMG010000291.127
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000861.128.fna -queryname NZ_AUMG010000861.128
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000861.128.fna -queryname NZ_AUMG010000861.128
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000861.128.fna -queryname NZ_AUMG010000861.128
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000361.12.fna -queryname NZ_ADEF010000361.12
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000361.12.fna -queryname NZ_ADEF010000361.12
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000361.12.fna -queryname NZ_ADEF010000361.12
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000261.129.fna -queryname NZ_AUMG010000261.129
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000261.129.fna -queryname NZ_AUMG010000261.129
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000261.129.fna -queryname NZ_AUMG010000261.129
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000261.129.AOI.fna -queryname NZ_AUMG010000261.129
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000261.129.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000261.129.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -queryname NZ_AUMG010000261.129
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -table NZ_AUMG010000261.129.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000721.130.fna -queryname NZ_AUMG010000721.130
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000721.130.fna -queryname NZ_AUMG010000721.130
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000721.130.fna -queryname NZ_AUMG010000721.130
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000921.131.fna -queryname NZ_AUMG010000921.131
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000921.131.fna -queryname NZ_AUMG010000921.131
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000921.131.fna -queryname NZ_AUMG010000921.131
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000661.132.fna -queryname NZ_AUMG010000661.132
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000661.132.fna -queryname NZ_AUMG010000661.132
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000661.132.fna -queryname NZ_AUMG010000661.132
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000581.133.fna -queryname NZ_AUMG010000581.133
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000581.133.fna -queryname NZ_AUMG010000581.133
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000581.133.fna -queryname NZ_AUMG010000581.133
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000241.134.fna -queryname NZ_AUMG010000241.134
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000241.134.fna -queryname NZ_AUMG010000241.134
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000241.134.fna -queryname NZ_AUMG010000241.134
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000761.135.fna -queryname NZ_AUMG010000761.135
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000761.135.fna -queryname NZ_AUMG010000761.135
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000761.135.fna -queryname NZ_AUMG010000761.135
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000821.136.fna -queryname NZ_AUMG010000821.136
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000821.136.fna -queryname NZ_AUMG010000821.136
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000821.136.fna -queryname NZ_AUMG010000821.136
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000651.137.fna -queryname NZ_AUMG010000651.137
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000651.137.fna -queryname NZ_AUMG010000651.137
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000651.137.fna -queryname NZ_AUMG010000651.137
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000231.138.fna -queryname NZ_AUMG010000231.138
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000231.138.fna -queryname NZ_AUMG010000231.138
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000231.138.fna -queryname NZ_AUMG010000231.138
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000081.13.fna -queryname NZ_ADEF010000081.13
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000081.13.fna -queryname NZ_ADEF010000081.13
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000081.13.fna -queryname NZ_ADEF010000081.13
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000971.139.fna -queryname NZ_AUMG010000971.139
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000971.139.fna -queryname NZ_AUMG010000971.139
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000971.139.fna -queryname NZ_AUMG010000971.139
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000271.140.fna -queryname NZ_AUMG010000271.140
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000271.140.fna -queryname NZ_AUMG010000271.140
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000271.140.fna -queryname NZ_AUMG010000271.140
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000461.141.fna -queryname NZ_AUMG010000461.141
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000461.141.fna -queryname NZ_AUMG010000461.141
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000461.141.fna -queryname NZ_AUMG010000461.141
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000161.142.fna -queryname NZ_AUMG010000161.142
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000161.142.fna -queryname NZ_AUMG010000161.142
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000161.142.fna -queryname NZ_AUMG010000161.142
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000091.143.fna -queryname NZ_AUMG010000091.143
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000091.143.fna -queryname NZ_AUMG010000091.143
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000091.143.fna -queryname NZ_AUMG010000091.143
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000881.144.fna -queryname NZ_AUMG010000881.144
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000881.144.fna -queryname NZ_AUMG010000881.144
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000881.144.fna -queryname NZ_AUMG010000881.144
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000081.145.fna -queryname NZ_AUMG010000081.145
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000081.145.fna -queryname NZ_AUMG010000081.145
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000081.145.fna -queryname NZ_AUMG010000081.145
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000901.146.fna -queryname NZ_JRPQ010000901.146
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000901.146.fna -queryname NZ_JRPQ010000901.146
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000901.146.fna -queryname NZ_JRPQ010000901.146
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002611.147.fna -queryname NZ_JRPQ010002611.147
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002611.147.fna -queryname NZ_JRPQ010002611.147
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002611.147.fna -queryname NZ_JRPQ010002611.147
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002791.148.fna -queryname NZ_JRPQ010002791.148
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002791.148.fna -queryname NZ_JRPQ010002791.148
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002791.148.fna -queryname NZ_JRPQ010002791.148
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000311.14.fna -queryname NZ_ADEF010000311.14
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000311.14.fna -queryname NZ_ADEF010000311.14
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000311.14.fna -queryname NZ_ADEF010000311.14
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000051.149.fna -queryname NZ_JRPQ010000051.149
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000051.149.fna -queryname NZ_JRPQ010000051.149
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000051.149.fna -queryname NZ_JRPQ010000051.149
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001521.150.fna -queryname NZ_JRPQ010001521.150
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001521.150.fna -queryname NZ_JRPQ010001521.150
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001521.150.fna -queryname NZ_JRPQ010001521.150
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001511.151.fna -queryname NZ_JRPQ010001511.151
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001511.151.fna -queryname NZ_JRPQ010001511.151
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001511.151.fna -queryname NZ_JRPQ010001511.151
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000331.152.fna -queryname NZ_JRPQ010000331.152
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000331.152.fna -queryname NZ_JRPQ010000331.152
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000331.152.fna -queryname NZ_JRPQ010000331.152
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000181.153.fna -queryname NZ_JRPQ010000181.153
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000181.153.fna -queryname NZ_JRPQ010000181.153
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000181.153.fna -queryname NZ_JRPQ010000181.153
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000151.154.fna -queryname NZ_JRPQ010000151.154
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000151.154.fna -queryname NZ_JRPQ010000151.154
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000151.154.fna -queryname NZ_JRPQ010000151.154
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001561.155.fna -queryname NZ_JRPQ010001561.155
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001561.155.fna -queryname NZ_JRPQ010001561.155
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001561.155.fna -queryname NZ_JRPQ010001561.155
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001381.156.fna -queryname NZ_JRPQ010001381.156
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001381.156.fna -queryname NZ_JRPQ010001381.156
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001381.156.fna -queryname NZ_JRPQ010001381.156
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002041.157.fna -queryname NZ_JRPQ010002041.157
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002041.157.fna -queryname NZ_JRPQ010002041.157
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002041.157.fna -queryname NZ_JRPQ010002041.157
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001691.158.fna -queryname NZ_JRPQ010001691.158
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001691.158.fna -queryname NZ_JRPQ010001691.158
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001691.158.fna -queryname NZ_JRPQ010001691.158
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000191.15.fna -queryname NZ_ADEF010000191.15
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000191.15.fna -queryname NZ_ADEF010000191.15
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000191.15.fna -queryname NZ_ADEF010000191.15
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000781.159.fna -queryname NZ_JRPQ010000781.159
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000781.159.fna -queryname NZ_JRPQ010000781.159
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000781.159.fna -queryname NZ_JRPQ010000781.159
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001531.160.fna -queryname NZ_JRPQ010001531.160
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001531.160.fna -queryname NZ_JRPQ010001531.160
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001531.160.fna -queryname NZ_JRPQ010001531.160
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000601.161.fna -queryname NZ_JRPQ010000601.161
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000601.161.fna -queryname NZ_JRPQ010000601.161
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000601.161.fna -queryname NZ_JRPQ010000601.161
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000381.162.fna -queryname NZ_JRPQ010000381.162
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000381.162.fna -queryname NZ_JRPQ010000381.162
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000381.162.fna -queryname NZ_JRPQ010000381.162
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001081.163.fna -queryname NZ_JRPQ010001081.163
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001081.163.fna -queryname NZ_JRPQ010001081.163
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001081.163.fna -queryname NZ_JRPQ010001081.163
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001251.164.fna -queryname NZ_JRPQ010001251.164
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001251.164.fna -queryname NZ_JRPQ010001251.164
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001251.164.fna -queryname NZ_JRPQ010001251.164
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002601.165.fna -queryname NZ_JRPQ010002601.165
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002601.165.fna -queryname NZ_JRPQ010002601.165
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002601.165.fna -queryname NZ_JRPQ010002601.165
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001421.166.fna -queryname NZ_JRPQ010001421.166
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001421.166.fna -queryname NZ_JRPQ010001421.166
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001421.166.fna -queryname NZ_JRPQ010001421.166
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001231.167.fna -queryname NZ_JRPQ010001231.167
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001231.167.fna -queryname NZ_JRPQ010001231.167
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001231.167.fna -queryname NZ_JRPQ010001231.167
