/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000171.0.fna -queryname NZ_JQZX010000171.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000171.0.fna -queryname NZ_JQZX010000171.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000171.0.fna -queryname NZ_JQZX010000171.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000091.9.fna -queryname NZ_JQZX010000091.9
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000091.9.fna -queryname NZ_JQZX010000091.9
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000091.9.fna -queryname NZ_JQZX010000091.9
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000121.10.fna -queryname NZ_JQZX010000121.10
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000121.10.fna -queryname NZ_JQZX010000121.10
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000121.10.fna -queryname NZ_JQZX010000121.10
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000211.11.fna -queryname NZ_JQZX010000211.11
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000211.11.fna -queryname NZ_JQZX010000211.11
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000211.11.fna -queryname NZ_JQZX010000211.11
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000151.12.fna -queryname NZ_JQZX010000151.12
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000151.12.fna -queryname NZ_JQZX010000151.12
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000151.12.fna -queryname NZ_JQZX010000151.12
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000081.13.fna -queryname NZ_JQZV010000081.13
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000081.13.fna -queryname NZ_JQZV010000081.13
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000081.13.fna -queryname NZ_JQZV010000081.13
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000051.14.fna -queryname NZ_JQZV010000051.14
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000051.14.fna -queryname NZ_JQZV010000051.14
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000051.14.fna -queryname NZ_JQZV010000051.14
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000091.15.fna -queryname NZ_JQZV010000091.15
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000091.15.fna -queryname NZ_JQZV010000091.15
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000091.15.fna -queryname NZ_JQZV010000091.15
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000131.16.fna -queryname NZ_JQZV010000131.16
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000131.16.fna -queryname NZ_JQZV010000131.16
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000131.16.fna -queryname NZ_JQZV010000131.16
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000031.17.fna -queryname NZ_JQZV010000031.17
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000031.17.fna -queryname NZ_JQZV010000031.17
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000031.17.fna -queryname NZ_JQZV010000031.17
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000141.18.fna -queryname NZ_JQZV010000141.18
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000141.18.fna -queryname NZ_JQZV010000141.18
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000141.18.fna -queryname NZ_JQZV010000141.18
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000071.1.fna -queryname NZ_JQZX010000071.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000071.1.fna -queryname NZ_JQZX010000071.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000071.1.fna -queryname NZ_JQZX010000071.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000041.19.fna -queryname NZ_JQZV010000041.19
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000041.19.fna -queryname NZ_JQZV010000041.19
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000041.19.fna -queryname NZ_JQZV010000041.19
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000101.20.fna -queryname NZ_JQZV010000101.20
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000101.20.fna -queryname NZ_JQZV010000101.20
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000101.20.fna -queryname NZ_JQZV010000101.20
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000011.21.fna -queryname NZ_JQZV010000011.21
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000011.21.fna -queryname NZ_JQZV010000011.21
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000011.21.fna -queryname NZ_JQZV010000011.21
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000061.22.fna -queryname NZ_JQZV010000061.22
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000061.22.fna -queryname NZ_JQZV010000061.22
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000061.22.fna -queryname NZ_JQZV010000061.22
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000061.22.AOI.fna -queryname NZ_JQZV010000061.22
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000061.22.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZV010000061.22.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -queryname NZ_JQZV010000061.22
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -table NZ_JQZV010000061.22.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000021.2.fna -queryname NZ_JQZX010000021.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000021.2.fna -queryname NZ_JQZX010000021.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000021.2.fna -queryname NZ_JQZX010000021.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000081.3.fna -queryname NZ_JQZX010000081.3
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000081.3.fna -queryname NZ_JQZX010000081.3
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000081.3.fna -queryname NZ_JQZX010000081.3
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000131.4.fna -queryname NZ_JQZX010000131.4
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000131.4.fna -queryname NZ_JQZX010000131.4
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000131.4.fna -queryname NZ_JQZX010000131.4
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000191.5.fna -queryname NZ_JQZX010000191.5
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000191.5.fna -queryname NZ_JQZX010000191.5
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000191.5.fna -queryname NZ_JQZX010000191.5
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000061.6.fna -queryname NZ_JQZX010000061.6
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000061.6.fna -queryname NZ_JQZX010000061.6
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000061.6.fna -queryname NZ_JQZX010000061.6
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000061.6.AOI.fna -queryname NZ_JQZX010000061.6
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000061.6.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000061.6.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -queryname NZ_JQZX010000061.6
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -table NZ_JQZX010000061.6.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000031.7.fna -queryname NZ_JQZX010000031.7
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000031.7.fna -queryname NZ_JQZX010000031.7
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000031.7.fna -queryname NZ_JQZX010000031.7
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000051.8.fna -queryname NZ_JQZX010000051.8
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000051.8.fna -queryname NZ_JQZX010000051.8
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result/NZ_JQZX010000051.8.fna -queryname NZ_JQZX010000051.8
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Porphyromonadaceae/Porphyromonas_canoris.result