/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001831.0.fna -queryname NZ_ACLR010001831.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001831.0.fna -queryname NZ_ACLR010001831.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001831.0.fna -queryname NZ_ACLR010001831.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002141.9.fna -queryname NZ_ACLR010002141.9
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002141.9.fna -queryname NZ_ACLR010002141.9
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002141.9.fna -queryname NZ_ACLR010002141.9
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001421.10.fna -queryname NZ_ACLR010001421.10
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001421.10.fna -queryname NZ_ACLR010001421.10
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001421.10.fna -queryname NZ_ACLR010001421.10
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001761.11.fna -queryname NZ_ACLR010001761.11
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001761.11.fna -queryname NZ_ACLR010001761.11
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001761.11.fna -queryname NZ_ACLR010001761.11
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001711.12.fna -queryname NZ_ACLR010001711.12
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001711.12.fna -queryname NZ_ACLR010001711.12
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001711.12.fna -queryname NZ_ACLR010001711.12
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001601.13.fna -queryname NZ_ACLR010001601.13
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001601.13.fna -queryname NZ_ACLR010001601.13
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001601.13.fna -queryname NZ_ACLR010001601.13
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000611.14.fna -queryname NZ_ACLR010000611.14
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000611.14.fna -queryname NZ_ACLR010000611.14
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000611.14.fna -queryname NZ_ACLR010000611.14
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002261.15.fna -queryname NZ_ACLR010002261.15
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002261.15.fna -queryname NZ_ACLR010002261.15
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002261.15.fna -queryname NZ_ACLR010002261.15
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002241.16.fna -queryname NZ_ACLR010002241.16
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002241.16.fna -queryname NZ_ACLR010002241.16
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002241.16.fna -queryname NZ_ACLR010002241.16
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000691.17.fna -queryname NZ_ACLR010000691.17
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000691.17.fna -queryname NZ_ACLR010000691.17
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000691.17.fna -queryname NZ_ACLR010000691.17
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001781.18.fna -queryname NZ_ACLR010001781.18
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001781.18.fna -queryname NZ_ACLR010001781.18
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001781.18.fna -queryname NZ_ACLR010001781.18
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002421.1.fna -queryname NZ_ACLR010002421.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002421.1.fna -queryname NZ_ACLR010002421.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002421.1.fna -queryname NZ_ACLR010002421.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001681.19.fna -queryname NZ_ACLR010001681.19
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001681.19.fna -queryname NZ_ACLR010001681.19
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001681.19.fna -queryname NZ_ACLR010001681.19
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000131.20.fna -queryname NZ_ACLR010000131.20
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000131.20.fna -queryname NZ_ACLR010000131.20
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000131.20.fna -queryname NZ_ACLR010000131.20
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000251.21.fna -queryname NZ_ACLR010000251.21
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000251.21.fna -queryname NZ_ACLR010000251.21
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000251.21.fna -queryname NZ_ACLR010000251.21
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002461.22.fna -queryname NZ_ACLR010002461.22
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002461.22.fna -queryname NZ_ACLR010002461.22
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002461.22.fna -queryname NZ_ACLR010002461.22
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000801.23.fna -queryname NZ_ACLR010000801.23
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000801.23.fna -queryname NZ_ACLR010000801.23
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000801.23.fna -queryname NZ_ACLR010000801.23
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000231.24.fna -queryname NZ_ACLR010000231.24
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000231.24.fna -queryname NZ_ACLR010000231.24
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000231.24.fna -queryname NZ_ACLR010000231.24
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000591.25.fna -queryname NZ_ACLR010000591.25
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000591.25.fna -queryname NZ_ACLR010000591.25
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000591.25.fna -queryname NZ_ACLR010000591.25
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002201.26.fna -queryname NZ_ACLR010002201.26
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002201.26.fna -queryname NZ_ACLR010002201.26
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002201.26.fna -queryname NZ_ACLR010002201.26
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002321.27.fna -queryname NZ_ACLR010002321.27
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002321.27.fna -queryname NZ_ACLR010002321.27
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002321.27.fna -queryname NZ_ACLR010002321.27
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000121.28.fna -queryname NZ_ACLR010000121.28
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000121.28.fna -queryname NZ_ACLR010000121.28
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000121.28.fna -queryname NZ_ACLR010000121.28
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000491.2.fna -queryname NZ_ACLR010000491.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000491.2.fna -queryname NZ_ACLR010000491.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000491.2.fna -queryname NZ_ACLR010000491.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000321.29.fna -queryname NZ_ACLR010000321.29
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000321.29.fna -queryname NZ_ACLR010000321.29
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000321.29.fna -queryname NZ_ACLR010000321.29
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002031.30.fna -queryname NZ_ACLR010002031.30
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002031.30.fna -queryname NZ_ACLR010002031.30
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002031.30.fna -queryname NZ_ACLR010002031.30
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001251.31.fna -queryname NZ_ACLR010001251.31