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000401.168.fna -queryname NZ_JRPQ010000401.168
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000401.168.fna -queryname NZ_JRPQ010000401.168
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000401.168.fna -queryname NZ_JRPQ010000401.168
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000161.16.fna -queryname NZ_ADEF010000161.16
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000161.16.fna -queryname NZ_ADEF010000161.16
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000161.16.fna -queryname NZ_ADEF010000161.16
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001871.169.fna -queryname NZ_JRPQ010001871.169
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001871.169.fna -queryname NZ_JRPQ010001871.169
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001871.169.fna -queryname NZ_JRPQ010001871.169
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000021.170.fna -queryname NZ_JRPQ010000021.170
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000021.170.fna -queryname NZ_JRPQ010000021.170
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000021.170.fna -queryname NZ_JRPQ010000021.170
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002501.171.fna -queryname NZ_JRPQ010002501.171
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002501.171.fna -queryname NZ_JRPQ010002501.171
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002501.171.fna -queryname NZ_JRPQ010002501.171
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001321.172.fna -queryname NZ_JRPQ010001321.172
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001321.172.fna -queryname NZ_JRPQ010001321.172
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001321.172.fna -queryname NZ_JRPQ010001321.172
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002261.173.fna -queryname NZ_JRPQ010002261.173
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002261.173.fna -queryname NZ_JRPQ010002261.173
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002261.173.fna -queryname NZ_JRPQ010002261.173
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000941.174.fna -queryname NZ_JRPQ010000941.174
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000941.174.fna -queryname NZ_JRPQ010000941.174
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000941.174.fna -queryname NZ_JRPQ010000941.174
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000201.175.fna -queryname NZ_JRPQ010000201.175
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000201.175.fna -queryname NZ_JRPQ010000201.175
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000201.175.fna -queryname NZ_JRPQ010000201.175
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001801.176.fna -queryname NZ_JRPQ010001801.176
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001801.176.fna -queryname NZ_JRPQ010001801.176
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001801.176.fna -queryname NZ_JRPQ010001801.176
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000841.177.fna -queryname NZ_JRPQ010000841.177
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000841.177.fna -queryname NZ_JRPQ010000841.177
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000841.177.fna -queryname NZ_JRPQ010000841.177
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002481.178.fna -queryname NZ_JRPQ010002481.178
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002481.178.fna -queryname NZ_JRPQ010002481.178
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002481.178.fna -queryname NZ_JRPQ010002481.178
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000451.17.fna -queryname NZ_ADEF010000451.17
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000451.17.fna -queryname NZ_ADEF010000451.17
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000451.17.fna -queryname NZ_ADEF010000451.17
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001271.179.fna -queryname NZ_JRPQ010001271.179
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001271.179.fna -queryname NZ_JRPQ010001271.179
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001271.179.fna -queryname NZ_JRPQ010001271.179
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000701.180.fna -queryname NZ_JRPQ010000701.180
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000701.180.fna -queryname NZ_JRPQ010000701.180
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000701.180.fna -queryname NZ_JRPQ010000701.180
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000641.181.fna -queryname NZ_JRPQ010000641.181
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000641.181.fna -queryname NZ_JRPQ010000641.181
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000641.181.fna -queryname NZ_JRPQ010000641.181
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000351.182.fna -queryname NZ_JRPQ010000351.182
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000351.182.fna -queryname NZ_JRPQ010000351.182
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000351.182.fna -queryname NZ_JRPQ010000351.182
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001721.183.fna -queryname NZ_JRPQ010001721.183
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001721.183.fna -queryname NZ_JRPQ010001721.183
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001721.183.fna -queryname NZ_JRPQ010001721.183
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001221.184.fna -queryname NZ_JRPQ010001221.184
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001221.184.fna -queryname NZ_JRPQ010001221.184
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001221.184.fna -queryname NZ_JRPQ010001221.184
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000581.185.fna -queryname NZ_JRPQ010000581.185
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000581.185.fna -queryname NZ_JRPQ010000581.185
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000581.185.fna -queryname NZ_JRPQ010000581.185
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002211.186.fna -queryname NZ_JRPQ010002211.186
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002211.186.fna -queryname NZ_JRPQ010002211.186
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002211.186.fna -queryname NZ_JRPQ010002211.186
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000471.187.fna -queryname NZ_JRPQ010000471.187
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000471.187.fna -queryname NZ_JRPQ010000471.187
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000471.187.fna -queryname NZ_JRPQ010000471.187
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000771.188.fna -queryname NZ_JRPQ010000771.188
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000771.188.fna -queryname NZ_JRPQ010000771.188
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000771.188.fna -queryname NZ_JRPQ010000771.188
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000101.18.fna -queryname NZ_ADEF010000101.18
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000101.18.fna -queryname NZ_ADEF010000101.18
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000101.18.fna -queryname NZ_ADEF010000101.18
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001211.189.fna -queryname NZ_JRPQ010001211.189
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001211.189.fna -queryname NZ_JRPQ010001211.189
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001211.189.fna -queryname NZ_JRPQ010001211.189
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002731.190.fna -queryname NZ_JRPQ010002731.190
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002731.190.fna -queryname NZ_JRPQ010002731.190
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002731.190.fna -queryname NZ_JRPQ010002731.190
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001361.191.fna -queryname NZ_JRPQ010001361.191
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001361.191.fna -queryname NZ_JRPQ010001361.191
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001361.191.fna -queryname NZ_JRPQ010001361.191
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000121.192.fna -queryname NZ_JRPQ010000121.192
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000121.192.fna -queryname NZ_JRPQ010000121.192
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000121.192.fna -queryname NZ_JRPQ010000121.192
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001601.193.fna -queryname NZ_JRPQ010001601.193
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001601.193.fna -queryname NZ_JRPQ010001601.193
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001601.193.fna -queryname NZ_JRPQ010001601.193
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001151.194.fna -queryname NZ_JRPQ010001151.194
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001151.194.fna -queryname NZ_JRPQ010001151.194
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001151.194.fna -queryname NZ_JRPQ010001151.194
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001291.195.fna -queryname NZ_JRPQ010001291.195
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001291.195.fna -queryname NZ_JRPQ010001291.195
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001291.195.fna -queryname NZ_JRPQ010001291.195
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001481.196.fna -queryname NZ_JRPQ010001481.196
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001481.196.fna -queryname NZ_JRPQ010001481.196
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001481.196.fna -queryname NZ_JRPQ010001481.196
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001831.197.fna -queryname NZ_JRPQ010001831.197
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001831.197.fna -queryname NZ_JRPQ010001831.197
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001831.197.fna -queryname NZ_JRPQ010001831.197
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002511.198.fna -queryname NZ_JRPQ010002511.198
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002511.198.fna -queryname NZ_JRPQ010002511.198
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002511.198.fna -queryname NZ_JRPQ010002511.198
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000721.1.fna -queryname NZ_ADEF010000721.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000721.1.fna -queryname NZ_ADEF010000721.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000721.1.fna -queryname NZ_ADEF010000721.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000551.19.fna -queryname NZ_ADEF010000551.19
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000551.19.fna -queryname NZ_ADEF010000551.19
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000551.19.fna -queryname NZ_ADEF010000551.19
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002681.199.fna -queryname NZ_JRPQ010002681.199
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002681.199.fna -queryname NZ_JRPQ010002681.199
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002681.199.fna -queryname NZ_JRPQ010002681.199
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000111.200.fna -queryname NZ_JRPQ010000111.200
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000111.200.fna -queryname NZ_JRPQ010000111.200
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000111.200.fna -queryname NZ_JRPQ010000111.200
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000681.201.fna -queryname NZ_JRPQ010000681.201
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000681.201.fna -queryname NZ_JRPQ010000681.201
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000681.201.fna -queryname NZ_JRPQ010000681.201
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000261.202.fna -queryname NZ_JRPQ010000261.202
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000261.202.fna -queryname NZ_JRPQ010000261.202
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000261.202.fna -queryname NZ_JRPQ010000261.202
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001981.203.fna -queryname NZ_JRPQ010001981.203
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001981.203.fna -queryname NZ_JRPQ010001981.203
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001981.203.fna -queryname NZ_JRPQ010001981.203
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000251.204.fna -queryname NZ_JRPQ010000251.204
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000251.204.fna -queryname NZ_JRPQ010000251.204
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000251.204.fna -queryname NZ_JRPQ010000251.204
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002361.205.fna -queryname NZ_JRPQ010002361.205
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002361.205.fna -queryname NZ_JRPQ010002361.205
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002361.205.fna -queryname NZ_JRPQ010002361.205
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000071.206.fna -queryname NZ_JRPQ010000071.206
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000071.206.fna -queryname NZ_JRPQ010000071.206
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000071.206.fna -queryname NZ_JRPQ010000071.206
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002751.207.fna -queryname NZ_JRPQ010002751.207
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002751.207.fna -queryname NZ_JRPQ010002751.207
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002751.207.fna -queryname NZ_JRPQ010002751.207
