/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_CP0154022.0.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000041.114.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000041.114.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000041.114.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000041.114.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000041.114.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000041.114.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000101.11.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000101.11.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000101.11.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000101.11.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000101.11.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000101.11.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000131.121.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000131.121.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000131.121.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000131.121.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000131.121.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000131.121.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000201.142.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000201.142.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000201.142.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000201.142.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000201.142.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000201.142.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000201.142.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000201.142.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000201.142.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000201.142.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000201.142.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000201.142.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000201.142.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000201.142.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000201.142.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000201.142.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000201.142.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000201.142.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000191.156.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000191.156.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000191.156.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000191.156.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000191.156.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000191.156.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000371.179.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000371.179.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000371.179.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000371.179.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000371.179.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000371.179.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000371.179.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000371.179.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000371.179.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000371.179.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000371.179.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000371.179.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000041.19.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000041.19.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000041.19.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000041.19.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000041.19.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000041.19.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000091.205.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000091.205.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000091.205.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000091.205.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000091.205.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEE010000091.205.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000111.264.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000111.264.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000111.264.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000111.264.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000111.264.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000111.264.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000111.264.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000111.264.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000111.264.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000111.264.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000111.264.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000111.264.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000111.264.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000111.264.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000111.264.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000111.264.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000111.264.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000111.264.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000061.265.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000061.265.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000061.265.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000061.265.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000061.265.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000061.265.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000421.280.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000421.280.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000421.280.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000421.280.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000421.280.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000421.280.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000021.28.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000021.28.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000021.28.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000021.28.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000021.28.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000021.28.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000501.29.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000501.29.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000501.29.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000501.29.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000501.29.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000501.29.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000461.309.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000461.309.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000461.309.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000461.309.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000461.309.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000461.309.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000461.309.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000461.309.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000461.309.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000461.309.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000461.309.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBW010000461.309.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000681.434.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000681.434.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000681.434.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000681.434.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000681.434.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000681.434.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000081.481.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000081.481.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000081.481.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000081.481.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000081.481.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000081.481.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000901.502.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000901.502.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000901.502.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000901.502.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000901.502.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000901.502.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000901.502.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000901.502.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000901.502.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000901.502.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000901.502.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000901.502.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000031.555.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000031.555.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000031.555.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000031.555.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000031.555.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUED010000031.555.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000451.596.PF04738.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF04738.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000451.596.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000451.596.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000451.596.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000451.596.lanl.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/lanl.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000451.596.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000451.596.PF13575.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF13575.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000451.596.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000091.61.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000091.61.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000091.61.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000091.61.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000091.61.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUEC010000091.61.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000061.620.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000061.620.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000061.620.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000061.620.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000061.620.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000061.620.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000021.638.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000021.638.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000021.638.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000021.638.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000021.638.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000021.638.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000051.641.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000051.641.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000051.641.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000051.641.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000051.641.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000051.641.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000051.641.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000051.641.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000051.641.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000051.641.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000051.641.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000051.641.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000171.642.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000171.642.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000171.642.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000171.642.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000171.642.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRVL010000171.642.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000051.662.PF04738.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF04738.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000051.662.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000051.662.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000051.662.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000051.662.PF13575.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF13575.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000051.662.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000051.662.lanl.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/lanl.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000051.662.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000021.684.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000021.684.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000021.684.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000021.684.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000021.684.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000021.684.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000021.684.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000021.684.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000021.684.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000021.684.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000021.684.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000021.684.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000021.684.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000021.684.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000021.684.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000021.684.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000021.684.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000021.684.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000681.693.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000681.693.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000681.693.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000681.693.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000681.693.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000681.693.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000011.700.lanl.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/lanl.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000011.700.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000011.700.PF04738.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF04738.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000011.700.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000011.700.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000011.700.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000011.700.PF13575.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF13575.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000011.700.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000461.722.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000461.722.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000461.722.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000461.722.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000461.722.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000461.722.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000121.728.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000121.728.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000121.728.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000121.728.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000121.728.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_SRYD010000121.728.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000881.763.PF04738.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF04738.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000881.763.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000881.763.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000881.763.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000881.763.lanl.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/lanl.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000881.763.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000881.763.PF13575.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF13575.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000881.763.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000061.771.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000061.771.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000061.771.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000061.771.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000061.771.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000061.771.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000021.77.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000021.77.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000021.77.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000021.77.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000021.77.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000021.77.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000691.780.PF04738.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF04738.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000691.780.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000691.780.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000691.780.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000691.780.lanl.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/lanl.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000691.780.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000691.780.PF13575.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF13575.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000691.780.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000091.80.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000091.80.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000091.80.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000091.80.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000091.80.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000091.80.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000091.80.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000091.80.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000091.80.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000091.80.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000091.80.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_PUBV010000091.80.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000401.825.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000401.825.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000401.825.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000401.825.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000401.825.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000401.825.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000401.825.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000401.825.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000401.825.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000401.825.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000401.825.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000401.825.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000151.828.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000151.828.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000151.828.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000151.828.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000151.828.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000151.828.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000011.836.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000011.836.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000011.836.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000011.836.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000011.836.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000011.836.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000011.836.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000011.836.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000011.836.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000011.836.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000011.836.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/NZ_WVUM010000011.836.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Muribaculaceae//Muribaculaceae.result/logfile.txt