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001251.31.fna -queryname NZ_ACLR010001251.31
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001251.31.fna -queryname NZ_ACLR010001251.31
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001741.32.fna -queryname NZ_ACLR010001741.32
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001741.32.fna -queryname NZ_ACLR010001741.32
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001741.32.fna -queryname NZ_ACLR010001741.32
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001921.33.fna -queryname NZ_ACLR010001921.33
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001921.33.fna -queryname NZ_ACLR010001921.33
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001921.33.fna -queryname NZ_ACLR010001921.33
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002211.34.fna -queryname NZ_ACLR010002211.34
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002211.34.fna -queryname NZ_ACLR010002211.34
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002211.34.fna -queryname NZ_ACLR010002211.34
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001821.35.fna -queryname NZ_ACLR010001821.35
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001821.35.fna -queryname NZ_ACLR010001821.35
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001821.35.fna -queryname NZ_ACLR010001821.35
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000111.36.fna -queryname NZ_ACLR010000111.36
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000111.36.fna -queryname NZ_ACLR010000111.36
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000111.36.fna -queryname NZ_ACLR010000111.36
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000091.37.fna -queryname NZ_ACLR010000091.37
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000091.37.fna -queryname NZ_ACLR010000091.37
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000091.37.fna -queryname NZ_ACLR010000091.37
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001701.38.fna -queryname NZ_ACLR010001701.38
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001701.38.fna -queryname NZ_ACLR010001701.38
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001701.38.fna -queryname NZ_ACLR010001701.38
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001801.3.fna -queryname NZ_ACLR010001801.3
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001801.3.fna -queryname NZ_ACLR010001801.3
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001801.3.fna -queryname NZ_ACLR010001801.3
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000471.39.fna -queryname NZ_ACLR010000471.39
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000471.39.fna -queryname NZ_ACLR010000471.39
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000471.39.fna -queryname NZ_ACLR010000471.39
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000881.40.fna -queryname NZ_ACLR010000881.40
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000881.40.fna -queryname NZ_ACLR010000881.40
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000881.40.fna -queryname NZ_ACLR010000881.40
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001161.41.fna -queryname NZ_ACLR010001161.41
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001161.41.fna -queryname NZ_ACLR010001161.41
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001161.41.fna -queryname NZ_ACLR010001161.41
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001241.42.fna -queryname NZ_ACLR010001241.42
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001241.42.fna -queryname NZ_ACLR010001241.42
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001241.42.fna -queryname NZ_ACLR010001241.42
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000011.43.fna -queryname NZ_ACLR010000011.43
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000011.43.fna -queryname NZ_ACLR010000011.43
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000011.43.fna -queryname NZ_ACLR010000011.43
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000341.44.fna -queryname NZ_ACLR010000341.44
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000341.44.fna -queryname NZ_ACLR010000341.44
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000341.44.fna -queryname NZ_ACLR010000341.44
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001231.45.fna -queryname NZ_ACLR010001231.45
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001231.45.fna -queryname NZ_ACLR010001231.45
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001231.45.fna -queryname NZ_ACLR010001231.45
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001181.46.fna -queryname NZ_ACLR010001181.46
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001181.46.fna -queryname NZ_ACLR010001181.46
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001181.46.fna -queryname NZ_ACLR010001181.46
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001791.47.fna -queryname NZ_ACLR010001791.47
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001791.47.fna -queryname NZ_ACLR010001791.47
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001791.47.fna -queryname NZ_ACLR010001791.47
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002081.48.fna -queryname NZ_ACLR010002081.48
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002081.48.fna -queryname NZ_ACLR010002081.48
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010002081.48.fna -queryname NZ_ACLR010002081.48
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001201.4.fna -queryname NZ_ACLR010001201.4
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001201.4.fna -queryname NZ_ACLR010001201.4
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001201.4.fna -queryname NZ_ACLR010001201.4
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000231.49.fna -queryname NZ_AXVC010000231.49
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000231.49.fna -queryname NZ_AXVC010000231.49
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000231.49.fna -queryname NZ_AXVC010000231.49
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_KI5353081.50.fna -queryname NZ_KI5353081.50
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_KI5353081.50.fna -queryname NZ_KI5353081.50
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_KI5353081.50.fna -queryname NZ_KI5353081.50
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000291.51.fna -queryname NZ_AXVC010000291.51
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000291.51.fna -queryname NZ_AXVC010000291.51
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000291.51.fna -queryname NZ_AXVC010000291.51
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_KI5353111.52.fna -queryname NZ_KI5353111.52
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_KI5353111.52.fna -queryname NZ_KI5353111.52
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_KI5353111.52.fna -queryname NZ_KI5353111.52
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_KI5353061.53.fna -queryname NZ_KI5353061.53
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_KI5353061.53.fna -queryname NZ_KI5353061.53
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_KI5353061.53.fna -queryname NZ_KI5353061.53
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000391.54.fna -queryname NZ_AXVC010000391.54
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000391.54.fna -queryname NZ_AXVC010000391.54