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000861.208.fna -queryname NZ_JRPQ010000861.208
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000861.208.fna -queryname NZ_JRPQ010000861.208
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000861.208.fna -queryname NZ_JRPQ010000861.208
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000281.20.fna -queryname NZ_ADEF010000281.20
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000281.20.fna -queryname NZ_ADEF010000281.20
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000281.20.fna -queryname NZ_ADEF010000281.20
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000311.209.fna -queryname NZ_JRPQ010000311.209
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000311.209.fna -queryname NZ_JRPQ010000311.209
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000311.209.fna -queryname NZ_JRPQ010000311.209
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000301.210.fna -queryname NZ_JRPQ010000301.210
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000301.210.fna -queryname NZ_JRPQ010000301.210
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000301.210.fna -queryname NZ_JRPQ010000301.210
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001261.211.fna -queryname NZ_JRPQ010001261.211
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001261.211.fna -queryname NZ_JRPQ010001261.211
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001261.211.fna -queryname NZ_JRPQ010001261.211
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001761.212.fna -queryname NZ_JRPQ010001761.212
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001761.212.fna -queryname NZ_JRPQ010001761.212
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001761.212.fna -queryname NZ_JRPQ010001761.212
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000711.213.fna -queryname NZ_JRPQ010000711.213
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000711.213.fna -queryname NZ_JRPQ010000711.213
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000711.213.fna -queryname NZ_JRPQ010000711.213
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000411.214.fna -queryname NZ_JRPQ010000411.214
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000411.214.fna -queryname NZ_JRPQ010000411.214
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000411.214.fna -queryname NZ_JRPQ010000411.214
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000801.215.fna -queryname NZ_JRPQ010000801.215
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000801.215.fna -queryname NZ_JRPQ010000801.215
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000801.215.fna -queryname NZ_JRPQ010000801.215
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000751.216.fna -queryname NZ_JRPQ010000751.216
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000751.216.fna -queryname NZ_JRPQ010000751.216
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000751.216.fna -queryname NZ_JRPQ010000751.216
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000571.217.fna -queryname NZ_JRPQ010000571.217
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000571.217.fna -queryname NZ_JRPQ010000571.217
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000571.217.fna -queryname NZ_JRPQ010000571.217
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002021.218.fna -queryname NZ_JRPQ010002021.218
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002021.218.fna -queryname NZ_JRPQ010002021.218
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002021.218.fna -queryname NZ_JRPQ010002021.218
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000301.21.fna -queryname NZ_ADEF010000301.21
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000301.21.fna -queryname NZ_ADEF010000301.21
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000301.21.fna -queryname NZ_ADEF010000301.21
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000741.219.fna -queryname NZ_JRPQ010000741.219
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000741.219.fna -queryname NZ_JRPQ010000741.219
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000741.219.fna -queryname NZ_JRPQ010000741.219
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002431.220.fna -queryname NZ_JRPQ010002431.220
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002431.220.fna -queryname NZ_JRPQ010002431.220
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002431.220.fna -queryname NZ_JRPQ010002431.220
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000031.221.fna -queryname NZ_JRPQ010000031.221
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000031.221.fna -queryname NZ_JRPQ010000031.221
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000031.221.fna -queryname NZ_JRPQ010000031.221
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002121.222.fna -queryname NZ_JRPQ010002121.222
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002121.222.fna -queryname NZ_JRPQ010002121.222
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002121.222.fna -queryname NZ_JRPQ010002121.222
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002491.223.fna -queryname NZ_JRPQ010002491.223
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002491.223.fna -queryname NZ_JRPQ010002491.223
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002491.223.fna -queryname NZ_JRPQ010002491.223
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000391.224.fna -queryname NZ_JRPQ010000391.224
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000391.224.fna -queryname NZ_JRPQ010000391.224
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000391.224.fna -queryname NZ_JRPQ010000391.224
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001541.225.fna -queryname NZ_JRPQ010001541.225
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001541.225.fna -queryname NZ_JRPQ010001541.225
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001541.225.fna -queryname NZ_JRPQ010001541.225
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000591.226.fna -queryname NZ_JRPQ010000591.226
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000591.226.fna -queryname NZ_JRPQ010000591.226
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000591.226.fna -queryname NZ_JRPQ010000591.226
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001401.227.fna -queryname NZ_JRPQ010001401.227
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001401.227.fna -queryname NZ_JRPQ010001401.227
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001401.227.fna -queryname NZ_JRPQ010001401.227
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000281.228.fna -queryname NZ_JRPQ010000281.228
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000281.228.fna -queryname NZ_JRPQ010000281.228
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000281.228.fna -queryname NZ_JRPQ010000281.228
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000041.22.fna -queryname NZ_ADEF010000041.22
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000041.22.fna -queryname NZ_ADEF010000041.22
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000041.22.fna -queryname NZ_ADEF010000041.22
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001011.229.fna -queryname NZ_JRPQ010001011.229
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001011.229.fna -queryname NZ_JRPQ010001011.229
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001011.229.fna -queryname NZ_JRPQ010001011.229
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000131.230.fna -queryname NZ_JRPQ010000131.230
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000131.230.fna -queryname NZ_JRPQ010000131.230
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000131.230.fna -queryname NZ_JRPQ010000131.230
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000551.231.fna -queryname NZ_JRPQ010000551.231
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000551.231.fna -queryname NZ_JRPQ010000551.231
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000551.231.fna -queryname NZ_JRPQ010000551.231
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001881.232.fna -queryname NZ_JRPQ010001881.232
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001881.232.fna -queryname NZ_JRPQ010001881.232
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001881.232.fna -queryname NZ_JRPQ010001881.232
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001611.233.fna -queryname NZ_JRPQ010001611.233
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001611.233.fna -queryname NZ_JRPQ010001611.233
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001611.233.fna -queryname NZ_JRPQ010001611.233
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000691.234.fna -queryname NZ_JRPQ010000691.234
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000691.234.fna -queryname NZ_JRPQ010000691.234
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000691.234.fna -queryname NZ_JRPQ010000691.234
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000521.235.fna -queryname NZ_JRPQ010000521.235
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000521.235.fna -queryname NZ_JRPQ010000521.235
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000521.235.fna -queryname NZ_JRPQ010000521.235
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001671.236.fna -queryname NZ_JRPQ010001671.236
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001671.236.fna -queryname NZ_JRPQ010001671.236
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001671.236.fna -queryname NZ_JRPQ010001671.236
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001371.237.fna -queryname NZ_JRPQ010001371.237
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001371.237.fna -queryname NZ_JRPQ010001371.237
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001371.237.fna -queryname NZ_JRPQ010001371.237
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000611.238.fna -queryname NZ_JRPQ010000611.238
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000611.238.fna -queryname NZ_JRPQ010000611.238
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000611.238.fna -queryname NZ_JRPQ010000611.238
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000231.23.fna -queryname NZ_ADEF010000231.23
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000231.23.fna -queryname NZ_ADEF010000231.23
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000231.23.fna -queryname NZ_ADEF010000231.23
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002721.239.fna -queryname NZ_JRPQ010002721.239
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002721.239.fna -queryname NZ_JRPQ010002721.239
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002721.239.fna -queryname NZ_JRPQ010002721.239
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000621.240.fna -queryname NZ_JRPQ010000621.240
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000621.240.fna -queryname NZ_JRPQ010000621.240
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000621.240.fna -queryname NZ_JRPQ010000621.240
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002011.241.fna -queryname NZ_JRPQ010002011.241
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002011.241.fna -queryname NZ_JRPQ010002011.241
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002011.241.fna -queryname NZ_JRPQ010002011.241
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000561.242.fna -queryname NZ_JRPQ010000561.242
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000561.242.fna -queryname NZ_JRPQ010000561.242
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000561.242.fna -queryname NZ_JRPQ010000561.242
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001641.243.fna -queryname NZ_JRPQ010001641.243
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001641.243.fna -queryname NZ_JRPQ010001641.243
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001641.243.fna -queryname NZ_JRPQ010001641.243
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001641.243.AOI.fna -queryname NZ_JRPQ010001641.243
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001641.243.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001641.243.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -queryname NZ_JRPQ010001641.243
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -table NZ_JRPQ010001641.243.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001201.244.fna -queryname NZ_JRPQ010001201.244
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001201.244.fna -queryname NZ_JRPQ010001201.244
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001201.244.fna -queryname NZ_JRPQ010001201.244
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000991.245.fna -queryname NZ_JRPQ010000991.245
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000991.245.fna -queryname NZ_JRPQ010000991.245
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000991.245.fna -queryname NZ_JRPQ010000991.245
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001771.246.fna -queryname NZ_JRPQ010001771.246
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001771.246.fna -queryname NZ_JRPQ010001771.246
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001771.246.fna -queryname NZ_JRPQ010001771.246
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001501.247.fna -queryname NZ_JRPQ010001501.247
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001501.247.fna -queryname NZ_JRPQ010001501.247
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001501.247.fna -queryname NZ_JRPQ010001501.247
