/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_GL9824641.0.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_GL9824641.0.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_GL9824641.0.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_GL9824641.0.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_GL9824641.0.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_GL9824641.0.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_KI6694241.130.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_KI6694241.130.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_KI6694241.130.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_KI6694241.130.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_KI6694241.130.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_KI6694241.130.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_NHRW010000011.149.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_NHRW010000011.149.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_NHRW010000011.149.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_NHRW010000011.149.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_NHRW010000011.149.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_NHRW010000011.149.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_UGTN010000011.153.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_UGTN010000011.153.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_UGTN010000011.153.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_UGTN010000011.153.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_UGTN010000011.153.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_UGTN010000011.153.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_ADGJ010000171.52.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_ADGJ010000171.52.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_ADGJ010000171.52.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_ADGJ010000171.52.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_ADGJ010000171.52.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/NZ_ADGJ010000171.52.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Prevotellaceae/Prevotella_nigrescens.result/logfile.txt