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000391.54.fna -queryname NZ_AXVC010000391.54
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000321.55.fna -queryname NZ_AXVC010000321.55
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000321.55.fna -queryname NZ_AXVC010000321.55
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000321.55.fna -queryname NZ_AXVC010000321.55
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000301.56.fna -queryname NZ_AXVC010000301.56
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000301.56.fna -queryname NZ_AXVC010000301.56
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000301.56.fna -queryname NZ_AXVC010000301.56
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000381.57.fna -queryname NZ_AXVC010000381.57
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000381.57.fna -queryname NZ_AXVC010000381.57
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000381.57.fna -queryname NZ_AXVC010000381.57
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000261.58.fna -queryname NZ_AXVC010000261.58
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000261.58.fna -queryname NZ_AXVC010000261.58
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000261.58.fna -queryname NZ_AXVC010000261.58
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000191.5.fna -queryname NZ_ACLR010000191.5
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000191.5.fna -queryname NZ_ACLR010000191.5
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000191.5.fna -queryname NZ_ACLR010000191.5
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000191.5.AOI.fna -queryname NZ_ACLR010000191.5
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000191.5.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000191.5.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -queryname NZ_ACLR010000191.5
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -table NZ_ACLR010000191.5.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000241.59.fna -queryname NZ_AXVC010000241.59
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000241.59.fna -queryname NZ_AXVC010000241.59
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000241.59.fna -queryname NZ_AXVC010000241.59
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000281.60.fna -queryname NZ_AXVC010000281.60
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000281.60.fna -queryname NZ_AXVC010000281.60
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000281.60.fna -queryname NZ_AXVC010000281.60
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_KI5353091.61.fna -queryname NZ_KI5353091.61
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_KI5353091.61.fna -queryname NZ_KI5353091.61
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_KI5353091.61.fna -queryname NZ_KI5353091.61
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_KI5353091.61.AOI.fna -queryname NZ_KI5353091.61
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_KI5353091.61.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_KI5353091.61.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -queryname NZ_KI5353091.61
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -table NZ_KI5353091.61.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000341.62.fna -queryname NZ_AXVC010000341.62
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000341.62.fna -queryname NZ_AXVC010000341.62
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000341.62.fna -queryname NZ_AXVC010000341.62
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000221.63.fna -queryname NZ_AXVC010000221.63
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000221.63.fna -queryname NZ_AXVC010000221.63
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000221.63.fna -queryname NZ_AXVC010000221.63
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000211.64.fna -queryname NZ_AXVC010000211.64
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000211.64.fna -queryname NZ_AXVC010000211.64
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000211.64.fna -queryname NZ_AXVC010000211.64
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_KI5353101.65.fna -queryname NZ_KI5353101.65
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_KI5353101.65.fna -queryname NZ_KI5353101.65
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_KI5353101.65.fna -queryname NZ_KI5353101.65
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000271.66.fna -queryname NZ_AXVC010000271.66
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000271.66.fna -queryname NZ_AXVC010000271.66
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000271.66.fna -queryname NZ_AXVC010000271.66
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000181.67.fna -queryname NZ_AXVC010000181.67
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000181.67.fna -queryname NZ_AXVC010000181.67
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000181.67.fna -queryname NZ_AXVC010000181.67
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000331.68.fna -queryname NZ_AXVC010000331.68
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000331.68.fna -queryname NZ_AXVC010000331.68
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000331.68.fna -queryname NZ_AXVC010000331.68
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000541.6.fna -queryname NZ_ACLR010000541.6
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000541.6.fna -queryname NZ_ACLR010000541.6
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010000541.6.fna -queryname NZ_ACLR010000541.6
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_KI5353071.69.fna -queryname NZ_KI5353071.69
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_KI5353071.69.fna -queryname NZ_KI5353071.69
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_KI5353071.69.fna -queryname NZ_KI5353071.69
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000371.70.fna -queryname NZ_AXVC010000371.70
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000371.70.fna -queryname NZ_AXVC010000371.70
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000371.70.fna -queryname NZ_AXVC010000371.70
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000311.71.fna -queryname NZ_AXVC010000311.71
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000311.71.fna -queryname NZ_AXVC010000311.71
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000311.71.fna -queryname NZ_AXVC010000311.71
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000251.72.fna -queryname NZ_AXVC010000251.72
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000251.72.fna -queryname NZ_AXVC010000251.72
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_AXVC010000251.72.fna -queryname NZ_AXVC010000251.72
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001521.7.fna -queryname NZ_ACLR010001521.7
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001521.7.fna -queryname NZ_ACLR010001521.7
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001521.7.fna -queryname NZ_ACLR010001521.7
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001111.8.fna -queryname NZ_ACLR010001111.8
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001111.8.fna -queryname NZ_ACLR010001111.8
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result/NZ_ACLR010001111.8.fna -queryname NZ_ACLR010001111.8
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_uenonis.result