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001141.248.fna -queryname NZ_JRPQ010001141.248
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001141.248.fna -queryname NZ_JRPQ010001141.248
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001141.248.fna -queryname NZ_JRPQ010001141.248
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000291.24.fna -queryname NZ_ADEF010000291.24
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000291.24.fna -queryname NZ_ADEF010000291.24
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000291.24.fna -queryname NZ_ADEF010000291.24
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001491.249.fna -queryname NZ_JRPQ010001491.249
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001491.249.fna -queryname NZ_JRPQ010001491.249
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001491.249.fna -queryname NZ_JRPQ010001491.249
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000961.250.fna -queryname NZ_JRPQ010000961.250
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000961.250.fna -queryname NZ_JRPQ010000961.250
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000961.250.fna -queryname NZ_JRPQ010000961.250
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000791.251.fna -queryname NZ_JRPQ010000791.251
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000791.251.fna -queryname NZ_JRPQ010000791.251
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000791.251.fna -queryname NZ_JRPQ010000791.251
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001021.252.fna -queryname NZ_JRPQ010001021.252
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001021.252.fna -queryname NZ_JRPQ010001021.252
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001021.252.fna -queryname NZ_JRPQ010001021.252
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001461.253.fna -queryname NZ_JRPQ010001461.253
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001461.253.fna -queryname NZ_JRPQ010001461.253
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001461.253.fna -queryname NZ_JRPQ010001461.253
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000541.254.fna -queryname NZ_JRPQ010000541.254
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000541.254.fna -queryname NZ_JRPQ010000541.254
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000541.254.fna -queryname NZ_JRPQ010000541.254
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000731.255.fna -queryname NZ_JRPQ010000731.255
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000731.255.fna -queryname NZ_JRPQ010000731.255
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000731.255.fna -queryname NZ_JRPQ010000731.255
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000461.256.fna -queryname NZ_JRPQ010000461.256
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000461.256.fna -queryname NZ_JRPQ010000461.256
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000461.256.fna -queryname NZ_JRPQ010000461.256
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000061.257.fna -queryname NZ_JRPQ010000061.257
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000061.257.fna -queryname NZ_JRPQ010000061.257
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000061.257.fna -queryname NZ_JRPQ010000061.257
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000341.258.fna -queryname NZ_JRPQ010000341.258
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000341.258.fna -queryname NZ_JRPQ010000341.258
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000341.258.fna -queryname NZ_JRPQ010000341.258
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000341.258.AOI.fna -queryname NZ_JRPQ010000341.258
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000341.258.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000341.258.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -queryname NZ_JRPQ010000341.258
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -table NZ_JRPQ010000341.258.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000611.25.fna -queryname NZ_ADEF010000611.25
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000611.25.fna -queryname NZ_ADEF010000611.25
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000611.25.fna -queryname NZ_ADEF010000611.25
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001701.259.fna -queryname NZ_JRPQ010001701.259
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001701.259.fna -queryname NZ_JRPQ010001701.259
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001701.259.fna -queryname NZ_JRPQ010001701.259
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000821.260.fna -queryname NZ_JRPQ010000821.260
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000821.260.fna -queryname NZ_JRPQ010000821.260
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000821.260.fna -queryname NZ_JRPQ010000821.260
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001661.261.fna -queryname NZ_JRPQ010001661.261
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001661.261.fna -queryname NZ_JRPQ010001661.261
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001661.261.fna -queryname NZ_JRPQ010001661.261
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000831.262.fna -queryname NZ_JRPQ010000831.262
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000831.262.fna -queryname NZ_JRPQ010000831.262
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000831.262.fna -queryname NZ_JRPQ010000831.262
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001841.263.fna -queryname NZ_JRPQ010001841.263
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001841.263.fna -queryname NZ_JRPQ010001841.263
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001841.263.fna -queryname NZ_JRPQ010001841.263
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001241.264.fna -queryname NZ_JRPQ010001241.264
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001241.264.fna -queryname NZ_JRPQ010001241.264
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001241.264.fna -queryname NZ_JRPQ010001241.264
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001591.265.fna -queryname NZ_JRPQ010001591.265
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001591.265.fna -queryname NZ_JRPQ010001591.265
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001591.265.fna -queryname NZ_JRPQ010001591.265
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000921.266.fna -queryname NZ_JRPQ010000921.266
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000921.266.fna -queryname NZ_JRPQ010000921.266
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000921.266.fna -queryname NZ_JRPQ010000921.266
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001471.267.fna -queryname NZ_JRPQ010001471.267
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001471.267.fna -queryname NZ_JRPQ010001471.267
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001471.267.fna -queryname NZ_JRPQ010001471.267
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002251.268.fna -queryname NZ_JRPQ010002251.268
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002251.268.fna -queryname NZ_JRPQ010002251.268
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002251.268.fna -queryname NZ_JRPQ010002251.268
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000531.26.fna -queryname NZ_ADEF010000531.26
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000531.26.fna -queryname NZ_ADEF010000531.26
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000531.26.fna -queryname NZ_ADEF010000531.26
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002221.269.fna -queryname NZ_JRPQ010002221.269
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002221.269.fna -queryname NZ_JRPQ010002221.269
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002221.269.fna -queryname NZ_JRPQ010002221.269
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001751.270.fna -queryname NZ_JRPQ010001751.270
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001751.270.fna -queryname NZ_JRPQ010001751.270
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001751.270.fna -queryname NZ_JRPQ010001751.270
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001001.271.fna -queryname NZ_JRPQ010001001.271
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001001.271.fna -queryname NZ_JRPQ010001001.271
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001001.271.fna -queryname NZ_JRPQ010001001.271
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000081.272.fna -queryname NZ_JRPQ010000081.272
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000081.272.fna -queryname NZ_JRPQ010000081.272
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000081.272.fna -queryname NZ_JRPQ010000081.272
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001091.273.fna -queryname NZ_JRPQ010001091.273
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001091.273.fna -queryname NZ_JRPQ010001091.273
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001091.273.fna -queryname NZ_JRPQ010001091.273
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002291.274.fna -queryname NZ_JRPQ010002291.274
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002291.274.fna -queryname NZ_JRPQ010002291.274
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002291.274.fna -queryname NZ_JRPQ010002291.274
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000101.275.fna -queryname NZ_JRPQ010000101.275
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000101.275.fna -queryname NZ_JRPQ010000101.275
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000101.275.fna -queryname NZ_JRPQ010000101.275
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000761.276.fna -queryname NZ_JRPQ010000761.276
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000761.276.fna -queryname NZ_JRPQ010000761.276
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000761.276.fna -queryname NZ_JRPQ010000761.276
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001411.277.fna -queryname NZ_JRPQ010001411.277
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001411.277.fna -queryname NZ_JRPQ010001411.277
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001411.277.fna -queryname NZ_JRPQ010001411.277
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000951.278.fna -queryname NZ_JRPQ010000951.278
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000951.278.fna -queryname NZ_JRPQ010000951.278
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000951.278.fna -queryname NZ_JRPQ010000951.278
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000061.27.fna -queryname NZ_ADEF010000061.27
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000061.27.fna -queryname NZ_ADEF010000061.27
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000061.27.fna -queryname NZ_ADEF010000061.27
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000531.279.fna -queryname NZ_JRPQ010000531.279
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000531.279.fna -queryname NZ_JRPQ010000531.279
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000531.279.fna -queryname NZ_JRPQ010000531.279
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000651.280.fna -queryname NZ_JRPQ010000651.280
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000651.280.fna -queryname NZ_JRPQ010000651.280
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000651.280.fna -queryname NZ_JRPQ010000651.280
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001341.281.fna -queryname NZ_JRPQ010001341.281
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001341.281.fna -queryname NZ_JRPQ010001341.281
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001341.281.fna -queryname NZ_JRPQ010001341.281
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000811.282.fna -queryname NZ_JRPQ010000811.282
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000811.282.fna -queryname NZ_JRPQ010000811.282
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000811.282.fna -queryname NZ_JRPQ010000811.282
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001951.283.fna -queryname NZ_JRPQ010001951.283
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001951.283.fna -queryname NZ_JRPQ010001951.283
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001951.283.fna -queryname NZ_JRPQ010001951.283
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001961.284.fna -queryname NZ_JRPQ010001961.284
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001961.284.fna -queryname NZ_JRPQ010001961.284
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001961.284.fna -queryname NZ_JRPQ010001961.284
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001621.285.fna -queryname NZ_JRPQ010001621.285
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001621.285.fna -queryname NZ_JRPQ010001621.285
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001621.285.fna -queryname NZ_JRPQ010001621.285
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002671.286.fna -queryname NZ_JRPQ010002671.286
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002671.286.fna -queryname NZ_JRPQ010002671.286
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002671.286.fna -queryname NZ_JRPQ010002671.286
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000871.287.fna -queryname NZ_JRPQ010000871.287
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000871.287.fna -queryname NZ_JRPQ010000871.287
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000871.287.fna -queryname NZ_JRPQ010000871.287
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002781.288.fna -queryname NZ_JRPQ010002781.288
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002781.288.fna -queryname NZ_JRPQ010002781.288
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002781.288.fna -queryname NZ_JRPQ010002781.288
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000271.28.fna -queryname NZ_ADEF010000271.28
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000271.28.fna -queryname NZ_ADEF010000271.28
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000271.28.fna -queryname NZ_ADEF010000271.28
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000011.289.fna -queryname NZ_JRPQ010000011.289
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000011.289.fna -queryname NZ_JRPQ010000011.289
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000011.289.fna -queryname NZ_JRPQ010000011.289
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000011.289.AOI.fna -queryname NZ_JRPQ010000011.289
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000011.289.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000011.289.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -queryname NZ_JRPQ010000011.289
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -table NZ_JRPQ010000011.289.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001921.290.fna -queryname NZ_JRPQ010001921.290
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001921.290.fna -queryname NZ_JRPQ010001921.290
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001921.290.fna -queryname NZ_JRPQ010001921.290
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001451.291.fna -queryname NZ_JRPQ010001451.291
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001451.291.fna -queryname NZ_JRPQ010001451.291
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001451.291.fna -queryname NZ_JRPQ010001451.291
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001171.292.fna -queryname NZ_JRPQ010001171.292
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001171.292.fna -queryname NZ_JRPQ010001171.292
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001171.292.fna -queryname NZ_JRPQ010001171.292
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001971.293.fna -queryname NZ_JRPQ010001971.293
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001971.293.fna -queryname NZ_JRPQ010001971.293
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001971.293.fna -queryname NZ_JRPQ010001971.293
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000671.294.fna -queryname NZ_JRPQ010000671.294
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000671.294.fna -queryname NZ_JRPQ010000671.294
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000671.294.fna -queryname NZ_JRPQ010000671.294
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001781.295.fna -queryname NZ_JRPQ010001781.295
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001781.295.fna -queryname NZ_JRPQ010001781.295
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001781.295.fna -queryname NZ_JRPQ010001781.295
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001351.296.fna -queryname NZ_JRPQ010001351.296
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001351.296.fna -queryname NZ_JRPQ010001351.296
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001351.296.fna -queryname NZ_JRPQ010001351.296
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000091.297.fna -queryname NZ_JRPQ010000091.297
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000091.297.fna -queryname NZ_JRPQ010000091.297
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000091.297.fna -queryname NZ_JRPQ010000091.297
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000891.298.fna -queryname NZ_JRPQ010000891.298
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000891.298.fna -queryname NZ_JRPQ010000891.298
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000891.298.fna -queryname NZ_JRPQ010000891.298
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000321.2.fna -queryname NZ_ADEF010000321.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000321.2.fna -queryname NZ_ADEF010000321.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000321.2.fna -queryname NZ_ADEF010000321.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000651.29.fna -queryname NZ_ADEF010000651.29
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000651.29.fna -queryname NZ_ADEF010000651.29
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000651.29.fna -queryname NZ_ADEF010000651.29
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000931.299.fna -queryname NZ_JRPQ010000931.299
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000931.299.fna -queryname NZ_JRPQ010000931.299
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000931.299.fna -queryname NZ_JRPQ010000931.299
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001631.300.fna -queryname NZ_JRPQ010001631.300
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001631.300.fna -queryname NZ_JRPQ010001631.300
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001631.300.fna -queryname NZ_JRPQ010001631.300
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000491.301.fna -queryname NZ_JRPQ010000491.301
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000491.301.fna -queryname NZ_JRPQ010000491.301
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000491.301.fna -queryname NZ_JRPQ010000491.301
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000721.302.fna -queryname NZ_JRPQ010000721.302
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000721.302.fna -queryname NZ_JRPQ010000721.302
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000721.302.fna -queryname NZ_JRPQ010000721.302
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000881.303.fna -queryname NZ_JRPQ010000881.303
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000881.303.fna -queryname NZ_JRPQ010000881.303
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000881.303.fna -queryname NZ_JRPQ010000881.303
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002771.304.fna -queryname NZ_JRPQ010002771.304
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002771.304.fna -queryname NZ_JRPQ010002771.304
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002771.304.fna -queryname NZ_JRPQ010002771.304
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001551.305.fna -queryname NZ_JRPQ010001551.305
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001551.305.fna -queryname NZ_JRPQ010001551.305
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001551.305.fna -queryname NZ_JRPQ010001551.305
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000851.306.fna -queryname NZ_JRPQ010000851.306
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000851.306.fna -queryname NZ_JRPQ010000851.306
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000851.306.fna -queryname NZ_JRPQ010000851.306
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002081.307.fna -queryname NZ_JRPQ010002081.307
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002081.307.fna -queryname NZ_JRPQ010002081.307
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010002081.307.fna -queryname NZ_JRPQ010002081.307
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000661.308.fna -queryname NZ_JRPQ010000661.308
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000661.308.fna -queryname NZ_JRPQ010000661.308
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000661.308.fna -queryname NZ_JRPQ010000661.308
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000421.30.fna -queryname NZ_ADEF010000421.30
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000421.30.fna -queryname NZ_ADEF010000421.30
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000421.30.fna -queryname NZ_ADEF010000421.30
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001911.309.fna -queryname NZ_JRPQ010001911.309
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001911.309.fna -queryname NZ_JRPQ010001911.309
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010001911.309.fna -queryname NZ_JRPQ010001911.309
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000981.310.fna -queryname NZ_JRPQ010000981.310
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000981.310.fna -queryname NZ_JRPQ010000981.310
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_JRPQ010000981.310.fna -queryname NZ_JRPQ010000981.310
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000471.311.fna -queryname NZ_PNGI010000471.311
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000471.311.fna -queryname NZ_PNGI010000471.311
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000471.311.fna -queryname NZ_PNGI010000471.311
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000371.312.fna -queryname NZ_PNGI010000371.312
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000371.312.fna -queryname NZ_PNGI010000371.312
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000371.312.fna -queryname NZ_PNGI010000371.312
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000091.313.fna -queryname NZ_PNGI010000091.313
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000091.313.fna -queryname NZ_PNGI010000091.313
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000091.313.fna -queryname NZ_PNGI010000091.313
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000161.314.fna -queryname NZ_PNGI010000161.314
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000161.314.fna -queryname NZ_PNGI010000161.314
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000161.314.fna -queryname NZ_PNGI010000161.314
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000451.315.fna -queryname NZ_PNGI010000451.315
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000451.315.fna -queryname NZ_PNGI010000451.315
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000451.315.fna -queryname NZ_PNGI010000451.315
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000521.316.fna -queryname NZ_PNGI010000521.316
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000521.316.fna -queryname NZ_PNGI010000521.316
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000521.316.fna -queryname NZ_PNGI010000521.316
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000361.317.fna -queryname NZ_PNGI010000361.317
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000361.317.fna -queryname NZ_PNGI010000361.317
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000361.317.fna -queryname NZ_PNGI010000361.317
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000111.318.fna -queryname NZ_PNGI010000111.318
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000111.318.fna -queryname NZ_PNGI010000111.318
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000111.318.fna -queryname NZ_PNGI010000111.318
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000411.31.fna -queryname NZ_ADEF010000411.31
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000411.31.fna -queryname NZ_ADEF010000411.31
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000411.31.fna -queryname NZ_ADEF010000411.31
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000041.319.fna -queryname NZ_PNGI010000041.319
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000041.319.fna -queryname NZ_PNGI010000041.319
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000041.319.fna -queryname NZ_PNGI010000041.319
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000301.320.fna -queryname NZ_PNGI010000301.320
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000301.320.fna -queryname NZ_PNGI010000301.320
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000301.320.fna -queryname NZ_PNGI010000301.320
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000291.321.fna -queryname NZ_PNGI010000291.321
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000291.321.fna -queryname NZ_PNGI010000291.321
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000291.321.fna -queryname NZ_PNGI010000291.321
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000511.322.fna -queryname NZ_PNGI010000511.322
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000511.322.fna -queryname NZ_PNGI010000511.322
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000511.322.fna -queryname NZ_PNGI010000511.322
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000251.323.fna -queryname NZ_PNGI010000251.323
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000251.323.fna -queryname NZ_PNGI010000251.323
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000251.323.fna -queryname NZ_PNGI010000251.323
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000211.324.fna -queryname NZ_PNGI010000211.324
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000211.324.fna -queryname NZ_PNGI010000211.324
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000211.324.fna -queryname NZ_PNGI010000211.324
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000051.325.fna -queryname NZ_PNGI010000051.325
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000051.325.fna -queryname NZ_PNGI010000051.325
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000051.325.fna -queryname NZ_PNGI010000051.325
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000021.326.fna -queryname NZ_PNGI010000021.326
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000021.326.fna -queryname NZ_PNGI010000021.326
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000021.326.fna -queryname NZ_PNGI010000021.326
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000021.326.AOI.fna -queryname NZ_PNGI010000021.326
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000021.326.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000021.326.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -queryname NZ_PNGI010000021.326
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -table NZ_PNGI010000021.326.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000551.327.fna -queryname NZ_PNGI010000551.327
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000551.327.fna -queryname NZ_PNGI010000551.327
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000551.327.fna -queryname NZ_PNGI010000551.327
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000101.328.fna -queryname NZ_PNGI010000101.328
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000101.328.fna -queryname NZ_PNGI010000101.328
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000101.328.fna -queryname NZ_PNGI010000101.328
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000011.32.fna -queryname NZ_ADEF010000011.32
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000011.32.fna -queryname NZ_ADEF010000011.32
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000011.32.fna -queryname NZ_ADEF010000011.32
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000441.329.fna -queryname NZ_PNGI010000441.329
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000441.329.fna -queryname NZ_PNGI010000441.329
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000441.329.fna -queryname NZ_PNGI010000441.329
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000241.330.fna -queryname NZ_PNGI010000241.330
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000241.330.fna -queryname NZ_PNGI010000241.330
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000241.330.fna -queryname NZ_PNGI010000241.330
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000061.331.fna -queryname NZ_PNGI010000061.331
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000061.331.fna -queryname NZ_PNGI010000061.331
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000061.331.fna -queryname NZ_PNGI010000061.331
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000351.332.fna -queryname NZ_PNGI010000351.332
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000351.332.fna -queryname NZ_PNGI010000351.332
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000351.332.fna -queryname NZ_PNGI010000351.332
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000501.333.fna -queryname NZ_PNGI010000501.333
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000501.333.fna -queryname NZ_PNGI010000501.333
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000501.333.fna -queryname NZ_PNGI010000501.333
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000391.334.fna -queryname NZ_PNGI010000391.334
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000391.334.fna -queryname NZ_PNGI010000391.334
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000391.334.fna -queryname NZ_PNGI010000391.334
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000341.335.fna -queryname NZ_PNGI010000341.335
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000341.335.fna -queryname NZ_PNGI010000341.335
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000341.335.fna -queryname NZ_PNGI010000341.335
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000071.336.fna -queryname NZ_PNGI010000071.336
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000071.336.fna -queryname NZ_PNGI010000071.336
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000071.336.fna -queryname NZ_PNGI010000071.336
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000491.337.fna -queryname NZ_PNGI010000491.337
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000491.337.fna -queryname NZ_PNGI010000491.337
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000491.337.fna -queryname NZ_PNGI010000491.337
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000131.338.fna -queryname NZ_PNGI010000131.338
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000131.338.fna -queryname NZ_PNGI010000131.338
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000131.338.fna -queryname NZ_PNGI010000131.338
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000521.33.fna -queryname NZ_ADEF010000521.33
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000521.33.fna -queryname NZ_ADEF010000521.33
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000521.33.fna -queryname NZ_ADEF010000521.33
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000331.339.fna -queryname NZ_PNGI010000331.339
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000331.339.fna -queryname NZ_PNGI010000331.339
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000331.339.fna -queryname NZ_PNGI010000331.339
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000321.340.fna -queryname NZ_PNGI010000321.340
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000321.340.fna -queryname NZ_PNGI010000321.340
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000321.340.fna -queryname NZ_PNGI010000321.340
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000571.341.fna -queryname NZ_PNGI010000571.341
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000571.341.fna -queryname NZ_PNGI010000571.341
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000571.341.fna -queryname NZ_PNGI010000571.341
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000031.342.fna -queryname NZ_PNGI010000031.342
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000031.342.fna -queryname NZ_PNGI010000031.342
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000031.342.fna -queryname NZ_PNGI010000031.342
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000411.343.fna -queryname NZ_PNGI010000411.343
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000411.343.fna -queryname NZ_PNGI010000411.343
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000411.343.fna -queryname NZ_PNGI010000411.343
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000311.344.fna -queryname NZ_PNGI010000311.344
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000311.344.fna -queryname NZ_PNGI010000311.344
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000311.344.fna -queryname NZ_PNGI010000311.344
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000401.345.fna -queryname NZ_PNGI010000401.345
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000401.345.fna -queryname NZ_PNGI010000401.345
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000401.345.fna -queryname NZ_PNGI010000401.345
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000141.346.fna -queryname NZ_PNGI010000141.346
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000141.346.fna -queryname NZ_PNGI010000141.346
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000141.346.fna -queryname NZ_PNGI010000141.346
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000381.347.fna -queryname NZ_PNGI010000381.347
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000381.347.fna -queryname NZ_PNGI010000381.347
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000381.347.fna -queryname NZ_PNGI010000381.347
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000231.348.fna -queryname NZ_PNGI010000231.348
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000231.348.fna -queryname NZ_PNGI010000231.348
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000231.348.fna -queryname NZ_PNGI010000231.348
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000151.34.fna -queryname NZ_ADEF010000151.34
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000151.34.fna -queryname NZ_ADEF010000151.34
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000151.34.fna -queryname NZ_ADEF010000151.34
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000221.349.fna -queryname NZ_PNGI010000221.349
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000221.349.fna -queryname NZ_PNGI010000221.349
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000221.349.fna -queryname NZ_PNGI010000221.349
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000531.350.fna -queryname NZ_PNGI010000531.350
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000531.350.fna -queryname NZ_PNGI010000531.350
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000531.350.fna -queryname NZ_PNGI010000531.350
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000481.351.fna -queryname NZ_PNGI010000481.351
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000481.351.fna -queryname NZ_PNGI010000481.351
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000481.351.fna -queryname NZ_PNGI010000481.351
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000201.352.fna -queryname NZ_PNGI010000201.352
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000201.352.fna -queryname NZ_PNGI010000201.352
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000201.352.fna -queryname NZ_PNGI010000201.352
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000151.353.fna -queryname NZ_PNGI010000151.353
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000151.353.fna -queryname NZ_PNGI010000151.353
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000151.353.fna -queryname NZ_PNGI010000151.353
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000271.354.fna -queryname NZ_PNGI010000271.354
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000271.354.fna -queryname NZ_PNGI010000271.354
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000271.354.fna -queryname NZ_PNGI010000271.354
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000461.355.fna -queryname NZ_PNGI010000461.355
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000461.355.fna -queryname NZ_PNGI010000461.355
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000461.355.fna -queryname NZ_PNGI010000461.355
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000191.356.fna -queryname NZ_PNGI010000191.356
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000191.356.fna -queryname NZ_PNGI010000191.356
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000191.356.fna -queryname NZ_PNGI010000191.356
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000541.357.fna -queryname NZ_PNGI010000541.357
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000541.357.fna -queryname NZ_PNGI010000541.357
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000541.357.fna -queryname NZ_PNGI010000541.357
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000581.358.fna -queryname NZ_PNGI010000581.358
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000581.358.fna -queryname NZ_PNGI010000581.358
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000581.358.fna -queryname NZ_PNGI010000581.358
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000461.35.fna -queryname NZ_ADEF010000461.35
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000461.35.fna -queryname NZ_ADEF010000461.35
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000461.35.fna -queryname NZ_ADEF010000461.35
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000281.359.fna -queryname NZ_PNGI010000281.359
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000281.359.fna -queryname NZ_PNGI010000281.359
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000281.359.fna -queryname NZ_PNGI010000281.359
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000261.360.fna -queryname NZ_PNGI010000261.360
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000261.360.fna -queryname NZ_PNGI010000261.360
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000261.360.fna -queryname NZ_PNGI010000261.360
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000181.361.fna -queryname NZ_PNGI010000181.361
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000181.361.fna -queryname NZ_PNGI010000181.361
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000181.361.fna -queryname NZ_PNGI010000181.361
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000421.362.fna -queryname NZ_PNGI010000421.362
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000421.362.fna -queryname NZ_PNGI010000421.362
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000421.362.fna -queryname NZ_PNGI010000421.362
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000121.363.fna -queryname NZ_PNGI010000121.363
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000121.363.fna -queryname NZ_PNGI010000121.363
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000121.363.fna -queryname NZ_PNGI010000121.363
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000121.363.AOI.fna -queryname NZ_PNGI010000121.363
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000121.363.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000121.363.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -queryname NZ_PNGI010000121.363
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -table NZ_PNGI010000121.363.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000431.364.fna -queryname NZ_PNGI010000431.364
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000431.364.fna -queryname NZ_PNGI010000431.364
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000431.364.fna -queryname NZ_PNGI010000431.364
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000171.365.fna -queryname NZ_PNGI010000171.365
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000171.365.fna -queryname NZ_PNGI010000171.365
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000171.365.fna -queryname NZ_PNGI010000171.365
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000011.366.fna -queryname NZ_PNGI010000011.366
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000011.366.fna -queryname NZ_PNGI010000011.366
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000011.366.fna -queryname NZ_PNGI010000011.366
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000561.367.fna -queryname NZ_PNGI010000561.367
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000561.367.fna -queryname NZ_PNGI010000561.367
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000561.367.fna -queryname NZ_PNGI010000561.367
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000081.368.fna -queryname NZ_PNGI010000081.368
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000081.368.fna -queryname NZ_PNGI010000081.368
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_PNGI010000081.368.fna -queryname NZ_PNGI010000081.368
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000391.36.fna -queryname NZ_ADEF010000391.36
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000391.36.fna -queryname NZ_ADEF010000391.36
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000391.36.fna -queryname NZ_ADEF010000391.36
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000141.369.fna -queryname NZ_NBAX010000141.369
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000141.369.fna -queryname NZ_NBAX010000141.369
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000141.369.fna -queryname NZ_NBAX010000141.369
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000041.370.fna -queryname NZ_NBAX010000041.370
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000041.370.fna -queryname NZ_NBAX010000041.370
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000041.370.fna -queryname NZ_NBAX010000041.370
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000011.371.fna -queryname NZ_NBAX010000011.371
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000011.371.fna -queryname NZ_NBAX010000011.371
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000011.371.fna -queryname NZ_NBAX010000011.371
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000081.372.fna -queryname NZ_NBAX010000081.372
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000081.372.fna -queryname NZ_NBAX010000081.372
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000081.372.fna -queryname NZ_NBAX010000081.372
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000101.373.fna -queryname NZ_NBAX010000101.373
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000101.373.fna -queryname NZ_NBAX010000101.373
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000101.373.fna -queryname NZ_NBAX010000101.373
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000131.374.fna -queryname NZ_NBAX010000131.374
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000131.374.fna -queryname NZ_NBAX010000131.374
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000131.374.fna -queryname NZ_NBAX010000131.374
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000051.375.fna -queryname NZ_NBAX010000051.375
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000051.375.fna -queryname NZ_NBAX010000051.375
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000051.375.fna -queryname NZ_NBAX010000051.375
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000121.376.fna -queryname NZ_NBAX010000121.376
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000121.376.fna -queryname NZ_NBAX010000121.376
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000121.376.fna -queryname NZ_NBAX010000121.376
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000111.377.fna -queryname NZ_NBAX010000111.377
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000111.377.fna -queryname NZ_NBAX010000111.377
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000111.377.fna -queryname NZ_NBAX010000111.377
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000031.378.fna -queryname NZ_NBAX010000031.378
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000031.378.fna -queryname NZ_NBAX010000031.378
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000031.378.fna -queryname NZ_NBAX010000031.378
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000241.37.fna -queryname NZ_ADEF010000241.37
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000241.37.fna -queryname NZ_ADEF010000241.37
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000241.37.fna -queryname NZ_ADEF010000241.37
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000021.379.fna -queryname NZ_NBAX010000021.379
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000021.379.fna -queryname NZ_NBAX010000021.379
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000021.379.fna -queryname NZ_NBAX010000021.379
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000151.380.fna -queryname NZ_NBAX010000151.380
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000151.380.fna -queryname NZ_NBAX010000151.380
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000151.380.fna -queryname NZ_NBAX010000151.380
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000061.381.fna -queryname NZ_NBAX010000061.381
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000061.381.fna -queryname NZ_NBAX010000061.381
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000061.381.fna -queryname NZ_NBAX010000061.381
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000061.381.AOI.fna -queryname NZ_NBAX010000061.381
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000061.381.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000061.381.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -queryname NZ_NBAX010000061.381
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -table NZ_NBAX010000061.381.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000071.382.fna -queryname NZ_NBAX010000071.382
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000071.382.fna -queryname NZ_NBAX010000071.382
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000071.382.fna -queryname NZ_NBAX010000071.382
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000091.383.fna -queryname NZ_NBAX010000091.383
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000091.383.fna -queryname NZ_NBAX010000091.383
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_NBAX010000091.383.fna -queryname NZ_NBAX010000091.383
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000441.38.fna -queryname NZ_ADEF010000441.38
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000441.38.fna -queryname NZ_ADEF010000441.38
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000441.38.fna -queryname NZ_ADEF010000441.38
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000071.3.fna -queryname NZ_ADEF010000071.3
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000071.3.fna -queryname NZ_ADEF010000071.3
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000071.3.fna -queryname NZ_ADEF010000071.3
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000051.39.fna -queryname NZ_ADEF010000051.39
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000051.39.fna -queryname NZ_ADEF010000051.39
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000051.39.fna -queryname NZ_ADEF010000051.39
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000111.40.fna -queryname NZ_ADEF010000111.40
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000111.40.fna -queryname NZ_ADEF010000111.40
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000111.40.fna -queryname NZ_ADEF010000111.40
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000481.41.fna -queryname NZ_ADEF010000481.41
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000481.41.fna -queryname NZ_ADEF010000481.41
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000481.41.fna -queryname NZ_ADEF010000481.41
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000481.41.AOI.fna -queryname NZ_ADEF010000481.41
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000481.41.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000481.41.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -queryname NZ_ADEF010000481.41
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -table NZ_ADEF010000481.41.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000571.42.fna -queryname NZ_ADEF010000571.42
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000571.42.fna -queryname NZ_ADEF010000571.42
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000571.42.fna -queryname NZ_ADEF010000571.42
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000431.43.fna -queryname NZ_ADEF010000431.43
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000431.43.fna -queryname NZ_ADEF010000431.43
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000431.43.fna -queryname NZ_ADEF010000431.43
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000581.44.fna -queryname NZ_ADEF010000581.44
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000581.44.fna -queryname NZ_ADEF010000581.44
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000581.44.fna -queryname NZ_ADEF010000581.44
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000591.45.fna -queryname NZ_ADEF010000591.45
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000591.45.fna -queryname NZ_ADEF010000591.45
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000591.45.fna -queryname NZ_ADEF010000591.45
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000511.46.fna -queryname NZ_ADEF010000511.46
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000511.46.fna -queryname NZ_ADEF010000511.46
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000511.46.fna -queryname NZ_ADEF010000511.46
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000661.47.fna -queryname NZ_ADEF010000661.47
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000661.47.fna -queryname NZ_ADEF010000661.47
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000661.47.fna -queryname NZ_ADEF010000661.47
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000131.48.fna -queryname NZ_ADEF010000131.48
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000131.48.fna -queryname NZ_ADEF010000131.48
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000131.48.fna -queryname NZ_ADEF010000131.48
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000691.4.fna -queryname NZ_ADEF010000691.4
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000691.4.fna -queryname NZ_ADEF010000691.4
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000691.4.fna -queryname NZ_ADEF010000691.4
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000491.49.fna -queryname NZ_ADEF010000491.49
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000491.49.fna -queryname NZ_ADEF010000491.49
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000491.49.fna -queryname NZ_ADEF010000491.49
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000341.50.fna -queryname NZ_ADEF010000341.50
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000341.50.fna -queryname NZ_ADEF010000341.50
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000341.50.fna -queryname NZ_ADEF010000341.50
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000831.51.fna -queryname NZ_AUMG010000831.51
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000831.51.fna -queryname NZ_AUMG010000831.51
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000831.51.fna -queryname NZ_AUMG010000831.51
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000011.52.fna -queryname NZ_AUMG010000011.52
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000011.52.fna -queryname NZ_AUMG010000011.52
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000011.52.fna -queryname NZ_AUMG010000011.52
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000201.53.fna -queryname NZ_AUMG010000201.53
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000201.53.fna -queryname NZ_AUMG010000201.53
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000201.53.fna -queryname NZ_AUMG010000201.53
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000541.54.fna -queryname NZ_AUMG010000541.54
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000541.54.fna -queryname NZ_AUMG010000541.54
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000541.54.fna -queryname NZ_AUMG010000541.54
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000931.55.fna -queryname NZ_AUMG010000931.55
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000931.55.fna -queryname NZ_AUMG010000931.55
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000931.55.fna -queryname NZ_AUMG010000931.55
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000841.56.fna -queryname NZ_AUMG010000841.56
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000841.56.fna -queryname NZ_AUMG010000841.56
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000841.56.fna -queryname NZ_AUMG010000841.56
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000951.57.fna -queryname NZ_AUMG010000951.57
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000951.57.fna -queryname NZ_AUMG010000951.57
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000951.57.fna -queryname NZ_AUMG010000951.57
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000741.58.fna -queryname NZ_AUMG010000741.58
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000741.58.fna -queryname NZ_AUMG010000741.58
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000741.58.fna -queryname NZ_AUMG010000741.58
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000381.5.fna -queryname NZ_ADEF010000381.5
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000381.5.fna -queryname NZ_ADEF010000381.5
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000381.5.fna -queryname NZ_ADEF010000381.5
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000311.59.fna -queryname NZ_AUMG010000311.59
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000311.59.fna -queryname NZ_AUMG010000311.59
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000311.59.fna -queryname NZ_AUMG010000311.59
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000611.60.fna -queryname NZ_AUMG010000611.60
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000611.60.fna -queryname NZ_AUMG010000611.60
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000611.60.fna -queryname NZ_AUMG010000611.60
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000751.61.fna -queryname NZ_AUMG010000751.61
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000751.61.fna -queryname NZ_AUMG010000751.61
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000751.61.fna -queryname NZ_AUMG010000751.61
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000521.62.fna -queryname NZ_AUMG010000521.62
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000521.62.fna -queryname NZ_AUMG010000521.62
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000521.62.fna -queryname NZ_AUMG010000521.62
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000591.63.fna -queryname NZ_AUMG010000591.63
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000591.63.fna -queryname NZ_AUMG010000591.63
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000591.63.fna -queryname NZ_AUMG010000591.63
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000431.64.fna -queryname NZ_AUMG010000431.64
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000431.64.fna -queryname NZ_AUMG010000431.64
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000431.64.fna -queryname NZ_AUMG010000431.64
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000331.65.fna -queryname NZ_AUMG010000331.65
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000331.65.fna -queryname NZ_AUMG010000331.65
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000331.65.fna -queryname NZ_AUMG010000331.65
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000631.66.fna -queryname NZ_AUMG010000631.66
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000631.66.fna -queryname NZ_AUMG010000631.66
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000631.66.fna -queryname NZ_AUMG010000631.66
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000871.67.fna -queryname NZ_AUMG010000871.67
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000871.67.fna -queryname NZ_AUMG010000871.67
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000871.67.fna -queryname NZ_AUMG010000871.67
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000471.68.fna -queryname NZ_AUMG010000471.68
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000471.68.fna -queryname NZ_AUMG010000471.68
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000471.68.fna -queryname NZ_AUMG010000471.68
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000331.6.fna -queryname NZ_ADEF010000331.6
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000331.6.fna -queryname NZ_ADEF010000331.6
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000331.6.fna -queryname NZ_ADEF010000331.6
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000351.69.fna -queryname NZ_AUMG010000351.69
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000351.69.fna -queryname NZ_AUMG010000351.69
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000351.69.fna -queryname NZ_AUMG010000351.69
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000941.70.fna -queryname NZ_AUMG010000941.70
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000941.70.fna -queryname NZ_AUMG010000941.70
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000941.70.fna -queryname NZ_AUMG010000941.70
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000211.71.fna -queryname NZ_AUMG010000211.71
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000211.71.fna -queryname NZ_AUMG010000211.71
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000211.71.fna -queryname NZ_AUMG010000211.71
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000211.71.AOI.fna -queryname NZ_AUMG010000211.71
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000211.71.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000211.71.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -queryname NZ_AUMG010000211.71
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -table NZ_AUMG010000211.71.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000571.72.fna -queryname NZ_AUMG010000571.72
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000571.72.fna -queryname NZ_AUMG010000571.72
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000571.72.fna -queryname NZ_AUMG010000571.72
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000451.73.fna -queryname NZ_AUMG010000451.73
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000451.73.fna -queryname NZ_AUMG010000451.73
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000451.73.fna -queryname NZ_AUMG010000451.73
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000891.74.fna -queryname NZ_AUMG010000891.74
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000891.74.fna -queryname NZ_AUMG010000891.74
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000891.74.fna -queryname NZ_AUMG010000891.74
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000641.75.fna -queryname NZ_AUMG010000641.75
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000641.75.fna -queryname NZ_AUMG010000641.75
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000641.75.fna -queryname NZ_AUMG010000641.75
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000491.76.fna -queryname NZ_AUMG010000491.76
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000491.76.fna -queryname NZ_AUMG010000491.76
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000491.76.fna -queryname NZ_AUMG010000491.76
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_KE3871671.77.fna -queryname NZ_KE3871671.77
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_KE3871671.77.fna -queryname NZ_KE3871671.77
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_KE3871671.77.fna -queryname NZ_KE3871671.77
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000181.78.fna -queryname NZ_AUMG010000181.78
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000181.78.fna -queryname NZ_AUMG010000181.78
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000181.78.fna -queryname NZ_AUMG010000181.78
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000561.7.fna -queryname NZ_ADEF010000561.7
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000561.7.fna -queryname NZ_ADEF010000561.7
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000561.7.fna -queryname NZ_ADEF010000561.7
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000851.79.fna -queryname NZ_AUMG010000851.79
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000851.79.fna -queryname NZ_AUMG010000851.79
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000851.79.fna -queryname NZ_AUMG010000851.79
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000281.80.fna -queryname NZ_AUMG010000281.80
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000281.80.fna -queryname NZ_AUMG010000281.80
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000281.80.fna -queryname NZ_AUMG010000281.80
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000711.81.fna -queryname NZ_AUMG010000711.81
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000711.81.fna -queryname NZ_AUMG010000711.81
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000711.81.fna -queryname NZ_AUMG010000711.81
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000481.82.fna -queryname NZ_AUMG010000481.82
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000481.82.fna -queryname NZ_AUMG010000481.82
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000481.82.fna -queryname NZ_AUMG010000481.82
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000361.83.fna -queryname NZ_AUMG010000361.83
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000361.83.fna -queryname NZ_AUMG010000361.83
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000361.83.fna -queryname NZ_AUMG010000361.83
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000341.84.fna -queryname NZ_AUMG010000341.84
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000341.84.fna -queryname NZ_AUMG010000341.84
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000341.84.fna -queryname NZ_AUMG010000341.84
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000621.85.fna -queryname NZ_AUMG010000621.85
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000621.85.fna -queryname NZ_AUMG010000621.85
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000621.85.fna -queryname NZ_AUMG010000621.85
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000601.86.fna -queryname NZ_AUMG010000601.86
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000601.86.fna -queryname NZ_AUMG010000601.86
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000601.86.fna -queryname NZ_AUMG010000601.86
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000031.87.fna -queryname NZ_AUMG010000031.87
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000031.87.fna -queryname NZ_AUMG010000031.87
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000031.87.fna -queryname NZ_AUMG010000031.87
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000301.88.fna -queryname NZ_AUMG010000301.88
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000301.88.fna -queryname NZ_AUMG010000301.88
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000301.88.fna -queryname NZ_AUMG010000301.88
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000641.8.fna -queryname NZ_ADEF010000641.8
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000641.8.fna -queryname NZ_ADEF010000641.8
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_ADEF010000641.8.fna -queryname NZ_ADEF010000641.8
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000781.89.fna -queryname NZ_AUMG010000781.89
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000781.89.fna -queryname NZ_AUMG010000781.89
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000781.89.fna -queryname NZ_AUMG010000781.89
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_KE3871681.90.fna -queryname NZ_KE3871681.90
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_KE3871681.90.fna -queryname NZ_KE3871681.90
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_KE3871681.90.fna -queryname NZ_KE3871681.90
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000551.91.fna -queryname NZ_AUMG010000551.91
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000551.91.fna -queryname NZ_AUMG010000551.91
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000551.91.fna -queryname NZ_AUMG010000551.91
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000101.92.fna -queryname NZ_AUMG010000101.92
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000101.92.fna -queryname NZ_AUMG010000101.92
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000101.92.fna -queryname NZ_AUMG010000101.92
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000131.93.fna -queryname NZ_AUMG010000131.93
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000131.93.fna -queryname NZ_AUMG010000131.93
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000131.93.fna -queryname NZ_AUMG010000131.93
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000251.94.fna -queryname NZ_AUMG010000251.94
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000251.94.fna -queryname NZ_AUMG010000251.94
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000251.94.fna -queryname NZ_AUMG010000251.94
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000371.95.fna -queryname NZ_AUMG010000371.95
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000371.95.fna -queryname NZ_AUMG010000371.95
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000371.95.fna -queryname NZ_AUMG010000371.95
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000191.96.fna -queryname NZ_AUMG010000191.96
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000191.96.fna -queryname NZ_AUMG010000191.96
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000191.96.fna -queryname NZ_AUMG010000191.96
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000911.97.fna -queryname NZ_AUMG010000911.97
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000911.97.fna -queryname NZ_AUMG010000911.97
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000911.97.fna -queryname NZ_AUMG010000911.97
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000441.98.fna -queryname NZ_AUMG010000441.98
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000441.98.fna -queryname NZ_AUMG010000441.98
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result/NZ_AUMG010000441.98.fna -queryname NZ_AUMG010000441.98
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_timonensis.result